目的:利用條件性錯誤發(fā)現(xiàn)率(condFDR)和聯(lián)合條件性錯誤發(fā)現(xiàn)率(conjFDR)分析方法,對抑郁癥和失眠癥的全基因組關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,識別并鑒定抑郁癥和失眠癥顯著關(guān)聯(lián)的多效性遺傳變異位點(diǎn),發(fā)掘兩者之間共同的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。方法:對來自公開數(shù)據(jù)庫的全基因組關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,其中抑郁癥全基因組關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)來自精神疾病遺傳學(xué)聯(lián)盟(PGC),共包含246363例抑郁癥患者和561190例正常對照,失眠癥全基因組關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)來自睡眠障礙知識門戶,共包含1331010例受試者。分析流程包括:(1)通過構(gòu)建不同閾值下的條件性分位圖,全基因組范圍內(nèi)比較抑郁癥和失眠癥重疊單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)程度,評估兩種疾病之間遺傳多效性位點(diǎn)的富集程度;(2)分別以抑郁癥和失眠癥為參考條件,利用條件性錯誤發(fā)現(xiàn)率分析方法,計(jì)算另外一種疾病的關(guān)聯(lián)程度,以發(fā)現(xiàn)兩種疾病的易感位點(diǎn),并采用通路富集分析檢驗(yàn)易感位點(diǎn)的生物學(xué)功能;(3)利用聯(lián)合條件性錯誤發(fā)現(xiàn)率分析方法,鑒定與抑郁癥和失眠癥同時顯著關(guān)聯(lián)的多效性遺傳位點(diǎn),并對所發(fā)現(xiàn)的易感位點(diǎn)進(jìn)行染色體位置和所在基因進(jìn)行注釋。同時,采用基因功能注釋和通路分析方法,進(jìn)一步探索所發(fā)現(xiàn)的易感位...

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1技術(shù)路線圖

濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文19眠癥相關(guān)聯(lián)的多效基因進(jìn)行注釋，我們使用(GeneOnotology，GO)進(jìn)行通路分析，GO映射網(wǎng)絡(luò)能將識別的特定基因在生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)圖中位置標(biāo)記出來[29]。通過基因功能注釋和通路分析從分子功能類別、所發(fā)生的細(xì)胞位置和生物過程這三個主要方面進(jìn)行結(jié)果呈....

圖2以失眠癥為條件抑郁癥的分層條件分位圖

濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文41附錄圖2以失眠癥為條件抑郁癥的分層條件分位圖圖3以失眠癥為條件抑郁癥的分層富集圖

圖3以失眠癥為條件抑郁癥的分層富集圖

濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文41附錄圖2以失眠癥為條件抑郁癥的分層條件分位圖圖3以失眠癥為條件抑郁癥的分層富集圖

圖4以抑郁癥為條件失眠癥的分層條件分位圖

濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文42圖4以抑郁癥為條件失眠癥的分層條件分位圖圖5以抑郁癥為條件失眠癥的分層富集圖

本文編號：3914439