分析DNA損傷特異結(jié)合蛋白2（DDB2）基因的啟動(dòng)子、CpG島、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、基因表達(dá)情況;分析DDB2蛋白的理化性質(zhì)、同源性、亞細(xì)胞定位、信號(hào)肽和跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及相互作用網(wǎng)絡(luò)。DDB2基因至少含有2個(gè)啟動(dòng)子。啟動(dòng)子區(qū)存在2個(gè)CpG島,長(zhǎng)度分別109 bp和267 bp,而且至少包含NF-1和Sp1兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。DDB2基因在人體正常組織中均有表達(dá),在白血病早幼粒細(xì)胞HL-60、721B淋巴母細(xì)胞中表達(dá)最高。DDB2蛋白是由427個(gè)氨基酸組成的無(wú)信號(hào)肽、無(wú)跨膜區(qū)域的親水蛋白。主要定位于細(xì)胞核,二級(jí)結(jié)構(gòu)以隨機(jī)卷曲為主。還發(fā)現(xiàn)蛋白DDB1、CUL4A、CUL4B、XPA、COPS2、COPS4、COPS8、COPS5、COPS7B、TP53可能與DDB2存在相互作用。生物信息學(xué)對(duì)于基因及蛋白質(zhì)研究具有重要作用。本文通過(guò)生物信息學(xué)的方法對(duì)DDB2基因及蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,為DDB2的實(shí)驗(yàn)研究提供理論基礎(chǔ)和新的線索。 

【文章來(lái)源】：楚雄師范學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,35(03)

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

DDB2基因在人體各種組織的表達(dá)

EMBOSS CPGplot預(yù)測(cè)DDB2基因啟動(dòng)子區(qū)的CpG島（A、B區(qū)域?yàn)轭A(yù)測(cè)的CpG島位置）

MethPrime預(yù)測(cè)DDB2基因啟動(dòng)子區(qū)的CpG島（A、B區(qū)域?yàn)轭A(yù)測(cè)的CpG島位置）

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3494019