本文關鍵詞：基于氨基酸性質的EB病毒抗原MHC-Ⅰ類分子限制性表位的定量構效關系建模

  更多相關文章： EB病毒 表位 平衡解離常數 構效關系 腫瘤

【摘要】：目的建立EB病毒(EBV)抗原表位的理論計算模型并用于其定量預測,為腫瘤免疫的多肽疫苗設計提供理論基礎。方法從表位數據庫中收集33條EBV抗原表位,使用逐步回歸(STR)方法篩選2個對平衡解離常數(KD)貢獻較大的結構參數用于表位的結構表征,最后用多元線性回歸(MLR)方法建立結構參數與KD的定量構效關系(QSAR)模型。結果該模型具有較好的穩(wěn)定性(R2=0.637,Q2=0.581)與預測能力(R2test=0.501)。結論此方法可確定表位中各個氨基酸的物理性質對于平衡解離常數的貢獻,為表位設計與改造提供直接線索;STR和MLR相結合建模方法具有物化意義明確、易于解釋及操作簡便易行等優(yōu)點。
【作者單位】： 重慶理工大學藥學與生物工程學院;
【關鍵詞】： EB病毒 表位 平衡解離常數 構效關系 腫瘤
【基金】：國家自然科學基金項目(60873103);國家自然科學基金重點項目(30830090) 重慶市自然科學基金(CSTC,2010BB5306)
【分類號】：R392.9
【正文快照】： EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一種γ皰疹病毒,感染全球超過90%的人群[1]。體外研究顯示,EBV在感染前通過補體2(CD2)潛伏在B淋巴細胞中;在體內通過正常B細胞實現(xiàn)持續(xù)感染[2]。EBV感染初期可引起宿主短期的B淋巴細胞增殖,通常可通過自身限制以及激活T細胞免疫響應得以控制

【相似文獻】

中國期刊全文數據庫 前10條

1 羅春艷;謝曉利;張楊;王湘屏;賀榮芳;唐運蓮;甘潤良;;EB病毒轉化淋巴母細胞LMP-1,LMP-2A及LMP-2B的表達[J];免疫學雜志;2011年08期

2 ;[J];;年期

3 ;[J];;年期

4 ;[J];;年期

5 ;[J];;年期

6 ;[J];;年期

7 ;[J];;年期

8 ;[J];;年期

9 ;[J];;年期

10 ;[J];;年期

中國重要會議論文全文數據庫 前6條

1 張衍國;劉玉峰;高大文;付萌;李魏;;EB病毒蛋白對抗角蛋白自身抗體產生的調節(jié)作用[A];2003中國中西醫(yī)結合皮膚性病學術會議論文匯編[C];2003年

2 周淑佩;劉冕;胡建國;陳寶軍;李佳禮;;EB病毒BLLF1轉基因小鼠的SPF化[A];中國實驗動物學會第七屆學術年會論文集[C];2006年

3 郭長占;周為民;谷淑燕;;EB病毒BLLF1基因轉基因小鼠淋巴瘤模型的建立[A];中國實驗動物學會第七屆學術年會論文集[C];2006年

4 陳云;姚X;許文嶸;徐建;尹全章;;重疊PCR合成LMP2A抗原表位片段及其在大腸桿菌中表達和免疫原性分析[A];中國免疫學會第五屆全國代表大會暨學術會議論文摘要[C];2006年

5 翁秀芳;陳浩;吳雄文;梁智輝;韓軍艷;黃亞非;龔非力;;可溶性HLA-A2-肽復合物的體外折疊與生物素化[A];湖北省暨武漢市免疫學會第八屆學術會議論文集[C];2003年

6 黃維金;張春濤;趙晨燕;聶建輝;宋愛京;王佑春;;我國不同艾滋病候選疫苗小鼠細胞免疫應答評價[A];2010年中國藥學大會暨第十屆中國藥師周論文集[C];2010年

中國重要報紙全文數據庫 前2條

1 吳一福;天然抗角蛋白自身抗體研究進展[N];中國醫(yī)藥報;2003年

2 葉 茂;如何篩選阻斷致瘤病毒復制的藥物[N];中國中醫(yī)藥報;2004年

中國博士學位論文全文數據庫 前10條

1 李揚;肺炎克雷伯菌免疫相關表位篩選及其實驗免疫研究[D];吉林大學;2010年

2 尚小云;基于NY-ESO-1_（157-165）表位的治療性疫苗的分子設計與免疫學特性研究[D];第三軍醫(yī)大學;2009年

3 張福明;網狀分枝擴增技術檢測EB病毒基因的方法建立及臨床應用研究[D];吉林大學;2004年

4 張衍國;EB病毒蛋白對培養(yǎng)B細胞產生免疫球蛋白的影響及gp350相關肽段的克隆和表達[D];第四軍醫(yī)大學;2002年

5 王冰;EB病毒潛伏膜蛋白2A特異性CTL表位篩選及免疫功能研究[D];南京醫(yī)科大學;2009年

6 賈春實;一、Spike蛋白來源B細胞表位多肽及抗體在SARS冠狀病毒感染中作用機制研究 二、EV71病毒基因工程亞單位疫苗的制備及鑒定[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2009年

7 孫萍;特異性沉默EBV潛伏期基因BHRF1pSUPER retro RNAi系統(tǒng)的構建和初步應用[D];山東大學;2006年

8 劉珊珊;結核分枝桿菌H37Rv感染期表面蛋白篩選及宿主相關免疫應答研究[D];吉林大學;2012年

9 王琳;gp350影響培養(yǎng)CD5～+B細胞免疫球蛋白產生及其機理的研究[D];第四軍醫(yī)大學;2004年

10 楊玉芳;用LMP1構建重組慢病毒載體及建立轉基因小鼠模型[D];第一軍醫(yī)大學;2004年

中國碩士學位論文全文數據庫 前10條

1 鄭禮娜;蝦類過敏原的活性分析及其抗原表位的研究[D];中國海洋大學;2011年

2 鈕柏琳;樹狀串聯(lián)hTERT表位多肽負載MDC疫苗體外激發(fā)抗HLA-A2+腫瘤細胞免疫應答的效應研究[D];重慶醫(yī)科大學;2011年

3 徐永春;EB病毒Rta重組蛋白多克隆抗體的制備與初步應用研究[D];四川大學;2005年

4 趙金華;EWS-FLI1融合區(qū)與HLA-A*0201限制性CTL表位的實驗研究[D];南昌大學;2010年

5 高玉;EB病毒潛伏期膜蛋白LMP2A對胃癌細胞增殖和凋亡的影響[D];青島大學;2007年

6 姚翠梅;結核分枝桿菌RD區(qū)蛋白CD4~+T細胞表位篩選及功能研究[D];吉林大學;2012年

7 吳喜林;靶向誘導GPG抗體及基序免疫概念論證[D];南京大學;2012年

8 許文嶸;EB病毒潛伏膜蛋白2A多表位重組基因在大腸桿菌中的表達、純化、單克隆抗體的制備及其在血清學檢測中的應用[D];南京醫(yī)科大學;2007年

9 劉敏娟;EBV體外轉染人B淋巴細胞方法的優(yōu)化及B淋巴母細胞樣細胞系的體外建立[D];蘇州大學;2009年

10 王文博;HBV相關抗原HLA-A3超型CTL表位的預測與鑒定[D];第三軍醫(yī)大學;2011年

，

本文編號：552208