人三葉因子3基因啟動子區(qū)的生物信息學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞:人三葉因子3基因啟動子區(qū)的生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的人三葉因子3(human trefoil factor 3,hTFT3)是一種具有胃腸黏膜修復(fù)和保護(hù)作用的小分子多肽,文中利用生物信息學(xué)在線軟件預(yù)測hTFF3基因啟動子功能。方法獲取hTFF3基因啟動子全長序列,利用多種在線相關(guān)軟件預(yù)測出CpG島及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合部位。結(jié)果 hTFF3基因序列全長為2295 bp,核苷酸數(shù)據(jù)庫(GenBank)登錄號為AB038162.1。hTFF3啟動子存在于非編碼區(qū)上游1500bp內(nèi),啟動子序列中未發(fā)現(xiàn)CpG島,啟動子區(qū)共發(fā)現(xiàn)204個轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)論生物信息學(xué)在線軟件能預(yù)測hTFF3基因啟動子功能,提高了針對啟動子的研究效率。
【作者單位】: 中國人民解放軍第九七醫(yī)院燒傷整形科;
【關(guān)鍵詞】: 人三葉因子 啟動子 生物信息學(xué) 轉(zhuǎn)錄因子
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81100252) 南京軍區(qū)醫(yī)學(xué)科研課題重點(diǎn)項目(09Z007)
【分類號】:R341
【正文快照】: 0引言三葉因子3(trefoil factor family 3,TFF3)又稱腸三葉因子,是一種分子量為6700的小分子多肽,屬于三葉因子家族,含有一個特殊的三葉因子結(jié)構(gòu)域。三葉因子結(jié)構(gòu)域由38~39個氨基酸殘基組成,其中含6個半胱氨酸,按照1-5,2-4,3-6的順序依次形成3個二硫鍵,從而產(chǎn)生特異而穩(wěn)定的
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 袁媛;趙明;;糖尿病足截肢患者下肢血管缺氧誘導(dǎo)因子-1α及血管內(nèi)皮生長因子的表達(dá)[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2011年05期
2 陳建國;孟慶楠;趙德梅;譚謙;;胰島素樣細(xì)胞生長因子-1、堿性成纖維細(xì)胞生長因子及轉(zhuǎn)化生長因子α對人表皮干細(xì)胞增殖的影響[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2012年08期
【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 楊曉紅;劉改榮;解凡;羅宏賓;翁鶴;李園園;曹毅;陶茂燦;;糖足合劑對糖尿病足大鼠肢端壞疽相關(guān)血管因子的影響[J];中華中醫(yī)藥學(xué)刊;2013年04期
【二級參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條
1 彭永平;吳宗貴;江時森;宮劍濱;王立軍;何松清;林欣;;冠心病合并2型糖尿病高齡患者經(jīng)皮冠狀動脈介入治療的臨床觀察[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2009年10期
2 李冬梅;李倩;張穎;陶小軍;高谷;丁波;馬建華;;白細(xì)胞介素與2型糖尿病患者的代謝綜合征多重危險因素的相關(guān)性研究[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2010年01期
3 王書奎;;胰島素樣生長因子2的基因組印跡及與腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2010年02期
4 譚謙;;再生醫(yī)學(xué)與組織工程[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2011年02期
5 孫曉艷;付小兵;盛志勇;張翠萍;孫同柱;;胚胎組織提取液影響表皮干細(xì)胞表型變化的初步研究[J];中國病理生理雜志;2008年05期
6 邢傳平,劉斌,董亮;免疫組織化學(xué)標(biāo)記結(jié)果的判斷方法[J];中華病理學(xué)雜志;2001年04期
7 趙海波,羅麗蘭,劉義;胰島素樣生長因子-Ⅰ對卵母細(xì)胞成熟度、受精力及卵裂力的影響[J];中華婦產(chǎn)科雜志;1997年10期
8 王爭,張紀(jì)蔚,張柏根;糖尿病足動脈缺血患者骨骼肌血管內(nèi)皮生長因子基因表達(dá)[J];中華外科雜志;2002年07期
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 王建軍,成軍,劉妍,楊倩,紀(jì)冬,王春花;乙型和丙型肝炎病毒與轉(zhuǎn)錄因子AP-1[J];世界華人消化雜志;2004年01期
2 亓濤;姚成;鄭磊;王前;;疾病相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)性初篩的生物信息學(xué)策略及實(shí)驗驗證[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2006年24期
