[目的]（1）RNA-seq獲取精神分裂癥患者及健康對(duì)照者外周血mRNA及miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù),評(píng)估特定差異表達(dá)基因?qū)穹至寻Y的分類(lèi)效果,并探討差異表達(dá)基因與臨床維度之間的關(guān)聯(lián)。（2）探索外周血差異miRNA是否可以作為精神分裂癥診治的潛在生物標(biāo)志物,尋找差異miRNA表達(dá)譜與差異mRNA表達(dá)譜之間的關(guān)聯(lián)。（3）基于外周血表達(dá)譜數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者IL-1β高表達(dá),我們構(gòu)建IL-1β基因過(guò)表達(dá)細(xì)胞模型,探索其促進(jìn)精神分裂癥發(fā)病的潛在機(jī)制。（4）從蛋白層面,我們觀察精神分裂癥患者外周血表達(dá)譜數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)的潛在生物標(biāo)志物如IL-1β等在外周血清中表達(dá)是否仍存在異常,并評(píng)估血清IL-1β表達(dá)與抗精神病藥物治療應(yīng)答的相關(guān)性。[方法]（1）采用Illumina HiSeqTM 4000測(cè)序技術(shù)對(duì)50例精神分裂癥患者和50例健康對(duì)照組的外周血白細(xì)胞進(jìn)行RNA測(cè)序以獲取其mRNA表達(dá)譜信息,并采用DSM-V（臨床醫(yī)生評(píng)定的精神分裂癥癥狀嚴(yán)重程度量表）中的評(píng)分法對(duì)精神分裂癥核心癥狀的嚴(yán)重度進(jìn)行了評(píng)估,差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本（DETs）篩選采用R軟件的edgeR包,GO/KEGG pathway分析探索差異基因... 

【文章來(lái)源】：昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁(yè)數(shù)】：177 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
縮略詞表
中文摘要
Abstract
前言
    1. 精神分裂癥概述
    2. 精神分裂癥可能的病因、發(fā)病機(jī)制
    3. 本研究的目的與意義
    參考文獻(xiàn)
第一章 精神分裂癥患者外周血mRNAs表達(dá)譜的變化
    引言
    材料與方法
        1. 研究對(duì)象
        2. 倫理審查與知情同意
        3. 主要實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
        4. 外周血白細(xì)胞采集與貯存
        5. 文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
        6. 編碼RNA的差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物（DEGS）分析
        7. RNA-seq差異基因與GWAS和GSE數(shù)據(jù)集鑒定基因的比較
        8. 基于樹(shù)的分類(lèi)模型
        9. WGCNA分析
        10. 蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用（PPI網(wǎng)絡(luò)分析）
        11. RT-qPCR驗(yàn)證
    結(jié)果
        1. 精神分裂癥與健康對(duì)照者的社會(huì)人口學(xué)資料比較
        2. 精神分裂癥組與健康對(duì)照組mRNA表達(dá)譜差異分析
        3. 差異基因GO/KEGG富集分析
        4. 表達(dá)模式的聚類(lèi)熱圖分析
        5. 基于樹(shù)的分類(lèi)模型
        6. WGCNA模塊分類(lèi)
        7. 藍(lán)綠色模塊基因PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及高樞紐基因分析
        8. 基因驗(yàn)證
    本章討論
    本章結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二章 精神分裂癥患者外周血miRNAs表達(dá)譜的變化
    引言
    材料與方法
        1. 研究對(duì)象
        2. 小RNA文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
        3. 數(shù)據(jù)過(guò)濾
        4. 差異miRNA的比對(duì)與差異表達(dá)的miRNAs的鑒定
        5. 基于樹(shù)的分類(lèi)模型
        6. 差異miRNAs靶向表達(dá)基因預(yù)測(cè)及靶基因功能富集分析
        7. 差異miRNAs靶向調(diào)節(jié)基因PPI網(wǎng)絡(luò)分析
