基于線粒體COⅠ基因的廣西不同地區(qū)福壽螺遺傳多態(tài)性分析
發(fā)布時(shí)間:2024-03-21 22:59
目的通過對廣西不同地區(qū)福壽螺的COⅠ基因進(jìn)行分析,以了解廣西福壽螺種群的遺傳多態(tài)性。方法從南寧市橫縣、桂林市全州縣和荔浦縣、賀州市富川縣、百色市田林縣和崇左市憑祥縣共計(jì)6個(gè)縣區(qū)采集福壽螺樣本,提取DNA并進(jìn)行COⅠ基因的PCR擴(kuò)增及測序。運(yùn)用MAGE 7.0將本研究獲得的單倍型與GenBank中的福壽螺單倍型使用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,并計(jì)算個(gè)體間的遺傳距離,分析其遺傳多樣性。結(jié)果 COⅠ基因長度為493 bp,從11個(gè)樣本鑒定出2種單倍型:單倍型1(Haplotype 1)和單倍型2(Haplotype 2)。其中9個(gè)樣本為Haplotype 1,分別來源于南寧市橫縣(2個(gè))、賀州市富川縣(1個(gè))、桂林市荔浦縣(1個(gè))、百色市田林縣(2個(gè))、崇左市憑祥縣(3個(gè)),該單倍型與小管福壽螺遺傳距離最近,為0.047;2個(gè)樣本為Haplotype 2,分別源自為南寧市橫縣和桂林市全州,與孤島福壽螺遺傳距離最近,為0.062。根據(jù)上述條件所構(gòu)建的進(jìn)化樹形成了7個(gè)分支,分別為P. canaliculata、P. camena、P. insularum、P.paludosa、P. diffusa、P...
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 主要試劑
1.3 DNA的提取和PCR擴(kuò)增
1.4 PCR產(chǎn)物測序和分析
2 結(jié)果
2.1 序列比對
2.2 單倍型鑒定及多態(tài)性分析
2.3 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
3 討論
本文編號(hào):3934255
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1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 主要試劑
1.3 DNA的提取和PCR擴(kuò)增
1.4 PCR產(chǎn)物測序和分析
2 結(jié)果
2.1 序列比對
2.2 單倍型鑒定及多態(tài)性分析
2.3 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
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