精神分裂癥患者外周血單核細胞差異表達circRNA研究
發(fā)布時間:2021-12-19 11:41
背景:精神分裂癥(schizophrenia,SZ)是一種嚴重的神經(jīng)精神疾病。臨床特征主要是以幻覺、妄想和精神運動性興奮等為主的陽性癥狀和(或)以情感淡漠、情感遲鈍、社交退縮、意志減退等為主的陰性癥狀。精神分裂癥時點患病率約1%,終身患病率略高于時點患病率。盡管新技術(shù)發(fā)展提高了人們對精神分裂癥的認識,但其病因和發(fā)病機制仍不清楚。目前,精神分裂癥的診斷主要依靠臨床醫(yī)師的精神訪談和檢查,尚未找到有效的客觀診斷指標。這種根據(jù)現(xiàn)象學(xué)診斷的綜合征在病因、病理機制和治療反應(yīng)的生物特性方面可能存在較大差異,因此尋找敏感和特異的生物標志物,提高SZ診斷的生物學(xué)同質(zhì)性已成為目前研究熱點。研究顯示,ncRNA以表觀遺傳修飾的方式在生物學(xué)調(diào)控中發(fā)揮重要作用。circRNA是一種具有環(huán)形特征的真核RNA,能夠抵抗RNase R的降解,在人類基因表達中發(fā)揮著多種生物功能。它在哺乳動物腦內(nèi)尤其豐富,參與了包括突觸可塑性在內(nèi)的多個生物學(xué)過程,可能在精神障礙中發(fā)揮作用。且circRNA具備作為理想生物標志物的特點:性質(zhì)穩(wěn)定、不易酶解、采集測量方便等。此外,中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)疾病多呈現(xiàn)一定程度的血腦屏障受損,導(dǎo)致小...
【文章來源】:南京醫(yī)科大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
原始數(shù)據(jù)標準化后的Box-Plot圖
圖1-1 原始數(shù)據(jù)標準化后的Box-Plot圖觀評估circRNAs在兩組樣本間的表達差異,X軸值(log2形式),綠線表示倍數(shù)變化值(FC值)域內(nèi)的基因代表兩組間差異表達基因。見圖1-2
Y 軸表示 P 值以 10 為底取負對數(shù)的值。圖中紅點代表的是組間差異檢驗獲得的異常表達 circRNA。篩選標準為 Fold change 值>=1.5 且 P 值<0.05。圖1-3 組間(SZ組與HC組)差異表達circRNAs的火山圖右上象限為上調(diào)幅度大于等于1.5倍而P值小于0.05的circRNAs,共6個;左上象限為下調(diào)幅度大于1.5倍以上而P值小于等于0.05的circRNAs,共3個。共計9個差異性表達的ircRNAs。(3)差異表達circRNAs的非監(jiān)督層次聚類分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Long Non-coding RNAs in the Cytoplasm[J]. Farooq Rashid,Abdullah Shah,Ge Shan. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(02)
[2]Biomarkers in schizophrenia:A focus on blood based diagnostics and theranostics[J]. Chi-Yu Lai,Elizabeth Scarr,Madhara Udawela,Ian Everall,Wei J Chen,Brian Dean. World Journal of Psychiatry. 2016(01)
本文編號:3544355
【文章來源】:南京醫(yī)科大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
原始數(shù)據(jù)標準化后的Box-Plot圖
圖1-1 原始數(shù)據(jù)標準化后的Box-Plot圖觀評估circRNAs在兩組樣本間的表達差異,X軸值(log2形式),綠線表示倍數(shù)變化值(FC值)域內(nèi)的基因代表兩組間差異表達基因。見圖1-2
Y 軸表示 P 值以 10 為底取負對數(shù)的值。圖中紅點代表的是組間差異檢驗獲得的異常表達 circRNA。篩選標準為 Fold change 值>=1.5 且 P 值<0.05。圖1-3 組間(SZ組與HC組)差異表達circRNAs的火山圖右上象限為上調(diào)幅度大于等于1.5倍而P值小于0.05的circRNAs,共6個;左上象限為下調(diào)幅度大于1.5倍以上而P值小于等于0.05的circRNAs,共3個。共計9個差異性表達的ircRNAs。(3)差異表達circRNAs的非監(jiān)督層次聚類分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Long Non-coding RNAs in the Cytoplasm[J]. Farooq Rashid,Abdullah Shah,Ge Shan. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(02)
[2]Biomarkers in schizophrenia:A focus on blood based diagnostics and theranostics[J]. Chi-Yu Lai,Elizabeth Scarr,Madhara Udawela,Ian Everall,Wei J Chen,Brian Dean. World Journal of Psychiatry. 2016(01)
本文編號:3544355
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