基因水平的關聯(lián)分析方法
發(fā)布時間:2017-09-05 01:13
本文關鍵詞:基因水平的關聯(lián)分析方法
更多相關文章: 基因水平的關聯(lián)分析 全基因組關聯(lián)研究 網絡分析 最顯著SNP法
【摘要】:全基因組關聯(lián)研究(Genome wide association study,GWAS)已經在國內外的醫(yī)學遺傳學研究中得到廣泛應用,但是GWAS數據中所蘊含的與多基因復雜性狀疾病機制相關的豐富信息尚未得到深度挖掘。近年來,研究者采用生物網絡分析和生物通路分析等生物信息學和生物統(tǒng)計學手段分析GWAS數據,并探索潛在的疾病機制。生物網絡分析和生物通路分析主要是以基因為單位進行的,因此必須在分析前將基因上全部或者部分單個單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的遺傳關聯(lián)結果綜合起來,即基因水平的關聯(lián)分析;蛩降年P聯(lián)分析需要考慮單個SNP的遺傳關聯(lián)、基因上SNP數量和SNP之間的連鎖不平衡結構等多種因素,因此不僅在遺傳學的概念上也在統(tǒng)計方法方面具有一定的復雜性和挑戰(zhàn)性。文章對基因水平的關聯(lián)分析的研究進展、原理和應用進行了綜述。
【作者單位】: 寧波大學醫(yī)學院預防醫(yī)學系;
【關鍵詞】: 基因水平的關聯(lián)分析 全基因組關聯(lián)研究 網絡分析 最顯著SNP法
【基金】:浙江省自然科學基金項目(編號:Y2100240) 寧波市自然科學基金項目(編號:2009A610142) 浙江省衛(wèi)生廳基金項目(編號:2009A183) 寧波大學胡嵐優(yōu)秀博士基金資助
【分類號】:R341
【正文快照】: 基于單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide poly-morphism,SNP)的全基因組關聯(lián)研究(Genome wideassociation study,GWAS)已經在國際上醫(yī)學遺傳學的疾病關聯(lián)研究中得到廣泛應用,我國也在系統(tǒng)性紅斑狼瘡[1]、銀屑病[2]、精神分裂癥[3]、甲亢[4]和冠心病[5]等許多多基因復雜性狀疾
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,本文編號:794938
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