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白紋伊蚊微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及種群遺傳研究

發(fā)布時(shí)間:2021-12-21 21:59
  目的篩選出有效的白紋伊蚊微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR),并利用這些SSR分析六個(gè)不同地區(qū)白紋伊蚊種群遺傳特征。方法通過文獻(xiàn)查找已公布于數(shù)據(jù)庫的白紋伊蚊SSR位點(diǎn),利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)和生物信息學(xué)的方法選定白紋伊蚊SSR,ABI3730測序白紋伊蚊基因組中的這些SSR位點(diǎn),通過STRUCTURE聚類分析和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析六個(gè)不同地區(qū)種群遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果查閱文獻(xiàn)共找到49個(gè)已公布于數(shù)據(jù)庫的白紋伊蚊SSR位點(diǎn),選取最近發(fā)表的29個(gè)SSR做PCR鑒定,選取了其中16個(gè)多態(tài)性高且均勻分布在染色體上的SSR位點(diǎn),利用這16個(gè)SSR位點(diǎn)對6個(gè)不同白紋伊蚊種群進(jìn)行種群遺傳分析。分析結(jié)果顯示地理距離相近的種群遺傳距離較近,并確定了最優(yōu)類群數(shù)為2,可將這6個(gè)種群分為兩個(gè)類群,南北方的白紋伊蚊種群分別聚為一個(gè)類群。結(jié)論通過PCR和生物信息學(xué)的方法篩選出的白紋伊蚊SSR位點(diǎn),能夠應(yīng)用于白紋伊蚊種群遺傳研究,并將本研究的6個(gè)不同白紋伊蚊種群成功地劃分為南北兩個(gè)類群。

【文章來源】: 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(07)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 蚊蟲來源
        1.1.2 主要試劑
    1.2 方法
        1.2.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)的檢索和生物信息學(xué)分析
        1.2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增
        1.2.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 微衛(wèi)星PCR反應(yīng)和生物信息學(xué)分析
    2.2 白紋伊蚊種群遺傳多樣性
    2.3 白紋伊蚊種群遺傳結(jié)構(gòu)
3 討 論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]白紋伊蚊微衛(wèi)星標(biāo)記的研究進(jìn)展 [J]. 魏勇,宋璋瑤,鄭學(xué)禮.  中國病原生物學(xué)雜志. 2018(11)



本文編號:3545250

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