全基因組數(shù)據(jù)應(yīng)用于多克隆副溶血弧菌感染暴發(fā)的病原學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-29 22:45
目的應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光PCR方法和基因組重測(cè)序分析等技術(shù)對(duì)一起副溶血弧菌(VP)導(dǎo)致的腹瀉暴發(fā)事件進(jìn)行病原學(xué)分析。方法收集暴發(fā)事件的病例信息,采集病例樣本,使用實(shí)時(shí)熒光PCR方法篩選常見(jiàn)腹瀉致病菌,分離鑒定VP并進(jìn)行血清型鑒定,檢測(cè)菌株毒力基因,采用微量肉湯稀釋法檢測(cè)菌株對(duì)抗菌藥物的敏感性,使用全基因組測(cè)序技術(shù)進(jìn)行菌株的遺傳學(xué)分析。結(jié)果 9份肛拭子共分離出13株VP菌株,其中O4∶KUT血清型7株(trh–/tdh+),O1∶KUT血清型6株(5株trh+/tdh+,1株trh–/tdh–)。在檢測(cè)的30種抗菌藥物中,所有菌株僅對(duì)氨芐西林耐藥,對(duì)其他29種抗菌藥物均敏感。在基于全基因組序列的遺傳學(xué)分析中,13株VP形成4個(gè)相互獨(dú)立且遺傳距離較遠(yuǎn)的分支,Lineage 1(O4∶KUT、trh–/tdh+,2株)、Lineage 2(O1∶KUT、trh–/tdh–,1株)、Lineage 3(O1∶KUT、trh+/tdh+,5株)和Lineage 4(O4∶KUT、trh–/tdh+,5株),其中3例患者由來(lái)源于3個(gè)不同遺傳分支的VP混合感染。結(jié)論本次事件由多血清型、多克隆的VP感染導(dǎo)致,...
【文章來(lái)源】:疾病監(jiān)測(cè). 2020,35(06)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一起食源性疾病暴發(fā)中的副溶血性弧菌病原學(xué)分析[J]. 楊元斌,高紅,章丹陽(yáng),閆鵬,宋啟發(fā),葉碩. 疾病監(jiān)測(cè). 2017(06)
[2]一起副溶血性弧菌引起食物中毒實(shí)驗(yàn)室溯源檢測(cè)[J]. 袁夢(mèng),李博,程妍,袁月明. 疾病監(jiān)測(cè). 2012(03)
[3]北京市副溶血弧菌病原學(xué)和分子流行病學(xué)特征分析[J]. 曲梅,張新,劉桂榮,黃瑛,李潔,李錫太,劉元,嚴(yán)寒秋,劉白微,黎新宇,王全意,黃芳. 中華流行病學(xué)雜志. 2011 (12)
[4]中國(guó)細(xì)菌性傳染病分子分型實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)-PulseNet China[J]. 李偉,崔志剛,闞飆,徐建國(guó). 疾病監(jiān)測(cè). 2011(01)
[5]副溶血弧菌TaqMan雙重實(shí)時(shí)-聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)方法的建立[J]. 王海波,王多春,闞飆,畢振強(qiáng). 疾病監(jiān)測(cè). 2009(04)
本文編號(hào):3414609
【文章來(lái)源】:疾病監(jiān)測(cè). 2020,35(06)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一起食源性疾病暴發(fā)中的副溶血性弧菌病原學(xué)分析[J]. 楊元斌,高紅,章丹陽(yáng),閆鵬,宋啟發(fā),葉碩. 疾病監(jiān)測(cè). 2017(06)
[2]一起副溶血性弧菌引起食物中毒實(shí)驗(yàn)室溯源檢測(cè)[J]. 袁夢(mèng),李博,程妍,袁月明. 疾病監(jiān)測(cè). 2012(03)
[3]北京市副溶血弧菌病原學(xué)和分子流行病學(xué)特征分析[J]. 曲梅,張新,劉桂榮,黃瑛,李潔,李錫太,劉元,嚴(yán)寒秋,劉白微,黎新宇,王全意,黃芳. 中華流行病學(xué)雜志. 2011 (12)
[4]中國(guó)細(xì)菌性傳染病分子分型實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)-PulseNet China[J]. 李偉,崔志剛,闞飆,徐建國(guó). 疾病監(jiān)測(cè). 2011(01)
[5]副溶血弧菌TaqMan雙重實(shí)時(shí)-聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)方法的建立[J]. 王海波,王多春,闞飆,畢振強(qiáng). 疾病監(jiān)測(cè). 2009(04)
本文編號(hào):3414609
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