貴州省2009~2011年度新型H1N1流感病毒HA1基因序列分析
發(fā)布時間:2017-10-06 17:09
本文關(guān)鍵詞:貴州省2009~2011年度新型H1N1流感病毒HA1基因序列分析
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【摘要】:目的建立并完善貴州省新型甲型H1N1流感病毒基因分析檢測技術(shù)平臺,了解2009~2010年度貴州省新型H1N1流感病毒HA1片段與WHO公布的流行株是否有發(fā)生變異。方法收集10株新型H1N1流感病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通過RT-PCR擴增HA1片斷,用電泳觀察PCR產(chǎn)物目的條帶的大小,經(jīng)過純化、測序,用Biodeit、MEGA4相關(guān)軟件進行序列比對,同源性及差異性分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果與古典豬流感病毒株相比,貴州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分別為72.0%~74.6%、72.0%、67.8%~68.3%。與其他4株亞洲株H1N1流感病毒代表株相比,貴州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分別為92.3%~95.8%、91.5%~92.4%、89.8%~90.8%。2009年度組內(nèi)同源性為93.2%~100%;2010年組內(nèi)高度同源,為100%;2011年組內(nèi)同源性為98.3%。貴州省流感毒株與中俄代表株A/Habarovak/01/2009(H1N1)的HA1基因同屬一個譜系,在同一個分支上,同時,與墨西哥第一株甲型H1N1流感A/MexioCity/001/2009(H1N1)親緣關(guān)系也較近,在同一個大分支上。結(jié)論貴州省新型H1N1流感病毒代表株HA1基因與WHO公布的流行株在核苷酸水平有一定持續(xù)水平的變異。
【作者單位】: 貴州省疾病預防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 貴州省 新型HN流感病毒 HA基因片段
【基金】:國家科技重大專項“傳染病監(jiān)測技術(shù)平臺”項目 “云南及周邊省市傳染病病原譜流行規(guī)律研究”項目(2009ZX10602-12) 貴州省衛(wèi)生廳課題資助(gzwkj2010-1-063)
【分類號】:R373
【正文快照】: 流感是由于人類感染流感病毒而發(fā)生的一種呼吸道傳染病,具有較高的發(fā)病率和死亡率,人流感病毒份為甲(A)、乙(B)、丙(C)3個類型。對人類威脅最大的是甲型流感病毒,是引起季節(jié)性流感的主要病原體。根據(jù)病毒顆粒表面血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)蛋白
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條
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3 龔甜;熊英;劉麗萍;王飛霞;施勇;周s,
本文編號:983962
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