本文關鍵詞：基于模糊聚類的頂點著色算法識別阿爾茨海默病的候選基因

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【摘要】：阿爾茨海默病一種最常見的癡呆病，估計目前國內(nèi)患有該病的人數(shù)達到900萬。但是目前治療該病并沒有有效的藥物，僅僅是緩解病情的發(fā)展，因此識別與阿爾茨海默病相關的候選基因是一項重要任務。通過設計算法，分析基因表達數(shù)據(jù)，識別出與疾病相關的候選基因，研究阿爾茨海默病的發(fā)病機制，從而達到治療阿爾茨海默病。 聚類是計算分析的一種常用方法。本文的總體思想是通過模糊聚類方法把基因數(shù)據(jù)分成一些大類，，然后利用頂點著色原理把每個大類進行再次分類，最后分析分類結果，識別出與阿爾茨海默病相關的候選基因。在本文中，首先判斷了基因表達數(shù)據(jù)是具有聚類趨勢，再者根據(jù)模糊聚類中目標函數(shù)和有效性指標函數(shù)，從而確定了模糊指數(shù)和聚類數(shù)目的取值，最后利用頂點著色算法細分每個大類，得到分類結果和孤立基因。 利用以上方法，本文識別出了45個孤立基因可能與阿爾茨海默病有關，其中3個基因（SST、MOBP和NTRK2）已經(jīng)報道了與阿爾茨海默病有關，另外3個基因（KIF18A、PLEC和VIM）與細胞骨架有關，3個基因（HLA-DQB1、HLA-DRA和SPN）與免疫應答有關以及IL17RB與炎癥有關。最后給出了一些基因與阿爾茨海默病的關系圖。
【學位授予單位】：四川師范大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R749.16

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 黃復賢;課程表自動編排系統(tǒng)的設計與開發(fā)[J];四川師范大學學報(自然科學版);1999年06期

2 胡本瓊,張先迪,龐朝陽;利用圖論設計圖像壓縮中的向量量化聚類算法[J];四川師范大學學報(自然科學版);2005年03期

3 莊劉;曾艷;;基于模糊C-均值聚類的最優(yōu)量化器設計[J];四川師范大學學報(自然科學版);2010年04期

4 王開軍;李曉;;基于有效性指標的聚類算法選擇[J];四川師范大學學報(自然科學版);2011年06期

5 莫智文,舒蘭,許彪;模糊數(shù)學理論及其應用評述[J];四川師范大學學報(自然科學版);1998年03期

6 曾廣周;;聚類趨勢檢驗中的窗口設置[J];山東工業(yè)大學學報;1985年04期

7 曾廣周;;隨機分布模式的統(tǒng)計檢驗[J];山東工業(yè)大學學報;1986年04期

本文編號：1218387