目的利用生物信息學(xué)方法從基因?qū)用婧Y選金黃色葡萄球菌(金葡菌)藥靶基因。方法應(yīng)用Zcurve、Prodigal等軟件重新注釋金葡菌基因組并預(yù)測(cè)到61個(gè)漏注釋基因,其次列出金葡菌的必需基因170個(gè)、高表達(dá)基因185個(gè)(20～205個(gè))及基因組島基因32個(gè),通過(guò)同源比對(duì)排除人類及有益腸道菌群基因,最后在DrugBank上檢索核查目標(biāo)藥靶。結(jié)果通過(guò)反復(fù)篩選并排除腸道有益菌群后最終得到SAZ172₀418、SAZ172₀420、SAZ172₁976、SAZ172₁978、SAZ172₁980、SACOL1524、SA2981₁507、SA2981₂326、SA2981₂521、SA2981₁955共10個(gè)可作為藥靶的基因。結(jié)論篩選出的10個(gè)基因可對(duì)金葡菌耐藥菌株的廣譜抗菌藥物研制提供理論幫助。

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圖1藥靶基因篩選流程圖

-11-的共同必需基因。保證了必需基因在每個(gè)金黃色葡萄球菌菌株中均是存在的，同時(shí)反復(fù)任選2個(gè)金黃色葡萄球菌菌株取交集再推廣到49菌株檢驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。5確定基因組島基因基因組島是通過(guò)水平基因轉(zhuǎn)移的進(jìn)化過(guò)程從同種族或異種族的生物中獲得功能相關(guān)基因簇，具有抗生素抗性，細(xì)菌毒力相關(guān)基因....

本文編號(hào)：3928140