本文關(guān)鍵詞：剛地弓形蟲蘋果酸脫氫酶基因編碼蛋白主要特性與抗原表位的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 剛地弓形蟲 蘋果酸脫氫酶 生物信息學(xué) 抗原表位 免疫原性

【摘要】：目的用生物信息學(xué)方法分析剛地弓形蟲蘋果酸脫氫酶(TgMDH)基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)與抗原表位,預(yù)測(cè)該蛋白的免疫原性。方法利用蛋白分析專家系統(tǒng)(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan和NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息學(xué)在線分析程序,結(jié)合Gene Runner和DNAMAN等生物信息學(xué)軟件,分析并預(yù)測(cè)TgMDH蛋白的開放閱讀框、理化性質(zhì)、可溶性、信號(hào)肽、跨膜區(qū)、表面可及性、可塑性、親(疏)水性、翻譯后修飾位點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)及抗原表位,通過CPHmodels程序預(yù)測(cè)該蛋白的三維空間結(jié)構(gòu)。結(jié)果 TgMDH蛋白由316個(gè)氨基酸組成,分子式為C1498H2454N402O440S20,分子質(zhì)量單位為33 777.5,等電點(diǎn)為6.01,波長(zhǎng)280nm時(shí)的吸光度(A)值為0.364,半衰期為30h,有9個(gè)表面可及性參數(shù)≥1.9的區(qū)域、4個(gè)親水性參數(shù)得分≥1.9的區(qū)域、7個(gè)柔韌性參數(shù)得分≥2的區(qū)域、14個(gè)翻譯后修飾位點(diǎn)和14個(gè)潛在抗原表位,為可溶性表達(dá)蛋白。結(jié)論 TgMDH基因編碼蛋白為可溶性蛋白,有多個(gè)抗原表位,具有免疫原性,可作為弓形蟲病疫苗候選抗原。
【作者單位】： 徐州醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 剛地弓形蟲 蘋果酸脫氫酶 生物信息學(xué) 抗原表位 免疫原性
【基金】：江蘇省寄生蟲病預(yù)防與控制高技術(shù)平臺(tái)開放課題(No.WK009-003) 徐州醫(yī)學(xué)院科研課題(No.2012KJ08)聯(lián)合資助~~
【分類號(hào)】：R392
【正文快照】： 剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii,Tg)是一種專性細(xì)胞內(nèi)寄生原蟲,可引起人獸共患弓形蟲病,尚無防治本病的理想藥物,篩選有效的保護(hù)性抗原研制疫苗是關(guān)鍵所在[1]。蘋果酸脫氫酶(malate dehydrogenase,MDH)是細(xì)胞在有氧條件下進(jìn)行三羧酸循環(huán)的重要酶之一[2-4]。MDH在細(xì)胞的多種生

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 呂燕波,萬瑛,吳玉章;SARS病毒S蛋白的B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2004年02期

2 王芬;王海龍;殷麗天;孟曉麗;劉紅麗;殷國(guó)榮;;剛地弓形蟲磷酸甘油酸酯變位酶2基因編碼蛋白主要特性與抗原表位的生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)病原生物學(xué)雜志;2010年11期

3 申川軍,何藹,鄭小英,余南,鄭斌,鄭煥欽,李卓雅,曹愛蓮,詹希美;剛地弓形蟲LDH-Like MDHcDNA的克隆和序列分析[J];中國(guó)人獸共患病雜志;2005年06期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉麗娜;潘渠;朱軍民;叢延廣;劉紅美;李程;;2-型豬鏈球菌保護(hù)性抗原RfeA的B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[J];成都醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2011年02期

2 李陽,倪兵,石辛甫,吳玉章,王希良,何仰東,肖宇,姜曼,黎萬玲;RNA干擾能有效抑制SARS相關(guān)冠狀病毒復(fù)制[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2004年02期

