本文關(guān)鍵詞：小鼠內(nèi)耳發(fā)育核心轉(zhuǎn)錄因子的保守性及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的比較分析

  更多相關(guān)文章： 內(nèi)耳發(fā)育 轉(zhuǎn)錄因子 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

【摘要】：在脊椎動物內(nèi)耳發(fā)育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作為核心調(diào)控基因參與聽基板的誘導過程。文章通過生物信息學方法,對小鼠內(nèi)耳發(fā)育的核心轉(zhuǎn)錄因子進行保守性分析并研究其相互調(diào)控關(guān)系,得到小鼠內(nèi)耳發(fā)育過程中核心轉(zhuǎn)錄因子的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。與文獻中已知的小鼠內(nèi)耳發(fā)育基因調(diào)控關(guān)系相比,Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在內(nèi)耳發(fā)育中仍然起主要調(diào)控者的角色,Six1則處于被多個轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)的地位,Gbx2、Irx2/3、Msx1在調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中也起到重要作用。對出現(xiàn)的差異進行了合理的分析,同時結(jié)合構(gòu)建的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測了可能存在的Msx1對Six1、Gbx2的調(diào)控作用。序列預(yù)測結(jié)果也發(fā)現(xiàn)了一些新的調(diào)控關(guān)系,所涉及的轉(zhuǎn)錄因子包括Sox5、Lhx2、Rax、Otx1、Otx2、Pitx1、Pitx2、Nkx2-5、Irx4、Irx6、Dlx2、Hmx1/2/3、Pou4f3、Pax4、Tlx2。文章為深入了解內(nèi)耳發(fā)育調(diào)控機制提供了基礎(chǔ)信息。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學第一臨床醫(yī)學院;南京醫(yī)科大學基礎(chǔ)醫(yī)學院;
【關(guān)鍵詞】： 內(nèi)耳發(fā)育 轉(zhuǎn)錄因子 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
【基金】：國家級大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目(編號:201210312014) 江蘇省高等學校大學生實踐創(chuàng)新訓練計劃項目(重點)(編號2012JSSPITP1045) 江蘇高校優(yōu)勢學科建設(shè)工程項目資助
【分類號】：R341
【正文快照】： 脊椎動物內(nèi)耳的形成起始于菱腦兩側(cè)的表面外胚層,先后經(jīng)過聽基板、聽窩、聽囊、聽泡等階段,發(fā)育為耳蝸囊及前庭囊,逐漸形成內(nèi)耳的完整結(jié)構(gòu)。聽基板的誘導是內(nèi)耳發(fā)育過程中最早發(fā)生的事件之一,是內(nèi)耳形態(tài)發(fā)生的起始事件。位于表面外胚層的前基板區(qū)(Pre-placodal region,PPR)在F

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 侯琳;錢敏平;朱云平;鄧明華;;轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點生物信息學研究進展[J];遺傳;2009年04期

2 陳鴻飛;王進科;;轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)數(shù)據(jù)庫[J];遺傳;2010年10期

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 余鵬;王遵寶;吳洪賓;班謙;趙宗勝;;綿羊甘露聚糖結(jié)合凝集素基因啟動子區(qū)的克隆與序列分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2011年03期

