一株柯薩奇病毒A組6型毒株RYN-A1205的分子特征及其在KMB17細胞上的遺傳穩(wěn)定性研究
發(fā)布時間:2021-08-18 22:57
目的研究1株手足口病相關(guān)柯薩奇病毒A組6型(coxsackievirus A6,CV-A6)毒株RYN-A1205的分子特征及其在KMB17細胞中連續(xù)傳代的遺傳穩(wěn)定性。方法利用MEGA7.0軟件并采用neighbor-joining法對RYN-A1205株及65株CV-A6代表株基于全長VP1序列進行種系進化分析。另外,將RYN-A1205株以MOI=1接種至KMB17細胞中于37℃連續(xù)傳代培養(yǎng),提取適應(yīng)前及適應(yīng)后第1、5、10、15代毒株的RNA,以其為模板,RT-PCR分段擴增全基因組序列并進行測序分析。結(jié)果 RYN-A1205株屬于D3基因亞型中的D3a分支,能較好地適應(yīng)KMB17細胞。與適應(yīng)前毒株相比,適應(yīng)后毒株共發(fā)生15個堿基突變,造成12個氨基酸替換。適應(yīng)后各代次病毒全基因核苷酸及氨基酸序列同源性分別為99.97%~100%和99.90%~100%,其中,P10代在VP2和3D編碼區(qū)各發(fā)生1個氨基酸的替換,P15代氨基酸突變情況與P10代一致。結(jié)論 RYN-A1205株與我國近幾年的CV-A6內(nèi)地流行株在進化樹中屬于同一分支,在KMB17細胞上適應(yīng)后保持良好的遺傳穩(wěn)定性,這...
【文章來源】:中國病毒病雜志. 2020,10(02)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
KYN-A1205株CPE
KYN-A1205株鏡下蝕斑
KYN-A1205株部分VP1擴增圖
本文編號:3350783
【文章來源】:中國病毒病雜志. 2020,10(02)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
KYN-A1205株CPE
KYN-A1205株鏡下蝕斑
KYN-A1205株部分VP1擴增圖
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