精神分裂癥易感位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析和薈萃分析
發(fā)布時間:2021-01-06 23:53
精神分裂癥(MIM 181500)是最嚴(yán)重精神疾病之一,在世界范圍發(fā)病率為1%左右。雙生子,家系,寄養(yǎng)子的研究結(jié)果,提供了強(qiáng)有力的證據(jù)表明精神分裂癥是一種復(fù)雜遺傳疾病,具有很強(qiáng)的遺傳性。但引發(fā)精神分裂癥的基因仍然不明。多巴胺,谷氨酸神經(jīng)遞質(zhì)系統(tǒng)假說,是經(jīng)典的精神分裂癥病因假說。最近鋰離子的治療靶點(diǎn)磷酸肌醇途徑也被認(rèn)為是潛在的精神分裂癥病因。本研究試圖分析這三個假說中的精神分裂癥易感基因,以期進(jìn)一步解釋精神分裂癥的病因。多巴胺D3受體被認(rèn)為與精神分裂癥有關(guān),因為該受體可與抗精神病類藥物結(jié)合,并且在腦的葉邊緣處含量豐富。多巴胺D3受體的Ser9Gly多態(tài)性位點(diǎn)與精神分裂癥之間的關(guān)聯(lián)被廣泛研究,然后研究結(jié)果很難一致。該研究在中國人群中設(shè)計了329例散發(fā)病例和288例正常對照的病例對照關(guān)聯(lián)分析,以及一個大規(guī)模的薈萃分析,試圖進(jìn)一步解釋多巴胺D3受體的Ser9Gly多態(tài)性位點(diǎn)與精神分裂癥的的關(guān)聯(lián)分析,并對之前不一致的結(jié)果作出解釋。我們的關(guān)聯(lián)分析和薈萃分析結(jié)果不支持Ser9Gly多態(tài)性位點(diǎn)在中國人群中與精神分裂癥顯著相關(guān)。DTNBP1基因是一被頻繁研究的谷氨酸神經(jīng)遞質(zhì)系統(tǒng)精神分裂癥易感基因。然而之...
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:167 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
[1]復(fù)雜疾病病因的簡單模型
26圖1-3 重組熱點(diǎn)劃分成的單倍型塊Figure 1-3 Haplotype blocks divided by recombination hot spot為了能夠給整個基因組布上最精細(xì)的“路牌”,我們想要盡可能多的知道整個基因組上 SNP 的分布和在不同人群中的頻率;我們想要知道依據(jù)連鎖不平衡關(guān)系劃分的單倍型區(qū)段的分布;我們還想知道那些 SNP 是標(biāo)簽 SNP(tagSNP),這樣我們可以避免在一次研究中分型所有的 SNP,從而減少成本。這樣,國際人類基因組單倍型圖計劃應(yīng)運(yùn)而生[6,20,21]。在該項目中,日本、英國、加拿大、中國和美國的研究中心正在對樣品進(jìn)行基因分型。他們共使用了五種不同的基因分型技術(shù)。為了確保產(chǎn)出高質(zhì)量的數(shù)據(jù),項目遵循嚴(yán)格的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)。產(chǎn)生的數(shù)據(jù)包括:新確定的 SNPs,約 300 萬個 SNPs 在270 個體 DNA 樣品中的基因分型結(jié)果,這些 SNP 位點(diǎn)及單倍型在每個人群中的頻率
以及用于鑒定單倍型的標(biāo)簽 SNPs;谶@些遍布全基因組的 SNP 遺傳標(biāo)記,全基因組范圍的遺傳分析變得可行。特別是在關(guān)聯(lián)分析中,當(dāng)能夠候選的 SNP 數(shù)目有限時,能夠最大程度代表區(qū)域連鎖不平衡信息的 tagSNP 可以成為首選的目標(biāo)。另外,在選取候選 SNP 位點(diǎn)時,根據(jù) HapMap
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Meta分析方法的正確應(yīng)用[J]. 凌莉,韓璐. 循證醫(yī)學(xué). 2002(02)
[2]參數(shù)連鎖分析方法[J]. 倪鵬生,崔靜,沈福民. 遺傳. 2001(01)
[3]Meta分析:綜述中的一次大革命[J]. 彭少麟,鄭鳳英. 生態(tài)學(xué)雜志. 1999(06)
[4]Meta分析及其在生態(tài)學(xué)上的應(yīng)用[J]. 彭少麟,唐小焱. 生態(tài)學(xué)雜志. 1998(05)
[5]統(tǒng)計在生命科學(xué)中的實(shí)踐與認(rèn)識(IV)Meta-分析——一種量化的信息綜合方法(上)[J]. 湯旦林,李曉強(qiáng). 數(shù)理統(tǒng)計與管理. 1997(04)
[6]Meta-analysis概述[J]. 趙寧,俞順章. 腫瘤. 1992(06)
本文編號:2961478
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:167 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
[1]復(fù)雜疾病病因的簡單模型
26圖1-3 重組熱點(diǎn)劃分成的單倍型塊Figure 1-3 Haplotype blocks divided by recombination hot spot為了能夠給整個基因組布上最精細(xì)的“路牌”,我們想要盡可能多的知道整個基因組上 SNP 的分布和在不同人群中的頻率;我們想要知道依據(jù)連鎖不平衡關(guān)系劃分的單倍型區(qū)段的分布;我們還想知道那些 SNP 是標(biāo)簽 SNP(tagSNP),這樣我們可以避免在一次研究中分型所有的 SNP,從而減少成本。這樣,國際人類基因組單倍型圖計劃應(yīng)運(yùn)而生[6,20,21]。在該項目中,日本、英國、加拿大、中國和美國的研究中心正在對樣品進(jìn)行基因分型。他們共使用了五種不同的基因分型技術(shù)。為了確保產(chǎn)出高質(zhì)量的數(shù)據(jù),項目遵循嚴(yán)格的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)。產(chǎn)生的數(shù)據(jù)包括:新確定的 SNPs,約 300 萬個 SNPs 在270 個體 DNA 樣品中的基因分型結(jié)果,這些 SNP 位點(diǎn)及單倍型在每個人群中的頻率
以及用于鑒定單倍型的標(biāo)簽 SNPs;谶@些遍布全基因組的 SNP 遺傳標(biāo)記,全基因組范圍的遺傳分析變得可行。特別是在關(guān)聯(lián)分析中,當(dāng)能夠候選的 SNP 數(shù)目有限時,能夠最大程度代表區(qū)域連鎖不平衡信息的 tagSNP 可以成為首選的目標(biāo)。另外,在選取候選 SNP 位點(diǎn)時,根據(jù) HapMap
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Meta分析方法的正確應(yīng)用[J]. 凌莉,韓璐. 循證醫(yī)學(xué). 2002(02)
[2]參數(shù)連鎖分析方法[J]. 倪鵬生,崔靜,沈福民. 遺傳. 2001(01)
[3]Meta分析:綜述中的一次大革命[J]. 彭少麟,鄭鳳英. 生態(tài)學(xué)雜志. 1999(06)
[4]Meta分析及其在生態(tài)學(xué)上的應(yīng)用[J]. 彭少麟,唐小焱. 生態(tài)學(xué)雜志. 1998(05)
[5]統(tǒng)計在生命科學(xué)中的實(shí)踐與認(rèn)識(IV)Meta-分析——一種量化的信息綜合方法(上)[J]. 湯旦林,李曉強(qiáng). 數(shù)理統(tǒng)計與管理. 1997(04)
[6]Meta-analysis概述[J]. 趙寧,俞順章. 腫瘤. 1992(06)
本文編號:2961478
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