八個阿爾茨海默病易感基因在中國北方人群中的關聯(lián)研究
發(fā)布時間:2017-10-13 09:23
本文關鍵詞:八個阿爾茨海默病易感基因在中國北方人群中的關聯(lián)研究
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【摘要】:目的在中國北方人群中識別阿爾茨海默。ˋD)的易感基因,并驗證其與AD的關聯(lián)性。 方法1.研究人群選擇北京AD患者248例,同地區(qū)年齡、性別匹配408例對照。通過文獻檢索和生物信息學分析,篩選出GBP2、BIN1、ADAM12、FRMD4A、SORL1、PICALM、MS4A4E、TOMM40基因及3號染色體和4號染色體區(qū)間,共10個未在中國人群中進行與AD關聯(lián)性報道的候選SNPs位點。通過PCR-HRM(聚合酶鏈反應-高分辨率率溶解曲線)技術(shù)并結(jié)合隨機抽樣方法測序驗證分型結(jié)果的準確性,對研究人群進行10個位點的基因分型檢測。2.使用SPSS統(tǒng)計軟件及GMDR等軟件分析各位點等位基因、基因型及遺傳模型頻率在兩組的分布,驗證候選位點與中國北方人群AD風險的關聯(lián),并且分析各位點基因、基因型及遺傳模型與AD臨床表型的關聯(lián)。探索候選位點在AD患者中攜帶ApoE風險基因型與非攜帶組間的基因型頻率差異。 結(jié)果1.在中國北方人群中,篩選的10個位點有3個與AD關聯(lián),分別是rs7081208、rs3851179、rs10119(P=0.045,P=0.032,P=0.01)。2.遺傳模型分析中發(fā)現(xiàn):rs1425967單核苷酸多態(tài)性的基因型AG與AD有關聯(lián)(P=0.002,OR=0.61);rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、TT、CT+TT與AD存在風險關聯(lián)(P=0.032,OR=4.59;P=0.026,,OR=4.68;P=0.026,OR=4.66);rs3851179單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、CT+TT與AD風險關聯(lián)(P=0.01,OR=1.58;P=0.021,OR=1.49);rs10119單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、CT+TT與AD患病風險有顯著性關聯(lián)(P=0.004,OR=1.684;P=0.013,OR=1.158)3.在ApoE風險基因型協(xié)同作用分析發(fā)現(xiàn):rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT+TT在攜帶ApoE基因rs429358單核苷酸多態(tài)性風險基因CT+TT組中多于非攜帶組(P=0.003,OR=11.73)。4.在AD患者臨床變量癡呆程度分析中發(fā)現(xiàn):rs2221154單核苷酸多態(tài)性T等位基因與癡呆程度有顯著性關聯(lián)(P=0.003);rs1425967單核苷酸多態(tài)性的共顯模型中基因型AG與GG與癡呆程度相關(P=4.39×10-4,P=0.002);rs7081208單核苷酸多態(tài)性的等位基因G及基因型GG與癡呆程度有顯著性關聯(lián)(P=0.01,P=0.01);rs720099等位基因C及顯性模型中基因型CC+CT與癡呆程度也有顯著性關(P=2.24×10-16,P=0.038)。5.基因交互作用分析提示:單核苷酸多態(tài)性rs10119CC或CT-rs3851179CC或C基因間的互作關系明顯,病例組患AD的風險顯著高于對照組。6.危險基因型累積效應分析發(fā)現(xiàn):單核苷酸多態(tài)性rs7081208、rs3851179與rs10119隨著危險基因型數(shù)目的增多,病例組和對照組間含有的危險基因型數(shù)目的越多,個體患AD的風險越大(OR值由1.79增大2.09再到4.94)。 結(jié)論1. FRMD4A基因rs7081208、PICALM基因rs3851179與TOMM40基因rs10119可能是中國北方人群的AD易感基因。2.rs1425967單核苷酸多態(tài)性的基因型AG、 rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、TT、CT+TT可能會增加AD的患病風險。3. ApoE基因rs429358單核苷酸多態(tài)性風險基因CT+TT會增加rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT+TT對AD的作用。4. rs2221154等位基因T、rs1425967基因型AG與GG、rs7081208等位基因G及基因型GG、rs720099等位基因C及顯性模型中基因型CC+CT與癡呆程度相關。5. rs10119CC或CT-rs3851179CC或CT基因之間的交互作用會增加患AD的風險。6. rs7081208、rs3851179與rs10119單核苷酸多態(tài)性的危險基因型數(shù)目疊加會增加個體患AD的風險。
【關鍵詞】:中國北方人群 阿爾茨海默病 易感位點 關聯(lián)研究
【學位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R749.16
【目錄】:
- 摘要4-6
- ABSTRACT6-8
- 符號說明8-12
- 前言12-17
- 1. 阿爾茨海默病概況及研究意義12-13
- 2. 阿爾茨海默病的分類13
- 3. 阿爾茨海默病的遺傳學研究進展13-16
- 4. 本研究的價值16-17
- 材料與方法17-30
- 1. 研究對象的納入排除和基本信息采集17-18
- 2. 實驗儀器、試劑及部分溶液的制備18-21
- 3. 主要軟件及數(shù)據(jù)庫21
- 4. 實驗設計及路線圖21-22
- 5. 實驗方法22-29
- 6. 統(tǒng)計學分析29-30
- 結(jié)果30-53
- 1. 受試者臨床基本信息30
- 2. 10 個 SNPS 分型圖譜30-34
- 3. 分型結(jié)果準確性檢測34
- 4. 各位點基因型、等位基因分布頻率和遺傳模型關聯(lián)分析34-43
- 5. 以 APOE 分層,研究 AD 關聯(lián)位點在病例組中的基因型分布43
- 6. 各位點在病例組中與臨床協(xié)變量分析43-50
- 7. 基因交互作用分析50-51
- 8.AD 關聯(lián) SNPS 危險基因型累積效應分析51-53
- 討論53-61
- 1. 基因多態(tài)性位點與中國北方人群 AD 關聯(lián)53-59
- 2. GMDR 分析在本研究中的意義59-60
- 3.AD 易感位點累積效應與 AD 風險60-61
- 結(jié)論61-62
- 參考文獻62-71
- 綜述71-85
- 綜述參考文獻77-85
- 致謝85-86
- 攻讀學位期間發(fā)表的論文86-87
- 個人簡歷87-88
- 附錄88-94
【共引文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 蔡江萍;李國前;慕容慎行;葛華;石炎川;洪全龍;;LRRK2基因多態(tài)性與散發(fā)性阿爾茨海默病相關性的研究[J];福建醫(yī)科大學學報;2014年03期
2 惠娟;王娜娜;張毓洪;楊澤;Wandong Zhang;;ZNF224基因與阿爾茨海默病風險關聯(lián)的研究[J];中國老年保健醫(yī)學;2014年02期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 王大偉;KIBRA基因多態(tài)性與默認網(wǎng)絡、執(zhí)行控制網(wǎng)絡相關性的多模態(tài)MRI研究[D];天津醫(yī)科大學;2013年
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 孫靈芝;Aβ42誘導tau蛋白過度磷酸化的實證及初步機理[D];廣東藥學院;2013年
本文編號:1024067
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