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人三葉因子3基因啟動子區(qū)的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2017-06-21 09:17

  本文關(guān)鍵詞:人三葉因子3基因啟動子區(qū)的生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的人三葉因子3(human trefoil factor 3,hTFT3)是一種具有胃腸黏膜修復(fù)和保護(hù)作用的小分子多肽,文中利用生物信息學(xué)在線軟件預(yù)測hTFF3基因啟動子功能。方法獲取hTFF3基因啟動子全長序列,利用多種在線相關(guān)軟件預(yù)測出CpG島及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合部位。結(jié)果 hTFF3基因序列全長為2295 bp,核苷酸數(shù)據(jù)庫(GenBank)登錄號為AB038162.1。hTFF3啟動子存在于非編碼區(qū)上游1500bp內(nèi),啟動子序列中未發(fā)現(xiàn)CpG島,啟動子區(qū)共發(fā)現(xiàn)204個轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)論生物信息學(xué)在線軟件能預(yù)測hTFF3基因啟動子功能,提高了針對啟動子的研究效率。
【作者單位】: 中國人民解放軍第九七醫(yī)院燒傷整形科;
【關(guān)鍵詞】人三葉因子 啟動子 生物信息學(xué) 轉(zhuǎn)錄因子
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81100252) 南京軍區(qū)醫(yī)學(xué)科研課題重點(diǎn)項目(09Z007)
【分類號】:R341
【正文快照】: 0引言三葉因子3(trefoil factor family 3,TFF3)又稱腸三葉因子,是一種分子量為6700的小分子多肽,屬于三葉因子家族,含有一個特殊的三葉因子結(jié)構(gòu)域。三葉因子結(jié)構(gòu)域由38~39個氨基酸殘基組成,其中含6個半胱氨酸,按照1-5,2-4,3-6的順序依次形成3個二硫鍵,從而產(chǎn)生特異而穩(wěn)定的

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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5 本報記者 馮衛(wèi)東;向左分裂向右分化[N];科技日報;2009年

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