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基于偏最小二乘線性判別分析的遺傳算法在代謝組學(xué)特征篩選中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2017-10-04 04:24

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【摘要】:目的探討基于偏最小二乘線性判別分析的遺傳算法特征篩選性能,并將其應(yīng)用于高維代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。方法通過(guò)模擬試驗(yàn)驗(yàn)證基于偏最小二乘線性判別分析的遺傳算法特征篩選能力,同時(shí)應(yīng)用于卵巢良惡性腫瘤鑒別的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)特征篩選分析。結(jié)果模擬實(shí)驗(yàn)顯示,基于偏最小二乘線性判別分析的遺傳算法對(duì)信息變量的篩選能力明顯優(yōu)于偏最小二乘變量投影重要性指標(biāo);代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析顯示,使用遺傳算法篩選出的變量能夠獲得更低的誤差率,該方法篩得的變量具有更大的概率包含了與某種生物學(xué)結(jié)果相關(guān)的代謝物。結(jié)論基于偏最小二乘線性判別分析的遺傳算法作為一種優(yōu)化技術(shù),在小樣本條件下對(duì)高維數(shù)據(jù)的特征篩選具有較好的效果。
【作者單位】: 浙江省疾病預(yù)防控制中心;山東大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系;杭州師范大學(xué)醫(yī)藥衛(wèi)生管理學(xué)院;哈爾濱醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】偏最小二乘 判別分析 遺傳算法 代謝組學(xué)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助(81172767)
【分類號(hào)】:R311;TP18
【正文快照】: 代謝組學(xué)通常使用理化分析技術(shù)對(duì)生物體體液或組織的小分子代謝物進(jìn)行定量的動(dòng)態(tài)測(cè)量,繼而利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法識(shí)別與病理生理刺激或基因改變相關(guān)的代謝物,探索可能的代謝途徑;诜治黾夹g(shù)的進(jìn)步,如LC-MS,GC-MS和NMR,近年來(lái)代謝組學(xué)迅速發(fā)展,并成功地應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、毒理學(xué)和營(yíng)養(yǎng)學(xué)

【參考文獻(xiàn)】

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2 荀鵬程;錢國(guó)華;趙楊;于浩;陳峰;;高維生物學(xué)數(shù)據(jù)兩階段組合降維策略研究[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2012年05期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條

1 毛璇;張冬娟;管又飛;顏賢忠;;Ⅱ型糖尿病腎病小鼠腎水提物代謝組學(xué)研究[J];波譜學(xué)雜志;2010年04期

2 王靜;夏結(jié)來(lái);葉冬青;;判別分析方法在醫(yī)學(xué)應(yīng)用中的進(jìn)展[J];數(shù)理統(tǒng)計(jì)與管理;2008年02期

3 王園園;陳景武;;偏最小二乘回歸及SAS編程的醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J];數(shù)理醫(yī)藥學(xué)雜志;2008年06期

4 李江華;范葉飛;劉文鋒;;偏最小二乘法(PLS)在體育科研中的應(yīng)用與實(shí)踐[J];中國(guó)體育科技;2010年06期

5 荀鵬程;錢國(guó)華;富春楓;于浩;陳峰;;判別分析驅(qū)動(dòng)的微陣列數(shù)據(jù)的降維策略[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2009年02期

6 王園園;陳景武;;偏最小二乘回歸模型在科技人員人格特征研究中的應(yīng)用[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2010年01期

7 王園園;陳景武;;偏最小二乘回歸分析在醫(yī)學(xué)中的正確應(yīng)用[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2010年02期

8 王園園;陳景武;;偏最小二乘回歸模型在高?萍既藛T類型預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2010年03期

9 荀鵬程;錢國(guó)華;趙楊;于浩;陳峰;;高維生物學(xué)數(shù)據(jù)兩階段組合降維策略研究[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2012年05期

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1 廖宜濤;基于圖像與光譜信息的豬肉品質(zhì)在線無(wú)損檢測(cè)研究[D];浙江大學(xué);2011年

