甲基化芯片檢測APP/PS1雙轉(zhuǎn)基因小鼠基因組DNA甲基化分布
發(fā)布時(shí)間:2021-03-27 15:36
目的研究阿爾茨海默病(AD)動(dòng)物模型APP/PS1雙轉(zhuǎn)基因小鼠基因組DNA甲基化分布。方法采用最新發(fā)展的甲基化DNA免疫共沉淀(Me DIP)結(jié)合高通量測序方法,檢測APP/PS1雙轉(zhuǎn)基因小鼠皮層腦組織DNA甲基化分布。結(jié)果只在AD小鼠腦組織中存在的DNA甲基化片段有2 346個(gè),涉及485個(gè)基因,這些DNA甲基化片段分布在不同的染色體上。部分甲基化基因具有一定家族聚集性。結(jié)論 APP/PS1雙轉(zhuǎn)基因小鼠與相應(yīng)的野生型小鼠腦組織的DNA甲基化位點(diǎn)存在明顯差異,提示DNA甲基化可能參與了AD的發(fā)生和發(fā)展。
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015,44(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物和分組:
1.1.2 組織標(biāo)本取材:
1.1.3 甲基化芯片:
1.2 方法
1.2.1 Roche NimbleGen芯片系統(tǒng)質(zhì)控:
1.2.2 Roche-NimbleGen MeDIP甲基化實(shí)驗(yàn)基本過程
1.2.2. 1 腦組織基因組DNA的提取和片段化
1.2.2. 2 免疫沉淀甲基化的DNA
1.2.3 DNA擴(kuò)增標(biāo)記:
1.2.4 雜交與清洗:
1.2.5 芯片掃描:
1.2.6 芯片圖像的采集與數(shù)據(jù)分析:
2 結(jié)果
2.1 MseⅠ酶切后DNA片段檢測
2.2 IP和Input樣品WGA擴(kuò)增產(chǎn)物檢測
2.3 芯片雜交結(jié)果
2.4 甲基化芯片初步篩選結(jié)果
3 討論
本文編號:3103755
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015,44(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物和分組:
1.1.2 組織標(biāo)本取材:
1.1.3 甲基化芯片:
1.2 方法
1.2.1 Roche NimbleGen芯片系統(tǒng)質(zhì)控:
1.2.2 Roche-NimbleGen MeDIP甲基化實(shí)驗(yàn)基本過程
1.2.2. 1 腦組織基因組DNA的提取和片段化
1.2.2. 2 免疫沉淀甲基化的DNA
1.2.3 DNA擴(kuò)增標(biāo)記:
1.2.4 雜交與清洗:
1.2.5 芯片掃描:
1.2.6 芯片圖像的采集與數(shù)據(jù)分析:
2 結(jié)果
2.1 MseⅠ酶切后DNA片段檢測
2.2 IP和Input樣品WGA擴(kuò)增產(chǎn)物檢測
2.3 芯片雜交結(jié)果
2.4 甲基化芯片初步篩選結(jié)果
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