華東部分農(nóng)村地區(qū)結(jié)核分枝桿菌的VNTR-MIRU分子特征
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更多相關(guān)文章: 結(jié)核分枝桿菌 VNTR-MIRU 基因分型 成簇
【摘要】:目的評價VNTR-MIRU分型方法在結(jié)核病流行病學中的應用,并描述華東部分農(nóng)村地區(qū)結(jié)核分枝桿菌的基因型分布及成簇特征。方法對浙江省寧波市鄞州區(qū)及江蘇省鹽城市阜寧縣從2009年6月1日至2010年11月31日登記的結(jié)核病患者的結(jié)核分離菌株采用VNTR-MIRU方法進行分型,通過Hunter-Gaston指數(shù)(HGI)及遺傳差異值(h)對MIRU位點進行分辨力及遺傳差異性評價,同時進行問卷調(diào)查以收集患者的社會人口學及臨床治療信息。結(jié)果在297株結(jié)核桿菌分離株中發(fā)現(xiàn)了281種基因型,近期傳播比例為5.4%,MIRU位點組合的分辨力(HGI)為0.9995,7個位點的分辨力大小依次為:VNTR3820Qub18Qub11aMIRU26Qub11bMtub21Qub26,位點的h大小排序與分辨力的大小排序相同,遺傳差異性最大的位點為VNTR3820(h=0.8794),最小的為Qub26(h=0.6613)。比較兩個研究地區(qū)的結(jié)核枝桿菌成簇特征,阜寧縣菌株成簇率為19%,而鄞州區(qū)無菌株成簇,均呈現(xiàn)"唯一"基因型,這種差異的產(chǎn)生很可能與當?shù)氐娜丝谶w徙有關(guān)。結(jié)論 7位點VNTR-MIRU分型法對結(jié)核枝桿菌進行分型簡便快速,而且具有較高的分辨力,適合于結(jié)核的大規(guī)?焖贆z測。我國華東農(nóng)村地區(qū)結(jié)核的流行以既往感染復燃為主,并存在一定比例的近期傳播。
【作者單位】: 復旦大學公共衛(wèi)生學院流行病學教研室-公共衛(wèi)生安全教育部重點實驗室;江蘇省鹽城市阜寧縣疾病預防控制中心;浙江省寧波市鄞州區(qū)疾病預防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 結(jié)核分枝桿菌 VNTR-MIRU 基因分型 成簇
【基金】:國家自然科學基金項目(30800937) 教育部留學回國人員科研啟動基金項目 上海市公共衛(wèi)生重點學科建設計劃(12GWZX0101)~~
【分類號】:R378.911
【正文快照】: 結(jié)核病是當今全球范圍內(nèi)對人類健康最具威脅的重大傳染病,根據(jù)世界衛(wèi)生組織的報告,中國是22個結(jié)核病高負擔國家之一[1]。追蹤傳染源、闡明傳播途徑是防止結(jié)核病流行的研究重點[2],傳統(tǒng)的流行病學方法并不能解決這兩個問題,因此以基因分型技術(shù)為基礎的分子流行病學在現(xiàn)在的研
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本文編號:811855
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