【摘要】：阿爾茨海默病(Alzheimer's Disease)是一種癡呆癥,該病危害性極大。目前仍未知該病的病發(fā)原因。利用計(jì)算方法對(duì)AD基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,識(shí)別與AD有關(guān)的候選致病基因,研究它們的致病機(jī)理。對(duì)尋找治愈AD方法的研究而言是有一定參考意義的。聚類分析是處理生物數(shù)據(jù)常用方式。結(jié)合生物信息理論本文選擇改進(jìn)了的模糊C均值算法(FCM)—基于PCA的模糊迭代自組織算法對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)聚類。首先,利用主成分分析方法(PCA)對(duì)AD基因表達(dá)數(shù)據(jù)降維來獲取FCM的初始類別數(shù)目和類別中心。其次,利用模糊目標(biāo)函數(shù)和模糊約束函數(shù),確定FCM算法的模糊指數(shù)。最后,引入迭代自組織數(shù)據(jù)分析方法(ISODATA)控制或優(yōu)化FCM算法的類別數(shù),減小算法失真,獲得較好的聚類結(jié)果。通過算法最終文章識(shí)別出29個(gè)AD可能的致病基因。對(duì)基因進(jìn)行理論上的分析后得到如下結(jié)論：①輔助性伴侶蛋白表達(dá)異常降低機(jī)體ATP供能可能導(dǎo)致Ap沉積而引發(fā)AD。②基因RERE、HNRNPC表達(dá)異常通過引起神經(jīng)元凋亡而可能誘發(fā)AD。③硒蛋白表達(dá)量降低通過影響硒的功能而可能誘導(dǎo)AD。④PRRG1, Agtr1表達(dá)量升高通過破壞鈣穩(wěn)態(tài)而可能誘導(dǎo)AD。最后給出了AD候選致病基因可能的致病機(jī)理圖。
【圖文】：

合了生物技術(shù)與芯片技術(shù)ＰＷ還參考了計(jì)算機(jī)芯片集成化的特點(diǎn)ＰＤ－Ｗ。該技術(shù)的逡逑基本原理是將待測(cè)樣本中標(biāo)記過的ＤＮＡ、ＣＤＮＡ或ＲＮＡ與基因忘片上的寡核脊逡逑酸片段進(jìn)行雜交（見圖１．１）。雜交過程中，，堿基互補(bǔ)配對(duì)使每個(gè)寡核巧酸片段呈逡逑現(xiàn)出不同的信號(hào)強(qiáng)度。對(duì)這些信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)行巧光掃描，分析掃描后的圖像得到基逡逑因的相關(guān)表達(dá)信息。取相同基因芯片不同樣本同時(shí)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，解決了傳統(tǒng)核酸印逡逑記雜交技術(shù)操作繁瑣，耗時(shí)長，花費(fèi)大的缺點(diǎn)。由于阿爾茨海默病基因數(shù)據(jù)量大，逡逑維數(shù)高，應(yīng)用該項(xiàng)技術(shù)能較快速度，較小代價(jià)得到不同狀況下的基因表達(dá)水平逡逑數(shù)據(jù)。逡逑？二．�。嘶苓姟＿姡椋В椋欤�；…Ｍ＂邋ｒ／逡逑＂Ｍｏｒｒｒ■巧！，邐了。ｒｒｏｒ邐邐邐１邐T?逡逑；。＆記邐Ｖ＼＾Ｖ逡逑；邐ＲＴ／b6二巧邐取邋l捗紓義先疲唬В揮�；：．：：：逦与钱�

本文編號(hào)：2552919