3 路艷萍;;細(xì)菌轉(zhuǎn)錄器內(nèi)的蛋白-蛋白相互作用[J];國外醫(yī)學(xué)(微生物學(xué)分冊);1994年02期
4 徐艷瓊;李愛萍;陳瑞;周建偉;;JWA在N-甲基-N’-硝基-N-亞硝基胍誘導(dǎo)的人支氣管上皮細(xì)胞凋亡中的作用[J];中華勞動衛(wèi)生職業(yè)病雜志;2006年04期
5 郇天笑;王澤;張輝;白增亮;;甲胎蛋白分子演化的生物信息學(xué)分析[J];山東大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版);2007年03期
6 馮春瓊;鄒亞光;李鐵求;周其趙;李飛;梁爽;毛向明;;基于生物信息學(xué)的精子特異表達(dá)基因的挖掘[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2009年02期
7 王晗知;蔡文琴;肖嵐;;少突膠質(zhì)細(xì)胞發(fā)育分化的轉(zhuǎn)錄調(diào)控[J];生理科學(xué)進(jìn)展;2009年04期
8 徐京寧,李凡超,王二力,唐孝宣,俞俊棠,劉新垣;干擾素基因工程菌產(chǎn)物表達(dá)數(shù)學(xué)模型的研究[J];生物工程學(xué)報;1997年01期
9 歐和生,唐朝樞;應(yīng)激活化蛋白激酶研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué).生理.病理科學(xué)與臨床分冊;1997年04期
10 菅金龍,朱勇,李德敏,歐陽為明,金伯泉;人CD226基因SNP和啟動子序列分析[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2002年03期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 徐明旭;賴茂毅;程寧;丁培國;夏東嵐;芮珉;王鶯;張穎妹;王露;韓文玲;馬大龍;;CKLF基因與CKLFSF1基因間的順式調(diào)控元件[A];中國免疫學(xué)會第四屆學(xué)術(shù)大會會議議程及論文摘要集[C];2002年
2 邢宏運(yùn);劉霆;龔玉萍;;轉(zhuǎn)錄因子SCL/TAL1在人胚胎干細(xì)胞造血分化中的作用[A];第12屆全國實(shí)驗血液學(xué)會議論文摘要[C];2009年
3 孟丹;陳思峰;;轉(zhuǎn)錄因子Bach1負(fù)性調(diào)節(jié)Wnt/ β -Catenin信號通路[A];第八屆海峽兩岸心血管科學(xué)研討會論文集[C];2011年
4 楊立勇;楊永年;陳志堅;;轉(zhuǎn)錄因子NF-kB在IL-1等細(xì)胞因子誘導(dǎo)的INS-1細(xì)胞損害中的作用[A];中華醫(yī)學(xué)會第六次全國內(nèi)分泌學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2001年
5 王智宇;童強(qiáng)松;曾甫清;劉媛;顧朝輝;鄭麗端;蔡嘉斌;蔣國松;;小鼠睪丸特異性基因TSEG-4的克隆及表達(dá)分析[A];第十五屆全國泌尿外科學(xué)術(shù)會議論文集[C];2008年
6 朱莉萍;蘇遠(yuǎn);陳桃香;羅有根;陳鳳容;王迪潯;胡清華;;人氣道上皮細(xì)胞鈣振蕩模型的建立[A];湖北省暨武漢市病理生理學(xué)會第十四屆學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2008年
7 王秀亮;陳衛(wèi);梁光萍;陳建;蘇踴躍;楊陳;羅向東;;人β1整合素遠(yuǎn)端啟動子542bp報告基因載體構(gòu)建和鑒定及啟動活性分析[A];第六屆全國燒傷救治專題研討會論文匯編[C];2009年
8 裴建;李海燕;張冬青;;IL-2R信號通路中STAT5對轉(zhuǎn)錄因子Foxp3表達(dá)的調(diào)控[A];第五屆全國中醫(yī)藥免疫學(xué)術(shù)研討會——暨環(huán)境·免疫與腫瘤防治綜合交叉會議論文匯編[C];2009年
9 邱潔;周曉玉;程銳;張敏;張春梅;季晨博;高春林;郭錫熔;;人類肥胖相關(guān)新基因LYRM1的生物信息學(xué)分析及TA克隆載體的構(gòu)建[A];第六屆江浙滬兒科學(xué)術(shù)會議暨兒科學(xué)基礎(chǔ)與臨床研究進(jìn)展學(xué)術(shù)班論文匯編[C];2009年
10 傅勤慧;李海燕;裴建;張冬青;;IL-2R信號通路中STAT5對轉(zhuǎn)錄因子Foxp3表達(dá)的調(diào)控[A];第十五屆針灸對機(jī)體功能的調(diào)節(jié)機(jī)制及針灸臨床獨(dú)特經(jīng)驗研討會暨第十一屆針灸經(jīng)絡(luò)學(xué)術(shù)研討會會議論文集[C];2010年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 陳勇;專家有突破 借助基因殺死癌細(xì)胞[N];人民日報;2005年
2 記者 陳勇;基因療法治癌,美攻克關(guān)鍵障礙[N];新華每日電訊;2005年
3 記者 何德功;抗癌病毒可以破壞癌細(xì)胞[N];新華每日電訊;2002年
4 香港麥迪信醫(yī)學(xué)出版有限公司 供稿;凋亡與腫瘤:一對矛盾的連體嬰[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2002年
