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基于高通量芯片分析早發(fā)性精神分裂癥差異表達(dá)基因

發(fā)布時間:2021-11-23 19:33
  目的比較早發(fā)性精神分裂癥與健康人群之間基因表達(dá)差異,探究精神分裂癥發(fā)病機制。方法 GEO數(shù)據(jù)庫獲取基因芯片數(shù)據(jù),通過R工具進(jìn)行差異表達(dá)基因分析,使用DAVID工具進(jìn)行GO富集和通路分析,利用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果鑒定到314個顯著差異表達(dá)基因,包括221個顯著上調(diào)控基因和93個顯著下調(diào)控基因,基因本體GO顯著富集到20個條目,主要涉及g蛋白偶聯(lián)受體信號通路,嗅覺感知,磷脂酰絲氨酸酰鏈重構(gòu),磷脂代謝過程,鈉離子通道調(diào)控激活,神經(jīng)肽綁定等。KEGG通路顯著富集結(jié)果主要涉及嗅覺信號傳導(dǎo),醚脂類代謝,長期抑制(LTD),甲狀腺激素合成等6個通路。蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析獲得5個核心基因,模塊分析結(jié)果顯示得分最高的模塊主要與神經(jīng)肽綁定和刺激神經(jīng)組織配體受體交互信號通路相關(guān)。結(jié)論通過生物信息學(xué)方法獲得了早發(fā)性精神分裂癥與健康人的差異表達(dá)基因,闡釋了早發(fā)性精神分裂癥發(fā)病機制的相關(guān)基因及其表達(dá)特征,為早發(fā)性精神分裂癥的診斷和治療提供理論基礎(chǔ)。 

【文章來源】:貴州醫(yī)藥. 2020,44(05)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【文章目錄】:
1 資料和方法
    1.1 數(shù)據(jù)下載與處理
    1.2 差異表達(dá)基因
    1.3 GO和Pathway功能富集分析
    1.4 蛋白網(wǎng)絡(luò)互作分析
2 結(jié) 果
    2.1 數(shù)據(jù)處理
    2.2 差異表達(dá)基因分析
    2.3 GO功能富集
    2.4 Pathway通路分析
    2.5 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
3 討 論



本文編號:3514516

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