發(fā)布時(shí)間：2017-09-09 20:07

  本文關(guān)鍵詞：小鼠內(nèi)耳發(fā)育核心轉(zhuǎn)錄因子的保守性及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的比較分析

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【摘要】：在脊椎動(dòng)物內(nèi)耳發(fā)育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作為核心調(diào)控基因參與聽(tīng)基板的誘導(dǎo)過(guò)程。文章通過(guò)生物信息學(xué)方法,對(duì)小鼠內(nèi)耳發(fā)育的核心轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行保守性分析并研究其相互調(diào)控關(guān)系,得到小鼠內(nèi)耳發(fā)育過(guò)程中核心轉(zhuǎn)錄因子的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。與文獻(xiàn)中已知的小鼠內(nèi)耳發(fā)育基因調(diào)控關(guān)系相比,Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在內(nèi)耳發(fā)育中仍然起主要調(diào)控者的角色,Six1則處于被多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)的地位,Gbx2、Irx2/3、Msx1在調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中也起到重要作用。對(duì)出現(xiàn)的差異進(jìn)行了合理的分析,同時(shí)結(jié)合構(gòu)建的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)了可能存在的Msx1對(duì)Six1、Gbx2的調(diào)控作用。序列預(yù)測(cè)結(jié)果也發(fā)現(xiàn)了一些新的調(diào)控關(guān)系,所涉及的轉(zhuǎn)錄因子包括Sox5、Lhx2、Rax、Otx1、Otx2、Pitx1、Pitx2、Nkx2-5、Irx4、Irx6、Dlx2、Hmx1/2/3、Pou4f3、Pax4、Tlx2。文章為深入了解內(nèi)耳發(fā)育調(diào)控機(jī)制提供了基礎(chǔ)信息。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;南京醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 內(nèi)耳發(fā)育 轉(zhuǎn)錄因子 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
【基金】：國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):201210312014) 江蘇省高等學(xué)校大學(xué)生實(shí)踐創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(重點(diǎn))(編號(hào)2012JSSPITP1045) 江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程項(xiàng)目資助
【分類(lèi)號(hào)】：R341
【正文快照】： 脊椎動(dòng)物內(nèi)耳的形成起始于菱腦兩側(cè)的表面外胚層,先后經(jīng)過(guò)聽(tīng)基板、聽(tīng)窩、聽(tīng)囊、聽(tīng)泡等階段,發(fā)育為耳蝸囊及前庭囊,逐漸形成內(nèi)耳的完整結(jié)構(gòu)。聽(tīng)基板的誘導(dǎo)是內(nèi)耳發(fā)育過(guò)程中最早發(fā)生的事件之一,是內(nèi)耳形態(tài)發(fā)生的起始事件。位于表面外胚層的前基板區(qū)(Pre-placodal region,PPR)在F

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