阿爾茨海默癥Ch4腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)的識別與分析
發(fā)布時間:2021-08-26 13:37
阿爾茨海默癥(Alzheimer’s disease,AD)是一種常見的神經(jīng)退行性疾病,嚴(yán)重影響患者的日常生活。全基因組關(guān)聯(lián)性分析技術(shù)發(fā)現(xiàn)許多與AD相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn),但是每個變異位點(diǎn)的作用比較微弱。多基因風(fēng)險評分方法是用來定量地刻畫遺傳變異位點(diǎn)的綜合效應(yīng)。另一方面,AD患者的大腦結(jié)構(gòu)或者功能發(fā)生了變化,位于基底前腦的Ch4腦區(qū)中的膽堿能神經(jīng)元發(fā)生了嚴(yán)重的丟失。在本文中,利用多基因風(fēng)險評分的方法識別與Ch4腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)Ch4腦區(qū)體積在AD患者和正常樣本中存在顯著差異(P<2.2×10-16),而顱內(nèi)總體積在兩組樣本中不存在差異(P=0.8633);29631個遺傳變異位點(diǎn)的多基因風(fēng)險評分與患病風(fēng)險顯著相關(guān)(P=1.6×10-11),并能夠解釋25.81%的AD風(fēng)險,多基因風(fēng)險評分越高,患病的風(fēng)險越大;基于9536個遺傳變異位點(diǎn)的多基因風(fēng)險評分與Ch4腦區(qū)體積顯著相關(guān)(P=5.1×10-13),并能夠解釋17.11%的Ch4腦區(qū)體積差異,多基因風(fēng)險評分越高,Ch4腦區(qū)體積越小;此外,多基因風(fēng)險評分...
【文章來源】:哈爾濱工業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
正常人和AD患者大腦結(jié)構(gòu)對比圖
圖 1-2 Ch4 腦區(qū)的示意圖通過開展生化實(shí)驗(yàn)來確定與 Ch4 腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)是最有效、最可信的。但是生化實(shí)驗(yàn)通常難度大,周期長且成本昂貴,并且實(shí)驗(yàn)參與者是人類,因此開展生化試驗(yàn)顯然是不現(xiàn)實(shí)的。本文中,采用生物信息學(xué)的方法試圖尋找與 Ch4腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)。希望據(jù)此能夠理解疾病產(chǎn)生的機(jī)制,為預(yù)防、治療 AD提供一個新的思路,并最終服務(wù)于人類的健康。1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀由于 AD 病理的復(fù)雜性,目前科學(xué)家們還沒有徹底搞明白 AD 的發(fā)病機(jī)制。于是存在以下幾種AD的發(fā)病機(jī)制假說,目前比較公認(rèn)的是淀粉樣蛋白假說和Tau蛋白假說。膽堿能假說認(rèn)為神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿合成減少會導(dǎo)致 AD 發(fā)病,是目前大多數(shù)藥物治療的依據(jù)[36]。因?yàn)橛糜谥委熞阴D憠A缺乏癥的藥物并不是非常有效,膽堿能假說目前沒有得到大量的認(rèn)可[37]。第二個是淀粉樣蛋白假說。淀粉樣蛋白假說推測細(xì)胞外淀粉樣蛋白A 沉積是
課題研究的技術(shù)路線圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]阿爾茲海默癥fMRI信號復(fù)雜度分析[J]. 牛焱,王彬,相潔,李聰改,周夢妮,李婷. 太原理工大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
[2]BRCA1相關(guān)A蛋白復(fù)合物基因單核苷酸多態(tài)性與三陰性乳腺癌易感性研究[J]. 凌泓,胡欣. 中國癌癥雜志. 2016(11)
[3]Meynert基底核與認(rèn)知[J]. 謝祎,肖勁松,章軍建. 國際神經(jīng)病學(xué)神經(jīng)外科學(xué)雜志. 2015(04)
[4]VBM-DARTEL方法在阿爾茨海默癥MRI圖像分析中的應(yīng)用[J]. 周珂,蔡潔,熊剛強(qiáng). 計算機(jī)應(yīng)用與軟件. 2014(03)
[5]基于高分辨率MRI的正常中國成人杏仁核體積測量[J]. 潘克梫,陳楠,王星,李坤成,周馨,卓彥. 中國醫(yī)療設(shè)備. 2009(02)
[6]現(xiàn)代醫(yī)學(xué)工程的發(fā)展[J]. 陳亞珠. 上海電機(jī)學(xué)院學(xué)報. 2007(01)
[7]PET受體顯像的研究應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王榮福,劉紅潔,張春麗. 中國醫(yī)學(xué)影像技術(shù). 2006(10)
[8]基底前腦結(jié)構(gòu)和功能概述[J]. 劉巧瓊,李光武,趙樂章. 神經(jīng)解剖學(xué)雜志. 2005(06)