2 江芝婷;代謝組學(xué)在疾病預(yù)測(cè)診斷以及療效評(píng)價(jià)中的應(yīng)用研究[D];華東理工大學(xué);2011年

3 倪網(wǎng)東;新型多元校正、校正轉(zhuǎn)換和多元分類分析方法研究[D];中南大學(xué);2010年

4 任曉衛(wèi);上海地區(qū)人群甲型流感HA抗原進(jìn)化與基因進(jìn)化關(guān)系研究及H1N1流感潛在免疫顯性位點(diǎn)的篩選[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

5 朱東亮;信息獲取與評(píng)價(jià)用于六味地黃丸有效成分群的辨識(shí)研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 王園園;偏最小二乘回歸與判別分析在科技人員類型及影響因素研究中的應(yīng)用[D];濰坊醫(yī)學(xué)院;2009年

2 韓莎;飲水型氟骨癥非骨相特征的分析及早期判別模型的建立[D];山西醫(yī)科大學(xué);2011年

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4 毛璇;代謝組學(xué)技術(shù)在疾病動(dòng)物模型研究中的應(yīng)用[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2010年

5 支海娟;基于NMR款冬植物代謝組學(xué)研究[D];山西大學(xué);2012年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 荀鵬程;趙楊;柏建嶺;易洪剛;于浩;陳峰;;微陣列數(shù)據(jù)的多重比較[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2006年01期

2 錢國(guó)華;荀鵬程;陳峰;于浩;;偏最小二乘法降維在微陣列數(shù)據(jù)判別分析中的應(yīng)用[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2007年02期

3 荀鵬程;錢國(guó)華;富春楓;于浩;陳峰;;判別分析驅(qū)動(dòng)的微陣列數(shù)據(jù)的降維策略[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2009年02期

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 王宏,李慶波,劉則毅,徐可欣;遺傳算法在近紅外無(wú)創(chuàng)傷人體血糖濃度測(cè)量基礎(chǔ)研究中的應(yīng)用[J];分析化學(xué);2002年07期

2 劉興洲,王國(guó)相,邱浩彰,毛坤,孫少杰,汪仁彬,孫瑞華,焦勁松,楊秉賢;棘波觸發(fā)平均肌電圖新參數(shù)對(duì)神經(jīng)原性損害的診斷意義[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;1997年11期

3 楊志雄;;用遺傳編程進(jìn)化神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和權(quán)值[J];中山大學(xué)研究生學(xué)刊(自然科學(xué)版);2000年04期

4 姜明宇;馬文麗;鄭文嶺;;基于遺傳算法的基因表達(dá)數(shù)據(jù)的K-均值聚類分析[J];上海生物醫(yī)學(xué)工程;2006年03期

5 朱學(xué)明,王化祥,何世鈞,南國(guó)芳;基于RBF網(wǎng)絡(luò)和遺傳算法的電阻抗圖像重建算法[J];天津大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與工程技術(shù)版);2002年06期

6 周建淞;張曉麗;韓榮榮;仇麗霞;;遺傳算法在單目標(biāo)混料均勻設(shè)計(jì)優(yōu)化實(shí)例中的應(yīng)用[J];中國(guó)藥物與臨床;2010年11期

7 宋其林,高本,李俠,楊秋實(shí),青雪梅;人體衰老生物學(xué)標(biāo)志的三維表示方法[J];哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1997年01期

8 王瑞平;萬(wàn)柏坤;高上凱;;使用遺傳算法的乳腺微鈣化點(diǎn)特征優(yōu)化[J];電子科技大學(xué)學(xué)報(bào);2007年01期

9 吳建斌;李太全;田茂;;改進(jìn)的遺傳算法在白細(xì)胞識(shí)別中的應(yīng)用研究[J];計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用;2007年27期

10 張躍明,潘曦東,谷方,丁士海;顳骨性別判別分析[J];解剖學(xué)雜志;1998年04期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 周寬久;陳雪峰;;人體脈搏波特征提取算法研究[A];大連理工大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)術(shù)論文集(第2卷)[C];2005年

2 劉紅艷;韋曦;凌均h,

本文編號(hào):968616


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