5 本報記者 馮衛(wèi)東;向左分裂向右分化[N];科技日報;2009年
6 楊茜;美建立造血干細(xì)胞分化調(diào)控模型[N];中國醫(yī)藥報;2006年
7 白毅;Id蛋白助胚胎神經(jīng)干細(xì)胞維持穩(wěn)定[N];中國醫(yī)藥報;2007年
8 胡德榮;我國揭示NF—κB細(xì)胞核內(nèi)調(diào)控新機(jī)制[N];中國醫(yī)藥報;2007年
9 記者 耿挺;為T細(xì)胞“戰(zhàn)士”打造“武器”[N];上?萍紙;2008年
10 白毅;β—arrestin1蛋白核內(nèi)新功能被發(fā)現(xiàn)[N];中國醫(yī)藥報;2008年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 菅金龍;CD226基因表達(dá)調(diào)控的研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2005年
2 呂萍;小鼠Lrp5基因表達(dá)調(diào)控的研究[D];山東大學(xué);2005年
3 祝秉東;人β-防御素-1基因表達(dá)與轉(zhuǎn)錄調(diào)控[D];四川大學(xué);2004年
4 孫海晶;p300/HDAC介導(dǎo)的可逆的乙酰化修飾參與Th1細(xì)胞因子IL-12和IL-18基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控[D];東北師范大學(xué);2004年
5 甄一松;用心臟順式調(diào)控模塊預(yù)測心臟特異表達(dá)基因[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2005年
6 王群;轉(zhuǎn)錄因子MEF2A基因多態(tài)性及其突變型體外活性的研究[D];北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所;2006年
7 蔣磊;心肌缺血預(yù)適應(yīng)上調(diào)新基因Mipu1的結(jié)構(gòu)與功能研究[D];中南大學(xué);2007年
8 戰(zhàn)軍;人維生素D_3受體對免疫相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控及其機(jī)制的初探[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);1998年
9 王爽;人SPLUNC1基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制的初步研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2007年
10 溫冬青;US28調(diào)節(jié)MIE基因介導(dǎo)的人巨細(xì)胞病毒活化的通路研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2009年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 方志友;合成PHA基因組克隆片段的序列分析及相關(guān)基因的分離[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年
2 黃欣瓊;人類心臟發(fā)育候選基因ZNF569的研究[D];湖南師范大學(xué);2005年
3 吳濱;人;o酶A:膽固醇;D(zhuǎn)移酶-1基因P1啟動子的TNF-α效應(yīng)元件分析鑒定[D];華東師范大學(xué);2004年
4 趙蕾;人UBF新基因功能的初步研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2005年
5 鄭小莉;ONO-AE-248誘發(fā)中性粒細(xì)胞非凋亡性程序化死亡的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];瀘州醫(yī)學(xué)院;2006年
6 尚璇;H5N1亞型禽流感防疫中應(yīng)用生物信息學(xué)研究免疫方案的探討[D];華中科技大學(xué);2007年
7 周伏圣;COL11A1基因啟動子多態(tài)與漢族人身高的關(guān)聯(lián)分析[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2009年
8 萬祥輝;HCV基因分型及基于基因型的抗原表位預(yù)測研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2009年
9 吳智寧;漢族人群VKORC1啟動子基因多態(tài)性與華法林劑量相關(guān)性研究[D];中南大學(xué);2009年
10 田雪君;JNK的激活通過c-Jun蛋白在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)節(jié)Mule的表達(dá)[D];浙江理工大學(xué);2011年
本文關(guān)鍵詞:人三葉因子3基因啟動子區(qū)的生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:468220
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/jichuyixue/468220.html