        8. 差異miRNAs與免疫相關(guān)靶基因mRNA表達(dá)譜spearman相關(guān)分析
        9 靶基因全基因組關(guān)聯(lián)分析
        10. 差異miRNAs的RT-qPCR驗(yàn)證
    結(jié)果
        1. 精神分裂癥患者外周血中差異表達(dá)的miRNAs
        2. 差異miRNAs與臨床表型的關(guān)聯(lián)
        3. 基于樹(shù)的分類(lèi)模型
        4. 差異miRNAs的靶基因預(yù)測(cè)及miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
        5. 差異miRNAs靶基因功能富集分析
        6. 差異miRNAs靶基因PPI分析
        7. 差異miRNAs與差異免疫相關(guān)靶基因mRNA表達(dá)量Spearman相關(guān)分析
        8. 靶基因全基因組關(guān)聯(lián)分析
        9. RT-qPCR驗(yàn)證
    本章討論
    本章結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第三章 IL-1β基因過(guò)表達(dá)可影響SH-SY5Y細(xì)胞模型精神分裂癥相關(guān)基因
    引言
    材料與方法
        1. 主要實(shí)驗(yàn)儀器與實(shí)驗(yàn)試劑
        2. 細(xì)胞培養(yǎng)
        3. Homo IL-1β載體構(gòu)建和慢病毒包裝
        4. 慢病毒感染與藥物篩選
        5. CCK-8實(shí)驗(yàn)
        6. RT-PCR及qPCR檢測(cè)IL-1β基因mRNA水平
        7. Western-blot檢測(cè)IL-1β蛋白表達(dá)水平
        8. IF檢測(cè)過(guò)表達(dá)IL-1β蛋白定位情況
        9. RNA-seq分析
    結(jié)果
        1. SH-SY5Y細(xì)胞慢病毒感染情況
        2. 穩(wěn)定慢病毒感染SH-SY5Y細(xì)胞中IL-1β表達(dá)情況
        3. CCK-8實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4. SH-SY5Y過(guò)表達(dá)IL-1β基因的RNA-seq分析
    本章討論
    本章結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第四章 精神分裂癥患者外周血清炎性細(xì)胞因子表達(dá)的變化
    引言
    材料與方法
        1. 倫理與知情同意
        2. 研究對(duì)象
        3. 研究方法
    結(jié)果
        1. 人口統(tǒng)計(jì)學(xué)與臨床特征
        2. 首發(fā)或未服藥精神分裂癥組與健康對(duì)照組血清炎性細(xì)胞因子的比較
        3. PANSS評(píng)分與IL-1β Spearman相關(guān)分析
        4. 利培酮治療后應(yīng)答情況亞組分析
        5. ROC曲線評(píng)估血清IL-1β的分類(lèi)效果
        6. 基于GTEx數(shù)據(jù)的IL-1β在不同人體組織中的表達(dá)量分析
    本章討論
    本章結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
附錄
綜述 精神分裂癥患者外周血轉(zhuǎn)錄組異常及其與疾病臨床特征的相關(guān)性研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間獲得的成果
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Virus-Mediated Overexpression of ETS-1 in the Ventral Hippocampus Counteracts Depression-Like Behaviors in Rats[J]. Hanjiang Luo,Zijin Liu,Bo Liu,Hui Li,Yutao Yang,Zhi-Qing David Xu.  Neuroscience Bulletin. 2019(06)
[2]轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要研究技術(shù)及其應(yīng)用概述[J]. 劉偉,郭光艷,秘彩莉.  生物學(xué)教學(xué). 2019(10)
[3]首發(fā)精神分裂癥患者血漿神經(jīng)肽Y和催產(chǎn)素的表達(dá)變化[J]. 楊修登,劉勇,唐亞梅,張旺,張向暉,唐愛(ài)國(guó),陳芳.  中華行為醫(yī)學(xué)與腦科學(xué)雜志. 2017 (09)
[4]中國(guó)十省市第一代及第二代抗精神病藥使用現(xiàn)況調(diào)查[J]. 張?jiān)剖?司天梅,栗克清.  中國(guó)心理衛(wèi)生雜志. 2012(10)



本文編號(hào)：3157859