本文關(guān)鍵詞：甲型H1N1流感病毒HA基因的簡單重復(fù)序列預(yù)測

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【摘要】：目的:探討應(yīng)用ARIMA模型對甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因簡單重復(fù)序列(simple sequencerepeats,SSRs)的相對豐度和相對密度值進(jìn)行預(yù)測的可行性,為防控流感流行制定措施提供科學(xué)依據(jù)。方法:應(yīng)用Eviews 6.0軟件對1970～2007年38條同源性相對較高的甲流H1N1流感病毒HA核苷酸序列中SSRs的相對豐度和相對密度進(jìn)行擬合,建立時間序列模型,用模型對2008～2010年SSRs的相對豐度和相對密度進(jìn)行預(yù)測,并用實(shí)際數(shù)據(jù)評估模型預(yù)測效果,進(jìn)而預(yù)測2011年數(shù)據(jù)。結(jié)果:ARIMA模型較好地擬合了既往相對豐度和相對密度的實(shí)際序列,對2008～2010年的相對豐度和相對密度的預(yù)測也獲得了較好的預(yù)測效果。結(jié)論:ARIMA模型能較好地模擬甲型H1N1流感病毒HA基因中SSRs的相對豐度和相對密度的變動趨勢,可用于SSRs相對豐度和相對密度值的短期預(yù)測和動態(tài)分析。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)教研室;南京醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系;
【關(guān)鍵詞】： 時間序列 ARIMA模型 簡單重復(fù)序列 甲型HN流感病毒 預(yù)測
【基金】：南京醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院優(yōu)勢學(xué)科教師培養(yǎng)基金項(xiàng)目(JX10131801099)
【分類號】：R373
【正文快照】： 流感是一種反復(fù)出現(xiàn)的傳染病,在全球有高發(fā)病率和高病死率。每年造成全球約5億人患病,25～50萬人死亡。流感病毒(influenza virus)屬正黏液病毒科,流感病毒屬,包括甲、乙、丙3型,其中甲型抗原變異性最強(qiáng),能感染人類和其他動物,侵襲所有年齡組人群,經(jīng)常引起世界性大流行。甲型

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本文編號：806231