2 劉維;陳漢武;陳];;一種識別基因調(diào)控元件的新型優(yōu)化算法[J];計算機應(yīng)用與軟件;2013年01期

3 張昕艷;趙國芬;包秋華;張和平;;植物乳桿菌P8亞油酸異構(gòu)酶基因及其上游非編碼區(qū)的克隆與分析[J];食品科學;2011年17期

4 徐華偉;字向東;黃磊;穆曉琨;楊春先;;牦牛BLG基因5’調(diào)控成分的克隆及序列分析[J];生物技術(shù);2011年01期

5 張慧敏;李劍芳;鄔敏辰;;圓弧青霉脂肪酶基因序列的生物信息學分析[J];食品與生物技術(shù)學報;2010年04期

6 陳曉芳;張艷;李紹武;張永清;薛勇彪;;百尺竿頭 更進一步——2011年《遺傳》辦刊工作回顧[J];遺傳;2012年01期

7 李慧敏;石玉;楊志剛;江紹萍;;基于Markov模型的基因組合調(diào)控模塊預(yù)測[J];云南民族大學學報(自然科學版);2013年02期

8 姜志磊;李淑芳;胡慶才;龍麗坤;;水稻、擬南芥組織特異性啟動子的序列特征分析[J];中國農(nóng)學通報;2013年15期

9 孫高飛;何守樸;杜雄明;;雷蒙德氏棉和擬南芥基因啟動子中順式作用元件的分布[J];遺傳;2013年10期

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 許鐘;P53基因突變與胃癌臨床病理關(guān)系的meta分析及P53抑制蛋白iASPP轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制初步研究[D];重慶醫(yī)科大學;2011年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王洋;高效的motif識別方法研究[D];北京交通大學;2011年

2 余鵬;綿羊MBL基因啟動子區(qū)CpG島甲基化與綿羊支原體肺炎相關(guān)性研究[D];石河子大學;2011年

3 田陸芳;基于遺傳算法的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點識別算法的研究[D];燕山大學;2011年

4 馮俊華;基于遺傳算法和位置特異性得分矩陣的動態(tài)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點識別方法[D];東北師范大學;2009年

5 欒劍;葡萄ACS基因的電子克隆及生物信息學分析[D];遼寧師范大學;2009年

6 陳惠娟;家蠶兩種乙酰膽堿酯酶基因的表達譜分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2009年

7 連肖華;水稻W(wǎng)RKY轉(zhuǎn)錄因子SUSIRI的原核表達及其靶基因的初步篩選[D];福建農(nóng)林大學;2010年

8 柴秀琴;模體相似度比較算法研究[D];天津師范大學;2012年

9 趙驍;蘋果蠢蛾成蟲觸角感器超微結(jié)構(gòu)及信息素結(jié)合蛋白基因的克隆與序列分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2012年

10 岳宏亮;轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點位置頻率矩陣的聚類方法研究[D];西安電子科技大學;2011年

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 黃應(yīng)秋;;遺傳性狀表達調(diào)控網(wǎng)——經(jīng)絡(luò)[J];當代醫(yī)學(學術(shù)版);2008年19期

2 鄧少麗;程小星;袁濤;夏季;;BCMA基因5′上游序列生物信息學分析[J];重慶醫(yī)學;2008年03期

3 冷少華;梁志清;王鳳英;;調(diào)控胚胎干細胞生長的轉(zhuǎn)錄因子[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2009年11期

4 吳斌;丁虎;張嵐;李仁立;汪培華;汪道文;;人細胞色素P450 4A11基因核心啟動子區(qū)的鑒定[J];中國分子心臟病學雜志;2008年01期

5 楊樹德;曹奇志;馮小英;張曉姝;薛江楠;;人LAIR-1/CD305基因啟動子的生物信息學分析[J];細胞與分子免疫學雜志;2010年08期

6 孫倩;王進科;;ASPP2基因啟動子區(qū)DNA甲基化及轉(zhuǎn)錄因子DNA結(jié)合位點的干濕研究[J];生物醫(yī)學工程研究;2010年04期

7 李長燕;楊曉明;;造血細胞發(fā)育分化相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子研究[J];軍事醫(yī)學科學院院刊;2005年06期

8 周雯;王青松;;緊密連接蛋白claudin-10基因5′調(diào)控區(qū)序列的生物信息學分析[J];海南醫(yī)學院學報;2010年07期

9 周雯;王青松;;緊密連接蛋白claudin-10基因5′調(diào)控區(qū)序列的生物信息學分析[J];海南醫(yī)學院學報;2010年11期

10 高書穎;許麗艷;崔磊;周飛;郭張燕;蔡唯佳;李恩民;;HeLa細胞中ezrin基因主要轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的定位分析[J];腫瘤;2008年02期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 沈柱;;Foxp3基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[A];中華醫(yī)學會第16次全國皮膚性病學術(shù)年會摘要集[C];2010年

