目的利用生物信息學(xué)方法對F13A1及其編碼蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,為F13A1的實驗研究提供理論基礎(chǔ)和新線索。方法從UCSC(http://genome.ucsc.edu/index.html)數(shù)據(jù)庫檢索"F13A1",下載F13A1蛋白序列,截取轉(zhuǎn)錄起始點上游2000 bp堿基序列作為啟動子區(qū)域進(jìn)行分析,分析F13A1編碼蛋白的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、信號肽和跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、相互作用網(wǎng)絡(luò)及GO注釋。結(jié)果 F13A1包含多個啟動區(qū)域,不存在CpG島,但存在SRF、Sp1和AP-1等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。F13A1編碼蛋白是由732個氨基酸組成的無信號肽、無跨膜區(qū)域的親水蛋白,其主要定位于細(xì)胞核,二級結(jié)構(gòu)以隨機(jī)卷曲為主。另外蛋白F13B、FGA、FGG、F2、FGB、FN1、SERPINF2、VWF、VEGFA、F5可能與F13A1存在相互作用。結(jié)論 F13A1基因存在多個啟動子區(qū)域,擁有多個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點;F13A1蛋白與F13B、FGA、FGG、F2等多個蛋白質(zhì)相互作用,其參與組成內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔、血小板α顆粒內(nèi)腔以及細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器腔等多種細(xì)胞成分,同時在血液凝固、纖維蛋白溶解和血小板活化等多種生理...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 資料來源
    1.2 方法
2 結(jié)果
    2.1 F13A1基因特征
    2.2 F13A1基因啟動子分析
    2.3 F13A1基因CpG島預(yù)測
    2.4 F13A1基因轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測
    2.5 F13A1蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)分析
    2.6 F13A1蛋白的亞細(xì)胞定位、信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    2.7 F13A1蛋白二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.8 F13A1蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析F13A1蛋白質(zhì)的潛在功能
3 討論



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