實(shí)驗(yàn)?zāi)康?阿爾茨海默�。ˋlzheimer’s disease,AD）是一種慢性進(jìn)行性神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病。近年來,隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)患者腦內(nèi)的慢性神經(jīng)炎癥對發(fā)病機(jī)制及疾病進(jìn)展至關(guān)重要。TIPE2,即腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)蛋白8-2（Tumornecrosis factor-α-induced protein-8-like 2,TNFAIP8L2）,一種新免疫負(fù)性調(diào)控蛋白,在APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠海馬內(nèi)高表達(dá)TIPE2可以改善認(rèn)知功能障礙,然而高表達(dá)TIPE2后m RNA表達(dá)譜變化及認(rèn)知改善的分子作用機(jī)制尚不清楚。因此,在本研究中,首先通過Y迷宮評價(jià)APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠和TIPE2高表達(dá)APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠的短期空間學(xué)習(xí)記憶功能,然后取其海馬組織進(jìn)行有參考基因組轉(zhuǎn)錄組測序（RNA sequencing,RNA-seq）并進(jìn)行基因分析,以期找出與改善認(rèn)知有關(guān)的基因和信號通路。實(shí)驗(yàn)方法:實(shí)驗(yàn)分組:（1）TIPE2高表達(dá)APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠（APP/PS1+OE）組;（2）注射空病毒載體的APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠（APP/PS1+NC）;（3）APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠（APP/PS... 

【文章來源】：青島大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定結(jié)果舉例從左至右，前3只小鼠APP、PS1基因呈陽性后果，為轉(zhuǎn)基因小鼠；后3只小鼠APP、β-actin324bp

結(jié)果17結(jié)果1APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定以鼠尾提取的DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。結(jié)果如圖1。圖1：APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定結(jié)果舉例從左至右，前3只小鼠APP、PS1基因呈陽性后果，為轉(zhuǎn)基因小鼠；后3只小鼠APP、PS1基因呈陰性結(jié)果，為野生型小鼠。兩個(gè)基因?yàn)殡p轉(zhuǎn)基因，鑒定結(jié)果相互一致，不能出現(xiàn)分離。2高表達(dá)TIPE2改善APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠認(rèn)知功能障礙測量7月齡小鼠短期空間記憶的Y迷宮自發(fā)交替試驗(yàn)表明，與WT相比，APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠的自發(fā)交替率明顯下降。在注射高表達(dá)TIPE2的腺相關(guān)病毒后的第0、1、2、3和3.5個(gè)月，我們再次采用Y迷宮對小鼠的認(rèn)知能力進(jìn)行評價(jià)。結(jié)果顯示，高表達(dá)TIPE2后，APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠的認(rèn)知缺陷顯著改善且至少持續(xù)3.5個(gè)月。圖2：AAV介導(dǎo)的TIPE2在APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠雙側(cè)海馬高表達(dá)對認(rèn)知陷的改善作用（a）小鼠腦立體定位圖譜；（b）注射AAV后的第3.5個(gè)月TIPE2在小鼠海馬內(nèi)的分布情況；（c）在APP/PS1轉(zhuǎn)基因小鼠注射AAV后的第0、1、2、3和3.5個(gè)月，用APPβ-actinPS1324bp608bp350bp

青島大學(xué)碩士學(xué)位論文聚類分析用于判斷 DEGs 在不同實(shí)驗(yàn)條件下的表達(dá)模式；在樣品間表達(dá)量相關(guān)性高的基因被歸為一類，通常這些基因在某些生物學(xué)過程，或者某個(gè)代謝、信號通路中存在實(shí)際的聯(lián)系。因此通過表達(dá)量聚類我們可以發(fā)現(xiàn)基因間未知的生物學(xué)聯(lián)系。我們使用 R 語言 Pheatmap 軟件包對所有基因和樣品進(jìn)行雙向聚類分析，根據(jù)同一基因在不同樣品中的表達(dá)水平和同一樣品中不同基因的表達(dá)模式進(jìn)行聚類，采用Euclidean 方法計(jì)算距離，層次聚類最長距離法（Complete Linkage）進(jìn)行聚類。結(jié)果見圖 3c。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Genetic targeting of astrocytes to combat neurodegenerative disease[J]. Rachel Kéry,Allen P. F. Chen,Gregory W. Kirschen.  Neural Regeneration Research. 2020(02)



本文編號：3344843