3 李陽,倪兵,石辛甫,王希良,何仰東,肖宇,姜曼,黎萬玲,吳玉章;質(zhì)粒表達(dá)型siRNA對(duì)SARS-CoV復(fù)制與感染干擾的初步研究[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2005年02期

4 李陽;倪兵;;RNA干擾與人類疾病[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2005年23期

5 董偉強(qiáng);白波;林勇平;高俊;余楠生;;SARS-COV功能受體hACE2mRNA在人股骨頭中表達(dá)的檢測(cè)[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2008年03期

6 江濤;馬立安;趙俊龍;;弓形蟲MIC3蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)及B細(xì)胞抗原表位預(yù)測(cè)[J];長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版)醫(yī)學(xué)卷;2007年01期

7 任文凱;劉建飛;彭遠(yuǎn)義;;豬水腫病大腸桿菌FedF的B細(xì)胞抗原表位預(yù)測(cè)[J];吉林畜牧獸醫(yī);2009年10期

8 格日勒?qǐng)D,嚴(yán)若峰,徐立新,李祥瑞;雞柔嫩艾美爾球蟲第二代裂殖子表面抗原MZ5-7基因的克隆、表位分析及原核表達(dá)[J];寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報(bào);2005年04期

9 黃平;俞守義;柯昌文;;逐步預(yù)測(cè)和統(tǒng)計(jì)學(xué)篩選人H_5N_1毒株神經(jīng)氨酸酶蛋白B細(xì)胞表位[J];科學(xué)通報(bào);2008年22期

10 魏戰(zhàn)勇;王學(xué)斌;黃克和;金喜新;崔保安;;豬細(xì)小病毒NJ-1株VP2基因克隆與抗原性分析[J];河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2007年01期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 孫平平;基于噬菌體組合肽庫篩選的B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)研究[D];東北師范大學(xué);2011年

2 魏戰(zhàn)勇;豬細(xì)小病毒體外增殖的抑制因素、VP2基因變異及核酸疫苗的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

3 格日勒?qǐng)D;雞柔嫩艾美爾球蟲（E.tenella）MZ5-7基因免疫調(diào)節(jié)型DNA疫苗的構(gòu)建及其免疫保護(hù)性試驗(yàn)[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

4 劉懷然;SARS冠狀病毒S糖蛋白基因片段的表達(dá)及初步應(yīng)用[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

5 王瑞琳;SARS冠狀病毒分離鑒定、疫苗構(gòu)建及免疫血清制備研究[D];吉林大學(xué);2006年

6 林劍萍;重組SARS-CoV S蛋白表位肽疫苗的研究[D];吉林大學(xué);2005年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 王芬;剛地弓形蟲磷酸甘油酸變位酶2基因的生物信息學(xué)分析、克隆表達(dá)及免疫保護(hù)性研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2011年

2 李陽;RNAi抑制SARS病毒復(fù)制與感染的實(shí)驗(yàn)研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2004年

3 楊敏;豬流行性腹瀉病毒結(jié)構(gòu)蛋白基因的克隆與特征分析[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

4 肖潔;梅毒螺旋體特異診斷抗原的篩選、制備及臨床應(yīng)用初探[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2007年

5 王曉佳;SARS冠狀病毒S糖蛋白基因的克隆表達(dá)[D];吉林大學(xué);2008年

6 王憲靈;重組TP47、TP0453抗原優(yōu)勢(shì)表位區(qū)段在梅毒螺旋體感染診斷中的應(yīng)用研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2008年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 吳玉章,劉茂昌,賈正才,鄒麗云;HBV新型免疫原的設(shè)計(jì)、合成及免疫原性研究[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2000年10期

2 吳玉章,朱錫華;一種病毒蛋白B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)方法的建立[J];科學(xué)通報(bào);1994年24期

3 呂燕波,萬瑛,吳玉章;SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[J];免疫學(xué)雜志;2003年06期

4 韓立敏;王U喼，

本文編號(hào)：741230