[9]T1WI-3D-MP RAGE在腦掃描中的價值[J]. 陳楠,秦文,李坤成. 中國醫(yī)學(xué)影像技術(shù). 2005(06)
博士論文
[1]中國南方水稻紋枯菌和稻瘟菌種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 王玲.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[2]轉(zhuǎn)錄組測序鑒定EB病毒相關(guān)胃癌差異表達(dá)基因及基因多態(tài)性的研究[D]. 劉術(shù)臻.青島大學(xué) 2015
[3]宿主單核苷酸多態(tài)性及血漿miRNA與結(jié)核病易感性的分子流行病學(xué)研究[D]. 楊羽.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
[4]去乙酰化酶SIRT1基因表達(dá)及其多態(tài)性與冠心病的關(guān)聯(lián)研究和Chr6p21.32區(qū)域SNP rs9268402與冠心病發(fā)病機(jī)制的探索[D]. 胡永艷.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
[5]胰腺癌與環(huán)境、疾病、心理行為因素病例對照研究以及相關(guān)遺傳易感性研究初探[D]. 姚堯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2013
[6]脂聯(lián)素及其受體基因多態(tài)性與缺血性腦卒中的相關(guān)性研究[D]. 劉芳.中國醫(yī)科大學(xué) 2010
[7]子宮內(nèi)膜雌激素受體β基因多態(tài)性及表達(dá)與原因不明月經(jīng)過少關(guān)系的探討[D]. 樂愛文.重慶醫(yī)科大學(xué) 2008
[8]牙髓冷刺激痛及牙痛期待的功能性磁共振成像研究[D]. 陳琰.中國人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2005
碩士論文
[1]基于SVM和結(jié)構(gòu)性MRI數(shù)據(jù)的AD病程分類研究[D]. 楊亞超.山西醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]CD33基因變異對健康對照和輕度認(rèn)知障礙海馬結(jié)構(gòu)萎縮率的相關(guān)性研究[D]. 王文英.青島大學(xué) 2016
[3]枹櫟和短柄枹櫟的居群遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理學(xué)研究[D]. 王雁紅.西北大學(xué) 2015
[4]COMT基因多態(tài)性對腦結(jié)構(gòu)及功能調(diào)控的多模態(tài)MRI研究[D]. 田甜.天津醫(yī)科大學(xué) 2014
[5]SNP致病因素在疾病診斷上的應(yīng)用研究[D]. 譚芳慧.西安電子科技大學(xué) 2014
[6]TANK基因多態(tài)性與漢族人群HBV感染臨床轉(zhuǎn)歸的關(guān)聯(lián)性研究[D]. 宋起龍.華中科技大學(xué) 2012
[7]大鼠肝再生中脂肪滴蛋白質(zhì)組的差異分析[D]. 張一甫.復(fù)旦大學(xué) 2010
[8]雙苯氟嗪對原代培養(yǎng)胎鼠海馬神經(jīng)元的保護(hù)作用[D]. 薛健梅.河北醫(yī)科大學(xué) 2004
本文編號:3364339
【文章來源】:哈爾濱工業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
正常人和AD患者大腦結(jié)構(gòu)對比圖
圖 1-2 Ch4 腦區(qū)的示意圖通過開展生化實(shí)驗(yàn)來確定與 Ch4 腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)是最有效、最可信的。但是生化實(shí)驗(yàn)通常難度大,周期長且成本昂貴,并且實(shí)驗(yàn)參與者是人類,因此開展生化試驗(yàn)顯然是不現(xiàn)實(shí)的。本文中,采用生物信息學(xué)的方法試圖尋找與 Ch4腦區(qū)相關(guān)的遺傳變異位點(diǎn)。希望據(jù)此能夠理解疾病產(chǎn)生的機(jī)制,為預(yù)防、治療 AD提供一個新的思路,并最終服務(wù)于人類的健康。1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀由于 AD 病理的復(fù)雜性,目前科學(xué)家們還沒有徹底搞明白 AD 的發(fā)病機(jī)制。于是存在以下幾種AD的發(fā)病機(jī)制假說,目前比較公認(rèn)的是淀粉樣蛋白假說和Tau蛋白假說。膽堿能假說認(rèn)為神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿合成減少會導(dǎo)致 AD 發(fā)病,是目前大多數(shù)藥物治療的依據(jù)[36]。因?yàn)橛糜谥委熞阴D憠A缺乏癥的藥物并不是非常有效,膽堿能假說目前沒有得到大量的認(rèn)可[37]。第二個是淀粉樣蛋白假說。淀粉樣蛋白假說推測細(xì)胞外淀粉樣蛋白A 沉積是
