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老年性癡呆患者顳葉皮層差異基因的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-04-29 08:12

  本文選題:老年性癡呆 + 顳葉皮層 ; 參考:《中國老年學(xué)雜志》2016年16期


【摘要】:目的探討老年性癡呆患者顳葉皮層的生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機制及關(guān)鍵節(jié)點在癡呆早期的病機機制。方法從基因芯片公共數(shù)據(jù)庫GEO中下載老年性癡呆患者顳葉皮層的基因芯片數(shù)據(jù),采用在線分析軟件STRING和PANTHER對表達明顯差異的基因進行生物信息學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析,尋找關(guān)鍵節(jié)點基因。結(jié)果在40個差異表達基因編碼的蛋白中,有19個蛋白與其他蛋白存在相互作用關(guān)系,TBP、AKT1、CS、HSPB1及PARD6A蛋白為調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點蛋白。差異明顯的基因主要涉及分子結(jié)合、催化活性及轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)活性功能,與阿爾茨海默病(AD)-早老素信號通路、γ-氨基丁酸合成通路、AD-淀粉樣蛋白分泌酶通路有關(guān),參與了顳葉皮層的細胞間通訊、糖脂代謝、細胞轉(zhuǎn)運等生理學(xué)過程。結(jié)論 AD顳葉皮層的發(fā)病與TBP、AKT1、CS、HSPB1及PARD6A等基因密切相關(guān),主要涉及AD-早老素信號通路、γ-氨基丁酸合成通路和AD-淀粉樣蛋白分泌酶通路,有利于針對性的采用具有調(diào)節(jié)相應(yīng)網(wǎng)絡(luò)功能的藥物進行早期干預(yù),保護AD患者的認知功能。
[Abstract]:Objective to investigate the biological network regulation mechanism of temporal cortex in patients with Alzheimer's disease (AD) and the pathogenesis of key nodes in the early stage of dementia. Methods the microarray data of temporal cortex of Alzheimer's disease patients were downloaded from the common database of gene chip GEO. The bioinformatics control network analysis of the genes with obvious difference was performed by STRING and PANTHER. Search for key node genes. Results among the 40 proteins encoded by differentially expressed genes, 19 proteins interacted with other proteins. HSPB1 and PARD6A proteins were the key node proteins in the regulatory network. The differentially expressed genes are mainly involved in molecular binding, catalytic activity and transcriptional regulatory activity, and are related to the AD-early aging signal pathway of Alzheimer's disease, the 緯 -aminobutyric acid synthesis pathway and the AD-amyloid secretase pathway. Involved in the temporal cortex intercellular communication, glucose metabolism, cell transport and other physiological processes. Conclusion the pathogenesis of AD temporal cortex is closely related to the genes such as HSPB1 and PARD6A, which are mainly involved in AD-presentin signaling pathway, gamma-aminobutyric acid synthesis pathway and AD-amyloid secretase pathway. It is beneficial to the early intervention of drugs with the function of regulating the corresponding network and protecting the cognitive function of AD patients.
【作者單位】: 中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)臨床基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所;河南省省直第二醫(yī)院腫瘤科;北京師范大學(xué)認知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國家重點實驗室;南方醫(yī)科大學(xué)中醫(yī)藥學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(81274001) 國家科技重大專項—重大新藥創(chuàng)制(2013ZX09103002-002,2013ZX09301307)
【分類號】:R749.16

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本文編號:1819120

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