新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）作為引起全球新型冠狀病毒肺炎疫情蔓延的病原體而受到廣泛關(guān)注。安徽省自2020年1月起陸續(xù)出現(xiàn)990例新型冠狀病毒肺炎確診病例。為探索SARS-CoV-2分離培養(yǎng)和二代測(cè)序方法構(gòu)建,了解該病毒在安徽省傳播的變異情況,為藥物篩選和疫苗研發(fā)等工作提供基礎(chǔ)和依據(jù),本研究選取1例新型冠狀病毒肺炎確診病例咽拭子樣本接種Vero細(xì)胞進(jìn)行病毒分離培養(yǎng),并逐日觀(guān)察細(xì)胞病變,經(jīng)熒光定量PCR檢測(cè)確認(rèn)病毒分離培養(yǎng)結(jié)果;采用SARS-CoV-2全基因組捕獲技術(shù)及二代測(cè)序?qū)Χ局赀M(jìn)行全基因組測(cè)序,并通過(guò)DNASTAR Lasergene MegAlign v7.1.0和PhyloSuite v1.2.1進(jìn)行序列比對(duì)和進(jìn)化分析;將全基因組序列上傳國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心鑒定變異位點(diǎn)。結(jié)果顯示,樣本接種Vero細(xì)胞第4d出現(xiàn)細(xì)胞病變,經(jīng)熒光定量PCR檢測(cè)確認(rèn)為SARS-CoV-2毒株。該毒株基因組序列全長(zhǎng)29 860bp,與SARS-CoV-2參比序列相似度均在99%以上,共有9個(gè)位點(diǎn)發(fā)生突變。與蝙蝠來(lái)源SARS樣冠狀病毒Bat Yunnan RaTG13相似度最高,為96.8%。本... 

【文章來(lái)源】：病毒學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

新型冠狀病毒（SARS-Co V-2)SZ005毒株在Vero細(xì)胞中的細(xì)胞病變

圖1 新型冠狀病毒（SARS-Co V-2)SZ005毒株在Vero細(xì)胞中的細(xì)胞病變圖3 新型冠狀病毒（SARS-Co V-2）毒株SZ005全基因組二代測(cè)序reads讀長(zhǎng)分布

圖2 新型冠狀病毒（SARS-Co V-2）毒株SZ005生長(zhǎng)曲線(xiàn)圖4 新型冠狀病毒（SARS-Co V-2）毒株SZ005全基因組二代測(cè)序深度及覆蓋均一度


本文編號(hào)：3405916