小鼠精原細(xì)胞分化的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-25 18:01
對(duì)小鼠睪丸中未分化(Undifferentiated)和分化中(Differentiating)的兩類精原細(xì)胞進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組研究,探討兩類精原細(xì)胞蛋白質(zhì)組的表達(dá)差異,探索與精原細(xì)胞分化相關(guān)的蛋白質(zhì)。利用Thy1和c-Kit兩個(gè)特異抗體結(jié)合的磁珠分選技術(shù),分別將生后7 d雄性小鼠睪丸中的Thy1+細(xì)胞和c-Kit+細(xì)胞分別作為未分化和分化中的精原細(xì)胞分選出來,其中Thy1陽性細(xì)胞3組,c-Kit陽性細(xì)胞4組,分別代表了未分化精原細(xì)胞和分化中的精原細(xì)胞。采用高效液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜方法(LC-MS/MS)分析兩類細(xì)胞蛋白表達(dá)差異。并且對(duì)兩類細(xì)胞的差異蛋白進(jìn)行基因本體(Gene ontology,GO)功能注釋、KEGG代謝通路和聚類分析。質(zhì)譜分析共鑒定了3 228種蛋白,其中有256種蛋白在兩類細(xì)胞中表達(dá)差異。其中,差異蛋白的富集分析發(fā)現(xiàn),在生物過程方面,注釋結(jié)果顯示差異蛋白主要在代謝過程(Primary metabolic process),細(xì)胞代謝過程(Cellular metabolic process),分子代謝過程(Macromolecule metabolic process)和...
【文章來源】:生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 精原細(xì)胞的分離、純化
1.2.1.1 消化分離小鼠睪丸細(xì)胞
1.2.1.2 磁珠分選純化精原細(xì)胞
1.2.2 蛋白質(zhì)譜分析
1.2.2.1 蛋白質(zhì)譜分析
1.2.2.2 蛋白定量比較及生物信息學(xué)分析
1.2.3 細(xì)胞標(biāo)志基因及篩選出通路中重要基因的表達(dá)分析
1.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
2.1 兩類精原細(xì)胞的純度
2.2 兩類精原細(xì)胞蛋白質(zhì)鑒定基本結(jié)果
2.3 兩類精原細(xì)胞差異表達(dá)蛋白質(zhì)功能聚類
2.4 兩類精原細(xì)胞差異表達(dá)蛋白質(zhì)KEGG注釋
2.5 差異蛋白質(zhì)層次聚類分析
2.6 細(xì)胞標(biāo)志基因及篩選出通路中相關(guān)基因的表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Regulation of blood-testis barrier dynamics by the mTORC1/rpS6 signaling complex:an in vitro study[J]. Lin-Xi Li,Si-Wen Wu,Ming Yan,Qing-Quan Lian,Ren-Shan Ge,C Yan Cheng. Asian Journal of Andrology. 2019(04)
[2]哺乳動(dòng)物睪丸蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 孫武,羅靜,王麗,李發(fā)弟,李萬宏,羅莉?qū)?樂祥鵬. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(10)
[3]生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 劉銀鳳,張雷. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(10)
[4]iTRAQ技術(shù)鑒定小鼠睪丸發(fā)育差異表達(dá)蛋白的研究[J]. 王黎熔,王靜,王富強(qiáng),王暉. 臨床檢驗(yàn)雜志. 2010(06)
[5]從基因組學(xué)到功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究[J]. 朱沙,張春輝,李鮮菊. 生物學(xué)雜志. 2007(01)
本文編號(hào):3457913
【文章來源】:生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 精原細(xì)胞的分離、純化
1.2.1.1 消化分離小鼠睪丸細(xì)胞
1.2.1.2 磁珠分選純化精原細(xì)胞
1.2.2 蛋白質(zhì)譜分析
1.2.2.1 蛋白質(zhì)譜分析
1.2.2.2 蛋白定量比較及生物信息學(xué)分析
1.2.3 細(xì)胞標(biāo)志基因及篩選出通路中重要基因的表達(dá)分析
1.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
2.1 兩類精原細(xì)胞的純度
2.2 兩類精原細(xì)胞蛋白質(zhì)鑒定基本結(jié)果
2.3 兩類精原細(xì)胞差異表達(dá)蛋白質(zhì)功能聚類
2.4 兩類精原細(xì)胞差異表達(dá)蛋白質(zhì)KEGG注釋
2.5 差異蛋白質(zhì)層次聚類分析
2.6 細(xì)胞標(biāo)志基因及篩選出通路中相關(guān)基因的表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Regulation of blood-testis barrier dynamics by the mTORC1/rpS6 signaling complex:an in vitro study[J]. Lin-Xi Li,Si-Wen Wu,Ming Yan,Qing-Quan Lian,Ren-Shan Ge,C Yan Cheng. Asian Journal of Andrology. 2019(04)
[2]哺乳動(dòng)物睪丸蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 孫武,羅靜,王麗,李發(fā)弟,李萬宏,羅莉?qū)?樂祥鵬. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(10)
[3]生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 劉銀鳳,張雷. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(10)
[4]iTRAQ技術(shù)鑒定小鼠睪丸發(fā)育差異表達(dá)蛋白的研究[J]. 王黎熔,王靜,王富強(qiáng),王暉. 臨床檢驗(yàn)雜志. 2010(06)
[5]從基因組學(xué)到功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究[J]. 朱沙,張春輝,李鮮菊. 生物學(xué)雜志. 2007(01)
本文編號(hào):3457913
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