目的了解浙江省余姚市蜱中攜帶的病原體構(gòu)成。方法對采集的蜱進(jìn)行形態(tài)學(xué)分類,再用高通量測序技術(shù)測定蜱所攜帶細(xì)菌16S rDNA基因的V3～V4高變異區(qū)段序列,進(jìn)行生物學(xué)信息分析。結(jié)果共監(jiān)測到蜱481只,均為硬蜱科,分別為血蜱屬的長角血蜱、扇頭蜱屬的血紅扇頭蜱和硬蜱屬的中華硬蜱,優(yōu)勢種群為長角血蜱,占94.18%。21組蜱的平均有效序列reads為55 753條,序列平均長度457.82 bp,(G+C)平均含量為52.07%。共產(chǎn)生2 104個(gè)分類操作單元,其稀釋曲線趨于平緩,樣本文庫的覆蓋率>99%。在蜱攜帶的微生物中共檢出9個(gè)門77個(gè)屬,居前3位的門依次是厚壁菌門、變形菌門、藍(lán)藻門。其中厚壁菌門的豐度最高,為蜱的優(yōu)勢菌群。還發(fā)現(xiàn)了5種人獸共患病原菌,分別是葡萄球菌屬、不動(dòng)桿菌屬、立克次體屬、假單胞菌屬、鏈球菌屬,以葡萄球菌屬為主,最高豐度達(dá)98.76%。結(jié)論通過高通量測序技術(shù)可以全面準(zhǔn)確地分析蜱所攜帶的微生物群落信息,為蜱媒傳染病、新發(fā)動(dòng)物疫病的防控和綜合監(jiān)測技術(shù)平臺(tái)的建立提供依據(jù)。

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 標(biāo)本采集
    1.2 形態(tài)學(xué)分類
    1.3 蜱基因組DNA提取
    1.4 PCR擴(kuò)增和高通量測序
    1.5 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 形態(tài)學(xué)結(jié)果
    2.2 16S rDNA基因測序結(jié)果
    2.3 Alpha多樣性分析結(jié)果
    2.4 各樣本菌落組成分析
3 討論



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