發(fā)布時(shí)間：2024-09-17 16:11

　　人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)是主要寄生于人和豬小腸中的寄生線蟲(chóng),易引起蛔蟲(chóng)病,嚴(yán)重危害人類健康,同時(shí)也對(duì)養(yǎng)豬業(yè)造成巨大損失。為此,許多國(guó)家十分重視人、畜蛔蟲(chóng)病的防控。關(guān)于人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)形態(tài)學(xué)、生理生化、細(xì)胞免疫和分子生物學(xué)等方面的比較分析,表明這兩種宿主的蛔蟲(chóng)有相似的形態(tài)和遺傳結(jié)構(gòu),且偶有交叉感染的現(xiàn)象,這些結(jié)果使得人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)的分類學(xué)問(wèn)題一直存在爭(zhēng)議,也是研究熱點(diǎn)。以往大多數(shù)的分子系統(tǒng)學(xué)和分子遺傳學(xué)研究是基于線粒體或微衛(wèi)星等分子標(biāo)記,在基因組水平未見(jiàn)報(bào)道。本研究首次基于全基因組測(cè)序,分析了人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)種群差異和遺傳分化特征以及蛔蟲(chóng)的線粒體全基因組系統(tǒng)發(fā)育,開(kāi)發(fā)了豬蛔蟲(chóng)基因組微衛(wèi)星分子標(biāo)記,為進(jìn)一步開(kāi)展人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)種群遺傳、分子流行病學(xué)和分類鑒定等提供基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下:1.通過(guò)HiseqXten測(cè)序平臺(tái)對(duì)人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)種群進(jìn)行全基因組重測(cè)序,質(zhì)控后共獲得134.085Gb高質(zhì)量數(shù)據(jù),分別檢測(cè)到6525078個(gè)和4260867個(gè)SNP。群體進(jìn)化樹(shù)、主成分及群體結(jié)構(gòu)三種分析均顯示,人蛔蟲(chóng)種群和豬蛔蟲(chóng)種群表現(xiàn)出明顯的遺傳分化,且連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)人蛔蟲(chóng)種群比豬蛔蟲(chóng)種群更原始。2.選擇性消除分析...

【文章頁(yè)數(shù)】：77 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.1豬蛔蟲(chóng)生活史Fig1.1LifecycleofA.suum

圖1.1豬蛔蟲(chóng)生活史Fig1.1LifecycleofA.suum（http://cal.vet.upenn.edu/projects/merial/Ascarids/Asc₁5a.html）一期幼蟲(chóng)；B：第二期幼蟲(chóng)；C：第三期幼蟲(chóng)；D：第四....

圖2.1人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)DNA樣本電泳結(jié)果

2.1.3.6種群歷史動(dòng)態(tài)分析基于人蛔蟲(chóng)種群和豬蛔蟲(chóng)種群的高質(zhì)量的SNP標(biāo)記，通過(guò)SNP間的連鎖不平衡對(duì)有效群體的大小進(jìn)行估算，以PSMC方法計(jì)算種群不同歷史時(shí)期有效群體的大小。2.2結(jié)果2.2.1測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)本研究基于HiseqXten平臺(tái)對(duì)人蛔蟲(chóng)種群和豬....

圖2.2人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)堿基錯(cuò)誤率分布圖

圖2.2人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)堿基錯(cuò)誤率分布圖Fig.2.2DistributionofsequencingerrorrateforA.lumbricoidesandA.suum2.2.3測(cè)序質(zhì)量分布情況本研究中測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量主要分布在Q20以上（圖2....

圖2.3人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)測(cè)序質(zhì)量分布圖

圖2.2人蛔蟲(chóng)和豬蛔蟲(chóng)堿基錯(cuò)誤率分布圖Fig.2.2DistributionofsequencingerrorrateforA.lumbricoidesandA.suum2.2.3測(cè)序質(zhì)量分布情況本研究中測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量主要分布在Q20以上（圖2....

本文編號(hào)：4005707