基于3D-ResNet的阿爾茲海默癥分類算法研究
發(fā)布時間:2021-06-17 02:04
阿爾茲海默癥(AD)是一種不可逆的神經(jīng)退行性大腦疾病,也是老年人群中最常見的癡呆癥。人工分類阿爾茲海默癥的核磁共振影像(MRI)存在分類延遲和分類耗時等問題。隨著人口老齡化的日趨嚴(yán)重,準(zhǔn)確而快速地分類出阿爾茲海默癥患者具有重要的研究意義。將卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)技術(shù)和核磁共振成像技術(shù)相結(jié)合,設(shè)計了一個3D-ResNet算法用于AD分類,在驗證集上取得了98.39%的準(zhǔn)確性、96.74%的敏感性和99.99%的特異性,在測試集上取得了97.43%的準(zhǔn)確性、94.92%的敏感性和99.99%的特異性,每個患者的分類時間是0.23 s。此外,針對AD的發(fā)病機制尚不明確的問題,通過類激活映射(CAM)技術(shù)來可視化與AD相關(guān)的腦部區(qū)域。
【文章來源】:計算機工程與科學(xué). 2020,42(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
模型的損失函數(shù)表面
ResNet模型最先應(yīng)用于2D圖像分類,然而,對于像MRI這樣的3D醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù),空間信息在阿爾茲海默癥的分類中起著重要作用。3D深度學(xué)習(xí)模型可以從3D MRI圖像中更好地識別解剖位置和病理特征。為了充分利用3D MRI中的上下文信息,本文擴展了原始ResNet支持體積數(shù)據(jù)的能力,使用體積級3D-ResNet代替切片級2D-ResNet。具體來說,本文改進了原始ResNet模型的殘差模塊,將所有2D版本的卷積層、批量標(biāo)準(zhǔn)化層和池化層調(diào)整為3D版本的,如圖2所示,圖2a為原始的2D殘差模塊,圖2b為本文提出的3D殘差模塊。3D殘差模塊的流程如算法1所示,其中,σ表示采用激活函數(shù)進行非線性操作,BN表示歸一化操作。算法1 3D殘差模塊
本文以3D殘差模塊為基礎(chǔ),構(gòu)建了一種3D-ResNet算法用于AD分類,如圖3所示,其主要由預(yù)處理和3D-ResNet-101 2部分組成,其中101表示模型有101層。預(yù)處理部分負(fù)責(zé)將原始的166*256*256 MRI圖像分割成121*145*124的MRI灰質(zhì)圖像和121*145*121的MRI白質(zhì)圖像;3D-ResNet-101部分主要由一個7*7*7卷積層、一個3*3*3的池化層、一系列對應(yīng)不同特征通道數(shù)的3D殘差模塊和全連接層組成。3D-ResNet-101部分將預(yù)處理后的灰質(zhì)圖像和白質(zhì)圖像疊加在一起進行端到端的訓(xùn)練,其中*3,*4,*6,*3分別代表3D殘差模塊的個數(shù),并以二分類的形式給出模型的預(yù)測結(jié)果,NC和AD分別表示正常人和阿爾茲海默癥患者的分類結(jié)果。3D-ResNet算法如算法2所示。算法2 3D-ResNet算法
本文編號:3234235
【文章來源】:計算機工程與科學(xué). 2020,42(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
模型的損失函數(shù)表面
ResNet模型最先應(yīng)用于2D圖像分類,然而,對于像MRI這樣的3D醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù),空間信息在阿爾茲海默癥的分類中起著重要作用。3D深度學(xué)習(xí)模型可以從3D MRI圖像中更好地識別解剖位置和病理特征。為了充分利用3D MRI中的上下文信息,本文擴展了原始ResNet支持體積數(shù)據(jù)的能力,使用體積級3D-ResNet代替切片級2D-ResNet。具體來說,本文改進了原始ResNet模型的殘差模塊,將所有2D版本的卷積層、批量標(biāo)準(zhǔn)化層和池化層調(diào)整為3D版本的,如圖2所示,圖2a為原始的2D殘差模塊,圖2b為本文提出的3D殘差模塊。3D殘差模塊的流程如算法1所示,其中,σ表示采用激活函數(shù)進行非線性操作,BN表示歸一化操作。算法1 3D殘差模塊
本文以3D殘差模塊為基礎(chǔ),構(gòu)建了一種3D-ResNet算法用于AD分類,如圖3所示,其主要由預(yù)處理和3D-ResNet-101 2部分組成,其中101表示模型有101層。預(yù)處理部分負(fù)責(zé)將原始的166*256*256 MRI圖像分割成121*145*124的MRI灰質(zhì)圖像和121*145*121的MRI白質(zhì)圖像;3D-ResNet-101部分主要由一個7*7*7卷積層、一個3*3*3的池化層、一系列對應(yīng)不同特征通道數(shù)的3D殘差模塊和全連接層組成。3D-ResNet-101部分將預(yù)處理后的灰質(zhì)圖像和白質(zhì)圖像疊加在一起進行端到端的訓(xùn)練,其中*3,*4,*6,*3分別代表3D殘差模塊的個數(shù),并以二分類的形式給出模型的預(yù)測結(jié)果,NC和AD分別表示正常人和阿爾茲海默癥患者的分類結(jié)果。3D-ResNet算法如算法2所示。算法2 3D-ResNet算法
本文編號:3234235
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