2 孫桂超;鄒翔;季宇彬;;細胞凋亡線粒體途徑機制的研究[A];2009醫(yī)學前沿論壇暨第十一屆全國腫瘤藥理與化療學術(shù)會議論文集[C];2009年

3 田春艷;張令強;邢桂春;聶晶;尹秀山;李濱;原艷芝;賀福初;;新型KRAB型鋅指蛋白分子KRANA的功能研究[A];中國遺傳學會七屆一次青年研討會暨上海高校模式生物E——研究院第一屆模式生物學術(shù)研討會論文匯編[C];2005年

4 姚登兵;李枚原;于彬;王勇軍;丁斐;顧曉松;;大鼠坐骨神經(jīng)損傷后Wallerian潰變的生物信息學研究[A];中國解剖學會2011年年會論文文摘匯編[C];2011年

5 曹念;胡晨;張艷;李渝萍;;PGC-1α輔助“孤兒”受體ERRα作用的研究進展[A];重慶市生物化學與分子生物學學術(shù)會議論文摘要匯編[C];2009年

6 傅占江;田野蘋;;α-黑素細胞刺激素對促炎因子誘導的B淋巴細胞粘附分子表達上調(diào)的抑制作用[A];河北省免疫學會第六次免疫學大會資料匯編[C];2010年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 胡德榮;中德科學家聯(lián)手分析蛋白質(zhì)拓撲結(jié)構(gòu)和功能[N];健康報;2006年

2 陸祖宏;生物信息技術(shù)及其在后基因組研究中的應(yīng)用[N];科技日報;2002年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 田靖;人類胚胎干細胞中SOX2基因相關(guān)的保守（表觀）遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初探[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2011年

2 曾春賢;miR-122調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其生物學功能[D];中山大學;2011年

3 劉瓊明;人類肝臟氧化應(yīng)激反應(yīng)和氧化還原調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的初步研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2006年

4 霍然;人睪丸蛋白質(zhì)表達譜的構(gòu)建及精子發(fā)生相關(guān)蛋白質(zhì)組學研究[D];南京醫(yī)科大學;2006年

5 王鑫;遲鈍愛德華氏菌雙組份系統(tǒng)EsrA-EsrB和QseB-QseC的毒力調(diào)控機制[D];華東理工大學;2011年

6 王廣云;腫瘤基因芯片表達數(shù)據(jù)分析相關(guān)問題研究[D];國防科學技術(shù)大學;2009年

7 楊波;MicroRNA-145在間充質(zhì)干細胞成軟骨分化中的作用及機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2011年

8 喬海fE;TNF-α誘導B16細胞凋亡的核蛋白質(zhì)組研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2005年

9 聶磊;血管活性肽在血管平滑肌細胞中的表達與調(diào)控機制[D];河北醫(yī)科大學;2005年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 石友誼;預(yù)測血清反應(yīng)因子（SRF）共調(diào)控因子及構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[D];西北農(nóng)林科技大學;2012年

2 王妙苗;大鼠骨移植癌痛模型的建立及其機制的初步研究[D];第二軍醫(yī)大學;2008年

3 毛瓊國;人基因組隨機MARs的分離、克隆及其功能的初步研究[D];第三軍醫(yī)大學;2004年

4 孔娟娟;Islet-1在心臟發(fā)育的乙�；{(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的樞紐作用[D];重慶醫(yī)科大學;2012年

5 余瑤;銅綠假單胞菌中rsmA正調(diào)節(jié)基因的篩選及研究[D];西北大學;2013年

6 朱文楠;人類miRNA調(diào)控因子及靶基因的基因本體分析[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2010年

7 陳婷方;腦紅蛋白（NGB）神經(jīng)保護機理與表達調(diào)控及其應(yīng)用的初步研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2005年

8 曲奕;發(fā)現(xiàn)與驗證不同壓力條件下鼠疫菌的非編碼RNA[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院;2011年

，

本文編號：822492