本文關(guān)鍵詞：基于模糊聚類的頂點(diǎn)著色算法識別阿爾茨海默病的候選基因

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【摘要】：阿爾茨海默病一種最常見的癡呆病，估計目前國內(nèi)患有該病的人數(shù)達(dá)到900萬。但是目前治療該病并沒有有效的藥物，僅僅是緩解病情的發(fā)展，因此識別與阿爾茨海默病相關(guān)的候選基因是一項重要任務(wù)。通過設(shè)計算法，分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)，識別出與疾病相關(guān)的候選基因，研究阿爾茨海默病的發(fā)病機(jī)制，從而達(dá)到治療阿爾茨海默病。 聚類是計算分析的一種常用方法。本文的總體思想是通過模糊聚類方法把基因數(shù)據(jù)分成一些大類，，然后利用頂點(diǎn)著色原理把每個大類進(jìn)行再次分類，最后分析分類結(jié)果，識別出與阿爾茨海默病相關(guān)的候選基因。在本文中，首先判斷了基因表達(dá)數(shù)據(jù)是具有聚類趨勢，再者根據(jù)模糊聚類中目標(biāo)函數(shù)和有效性指標(biāo)函數(shù)，從而確定了模糊指數(shù)和聚類數(shù)目的取值，最后利用頂點(diǎn)著色算法細(xì)分每個大類，得到分類結(jié)果和孤立基因。 利用以上方法，本文識別出了45個孤立基因可能與阿爾茨海默病有關(guān)，其中3個基因（SST、MOBP和NTRK2）已經(jīng)報道了與阿爾茨海默病有關(guān)，另外3個基因（KIF18A、PLEC和VIM）與細(xì)胞骨架有關(guān)，3個基因（HLA-DQB1、HLA-DRA和SPN）與免疫應(yīng)答有關(guān)以及IL17RB與炎癥有關(guān)。最后給出了一些基因與阿爾茨海默病的關(guān)系圖。
【學(xué)位授予單位】：四川師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R749.16

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1218387