隨著第二代測序技術（基因組高通量測序）的不斷發(fā)展,越來越多的非編碼RNA（ncRNA）分子被發(fā)現,這些ncRNA被相關研究證明在各種生物過程中起著重要的作用,其突變或者失調可能是人類多種疾病的誘因。因此,系統的研究ncRNA與疾病之間的關聯關系意義重大,然而,通過傳統的生物實驗方法去挖掘致病ncRNA的信息,不僅時間周期長,而且費用高。因此,開發(fā)高效的方法來發(fā)現致病ncRNA的相關信息是當前生物信息學領域研究的熱點內容之一。在本文中,我們首先提出兩種模型推斷疾病-lncRNA潛在關系。即基于網絡模型提出了LDLMD預測疾病與lncRNA的關聯關系;基于推薦系統提出PMFILDA預測疾病與lncRNA的關聯關系。然后在LDLMD模型的基礎上,進一步提出新的預測模型PADLMP研究疾病與lncRNA-miRNA關聯對的關聯關系。在LDLMD模型中,通過已知的lncRNA-miRNA,miRNA-disease關聯關系來構建lncRNA-miRNA-disease相互作用網絡,并開發(fā)了一種新的相似性計算方法;最后利用鏈路預測的方法鑒定潛在的疾病-lncRNA關聯關系。在PMFILDA中,我們... 

【文章來源】：湘潭大學湖南省

【文章頁數】：66 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

全局流程圖

圖 3.2 lncRNA-miRNA-疾病網絡，lncRNA-miRNA 網絡，miRNA-疾病網絡和鄰接矩陣 MDT和 LM 的構建過程。3.1.5 lncRNA 和疾病的相似性計算在 lncRNA-miRNA-疾病網絡 ( , )中 = ∪ ∪ , ∈ ,令 ( ) =

圖 3.3 lncRNA 與疾病的超級表達譜構造示意圖接下來，根據上面獲得的超級表達譜矩陣，我們提出了一種基于徑向基神經網絡的 lncRNA，疾病相似性方法。在 RBF 神經網絡中，存在三層：輸入層，具有非線性 RBF 激活函數的隱藏層和輸出層。因此，對于任何兩個給定節(jié)點 ∈和 ∈ ，令 表示 ( )中的行數， 表示 ( )的第 行向量，其中 ∈ [1， ]，

【參考文獻】：
期刊論文
[1]lncRNA與miRNA相互作用對疾病的影響[J]. 易紅,張政.  基礎醫(yī)學與臨床. 2016(02)
[2]長鏈非編碼RNA-HOTAIR對前列腺癌細胞周期和侵襲影響的實驗研究[J]. 朱意,虞日考,紀阿林,姚曉霖,方家杰,金曉東.  中華男科學雜志. 2015(09)



本文編號：3435567