課題研究的技術(shù)路線圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]阿爾茲海默癥fMRI信號復(fù)雜度分析[J]. 牛焱,王彬,相潔,李聰改,周夢妮,李婷. 太原理工大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
[2]BRCA1相關(guān)A蛋白復(fù)合物基因單核苷酸多態(tài)性與三陰性乳腺癌易感性研究[J]. 凌泓,胡欣. 中國癌癥雜志. 2016(11)
[3]Meynert基底核與認(rèn)知[J]. 謝祎,肖勁松,章軍建. 國際神經(jīng)病學(xué)神經(jīng)外科學(xué)雜志. 2015(04)
[4]VBM-DARTEL方法在阿爾茨海默癥MRI圖像分析中的應(yīng)用[J]. 周珂,蔡潔,熊剛強(qiáng). 計算機(jī)應(yīng)用與軟件. 2014(03)
[5]基于高分辨率MRI的正常中國成人杏仁核體積測量[J]. 潘克梫,陳楠,王星,李坤成,周馨,卓彥. 中國醫(yī)療設(shè)備. 2009(02)
[6]現(xiàn)代醫(yī)學(xué)工程的發(fā)展[J]. 陳亞珠. 上海電機(jī)學(xué)院學(xué)報. 2007(01)
[7]PET受體顯像的研究應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王榮福,劉紅潔,張春麗. 中國醫(yī)學(xué)影像技術(shù). 2006(10)
[8]基底前腦結(jié)構(gòu)和功能概述[J]. 劉巧瓊,李光武,趙樂章. 神經(jīng)解剖學(xué)雜志. 2005(06)
[9]T1WI-3D-MP RAGE在腦掃描中的價值[J]. 陳楠,秦文,李坤成. 中國醫(yī)學(xué)影像技術(shù). 2005(06)
博士論文
[1]中國南方水稻紋枯菌和稻瘟菌種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 王玲.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[2]轉(zhuǎn)錄組測序鑒定EB病毒相關(guān)胃癌差異表達(dá)基因及基因多態(tài)性的研究[D]. 劉術(shù)臻.青島大學(xué) 2015
[3]宿主單核苷酸多態(tài)性及血漿miRNA與結(jié)核病易感性的分子流行病學(xué)研究[D]. 楊羽.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
[4]去乙酰化酶SIRT1基因表達(dá)及其多態(tài)性與冠心病的關(guān)聯(lián)研究和Chr6p21.32區(qū)域SNP rs9268402與冠心病發(fā)病機(jī)制的探索[D]. 胡永艷.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
[5]胰腺癌與環(huán)境、疾病、心理行為因素病例對照研究以及相關(guān)遺傳易感性研究初探[D]. 姚堯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2013
[6]脂聯(lián)素及其受體基因多態(tài)性與缺血性腦卒中的相關(guān)性研究[D]. 劉芳.中國醫(yī)科大學(xué) 2010
[7]子宮內(nèi)膜雌激素受體β基因多態(tài)性及表達(dá)與原因不明月經(jīng)過少關(guān)系的探討[D]. 樂愛文.重慶醫(yī)科大學(xué) 2008
[8]牙髓冷刺激痛及牙痛期待的功能性磁共振成像研究[D]. 陳琰.中國人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2005
碩士論文
[1]基于SVM和結(jié)構(gòu)性MRI數(shù)據(jù)的AD病程分類研究[D]. 楊亞超.山西醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]CD33基因變異對健康對照和輕度認(rèn)知障礙海馬結(jié)構(gòu)萎縮率的相關(guān)性研究[D]. 王文英.青島大學(xué) 2016
[3]枹櫟和短柄枹櫟的居群遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理學(xué)研究[D]. 王雁紅.西北大學(xué) 2015
[4]COMT基因多態(tài)性對腦結(jié)構(gòu)及功能調(diào)控的多模態(tài)MRI研究[D]. 田甜.天津醫(yī)科大學(xué) 2014
[5]SNP致病因素在疾病診斷上的應(yīng)用研究[D]. 譚芳慧.西安電子科技大學(xué) 2014
[6]TANK基因多態(tài)性與漢族人群HBV感染臨床轉(zhuǎn)歸的關(guān)聯(lián)性研究[D]. 宋起龍.華中科技大學(xué) 2012
[7]大鼠肝再生中脂肪滴蛋白質(zhì)組的差異分析[D]. 張一甫.復(fù)旦大學(xué) 2010
[8]雙苯氟嗪對原代培養(yǎng)胎鼠海馬神經(jīng)元的保護(hù)作用[D]. 薛健梅.河北醫(yī)科大學(xué) 2004
本文編號:3364339
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