目的研究幼年期、成年期和老年期小鼠側(cè)腦室下區(qū)(subventricular zone,SVZ)中基因表達的增齡性變化。方法分別提取3周齡、6月齡和20月齡C57小鼠SVZ的mRNA,基于轉(zhuǎn)錄組測序及實時熒光定量PCR技術(shù),檢測SVZ中在不同年齡階段的基因表達差異。結(jié)果以幼年期小鼠為對照,成年期檢測到253個差異表達的基因,老年期檢測到519個,以成年期作對照,老年期檢測到147個差異表達的基因。GO分析發(fā)現(xiàn)成年期小鼠與幼年期相比差異表達基因主要涉及營養(yǎng)和代謝,老年期小鼠與成年期相比主要涉及中樞神經(jīng)系統(tǒng)神經(jīng)元分化等。KEGG分析發(fā)現(xiàn)差異表達基因主要涉及通路為蛋白質(zhì)消化吸收、神經(jīng)活性配體-受體相互作用等。結(jié)論該研究提供了不同年齡段SVZ轉(zhuǎn)錄水平基因變化的數(shù)據(jù),為探討SVZ的功能發(fā)育和退化,進一步治療和抵抗神經(jīng)衰老提供新的理論依據(jù)和方法。

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圖2差異基因表達Venn圖

另外為了驗證轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的可信度，通過實時熒光定量PCR(qPCR)檢測差異表達基因的表達情況。如圖4所示，qPCR檢測的幾個基因表達情況與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致。圖3幼年、成年與老年期小鼠神經(jīng)干細胞差異表達基因統(tǒng)計

圖3幼年、成年與老年期小鼠神經(jīng)干細胞差異表達基因統(tǒng)計

圖2差異基因表達Venn圖2.2GO分析

圖4差異基因表達qPCR驗證

利用clusterProfilerR軟件對差異基因進行KEGG通路分析(圖6)。成年期與幼年期小鼠的SVZ比較，差異表達基因涉及蛋白質(zhì)消化吸收的信號通路。老年期與幼年期小鼠的SVZ比較，涉及信號通路較多，包括神經(jīng)活性配體-受體相互作用、cAMP信號通路、嗎啡成癮、多巴胺能突....

圖5GO功能分類

本研究對小鼠幼年、成年和老年期SVZ的cDNA文庫進行分析，幼年與成年期或老年期小鼠對比，共檢測到253個及519個差異表達的基因;成年與老年期小鼠對比，共檢測到147個差異表達的基因。意料之中的是，由于小鼠從幼年到老年發(fā)育時間跨度較長，差異表達的基因數(shù)目最多。小鼠作為經(jīng)典的模式....

本文編號：3912052