微陣列數(shù)據(jù)分析和錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率
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【摘要】:目的:介紹微陣列數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析和基于錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的多重假設(shè)檢驗(yàn)。方法:通過t檢驗(yàn)對一個(gè)關(guān)于前列腺癌的微陣列數(shù)據(jù)進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,采用BH程序進(jìn)行錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的控制和經(jīng)驗(yàn)估計(jì)。結(jié)果:當(dāng)錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率為0.05時(shí)通過BH程序得到21個(gè)差異表達(dá)基因;當(dāng)以|t|≥3作為拒絕域時(shí),得到105個(gè)基因,對應(yīng)的錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率估計(jì)值為0.20。結(jié)論:相對傳統(tǒng)的總體錯(cuò)誤率,錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率更加適合于微陣列這種高維數(shù)據(jù)多重比較的錯(cuò)誤控制;而且能同時(shí)控制或估計(jì)錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率。
【作者單位】: 徐州醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】: 微陣列數(shù)據(jù) 多重假設(shè)檢驗(yàn) 錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率 控制和估計(jì) 前列腺癌
【基金】:江蘇省教育廳高校哲學(xué)社會(huì)科學(xué)研究基金資助項(xiàng)目2010SJB790037 徐州醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院科研課題資助項(xiàng)目201107,201115
【分類號】:R737.25
【正文快照】: 現(xiàn)代生物和醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展使得人們能夠收集到大量的數(shù)據(jù),微陣列技術(shù)是其中的著名代表,為人們提供了一種從沒有過的醫(yī)學(xué)實(shí)踐方式。微陣列技術(shù)用含有成千上萬種的DNA或者蛋白質(zhì)序列的微小玻璃芯片取代傳統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)中的凝膠、濾器和純化柱,使得科學(xué)家們能夠在基因組規(guī)模上對基
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中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 李靖U,
本文編號:525977
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