目的:探討雙相Ⅱ型障礙患者沖動攻擊行為的全基因組DNA甲基化修飾。方法:對5例有沖動攻擊行為的雙相Ⅱ型障礙患者及5例無沖動攻擊行為的雙相Ⅱ型障礙患者的全血基因組DNA采用Illumina公司的人類450K甲基化芯片技術(shù)進(jìn)行甲基化水平的分析。用R軟件對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理并篩選出樣本分組間的差異甲基化位點。最后采用GCBI在線分析軟件對差異候選基因進(jìn)行功能富集分析。結(jié)果:（1）對攻擊組與非攻擊組樣本進(jìn)行甲基化位點篩選,QC Report檢測得到各項指標(biāo)符合Illumina的質(zhì)量要求。（2）采用β值作為衡量甲基化程度的指標(biāo),攻擊組與非攻擊組所有樣本的甲基化位點beta值密度曲線趨于一致,成呈“雙峰曲線”分布。（3）采用Subset-quantile Within Array Normalisation（SWAN）算法進(jìn)行芯片內(nèi)的歸一化處理,beta值密度曲線趨于一致、分組符合實驗設(shè)計要求。（4）采用pooled t-test方法篩選組間的差異甲基化位點,攻擊組與非攻擊組樣本比較甲基化水平有差別。（5）攻擊組與非攻擊組樣本差異甲基化位點在染色體上的分布有差別。（6）按基因注釋分類和CpG島注釋... 

【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：50 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

InfiniumⅠ探針設(shè)計圖

圖 2 Infinium Ⅱ 探針設(shè)計設(shè)計圖Fig.2 II Type Infinium基化 450K 芯片大多數(shù)探針都是 Infinium Ⅱ 探表 2 甲基化 450k 的探針類型Table 2 Infinium_Design_Type

圖 3 雜交質(zhì)控圖Fig.3 Hybridization Controls合成的模板而非擴增 DNA 產(chǎn)物來檢測整個實驗的效果 5 pM，1 pM 和 0.2 pM，產(chǎn)生三個不同的信號強度�？�2(信號值)，縱軸是樣本名稱 。紅色熒光表示未甲基化位

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本文編號：3319520