貓主要過敏原Fel d1的T細胞抗原表位分析及三維結(jié)構(gòu)模擬
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【摘要】:目的:預測貓主要過敏原Fel d 1與MHCⅠ、MHCⅡ類分子的結(jié)合力獲得T細胞優(yōu)勢抗原表位,并模擬Fel d 1的三維結(jié)構(gòu),為貓主要過敏原的改造及其臨床研究等提供依據(jù)。方法:從Uniprot數(shù)據(jù)庫中得到貓主要過敏原Fel d 1的氨基酸序列,通過在線軟件NetMHCⅡ2.2對Fel d 1氨基酸序列進行MHCⅡ抗原表位分析,使用軟件SYFPEITHI分析MHCⅠ的抗原表位,再通過在線軟件Swiss-Model預測Fel d 1的三維結(jié)構(gòu),以Ramachandran圖評估三維結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。結(jié)果:運用生物學軟件分析得到Fel d 1上兩個高值MHCⅡ抗原表位區(qū)域分別為22~43、80~95,MHCⅠ抗原表位優(yōu)勢區(qū)為17~30、56~84、91~103。Ramachandran圖顯示Fel d 1的空間構(gòu)象穩(wěn)定。結(jié)論:本研究有助于確定Fel d 1的T細胞優(yōu)勢抗原表位及其三維結(jié)構(gòu)模型,為Fel d 1抗原性改造提供理論依據(jù),及將來的臨床研究奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】: 廣州市過敏反應(yīng)與臨床免疫重點實驗室/呼吸疾病國家重點實驗室變態(tài)反應(yīng)研究室/廣州醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】: 貓主要過敏原 Fel d 抗原表位 三維結(jié)構(gòu)
【基金】:國家重大科技專項重大課題(2011ZX08011-005) 廣州醫(yī)學院項目(2006GD053)資助
【分類號】:R392.8
【正文快照】: 貓過敏原是一種常見的過敏原。研究已證實貓過敏原白蛋白與狗、馬、兔、大鼠、豚鼠、倉鼠和牛等多種過敏原白蛋白存在交叉反應(yīng)[1]。在貓的皮屑、毛發(fā)、唾液、舌下腺等提取物中發(fā)現(xiàn)有多種過敏原,包括Fel d 1、Fel d 2、Fel d 3、Fel d 4、Fel d 5、Fel d6。最近一項研究還發(fā)現(xiàn)F
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本文編號:890902
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