基于重組酶介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)的廣州管圓線蟲核酸檢測方法的建立
發(fā)布時間:2021-07-24 14:57
目的建立一種基于重組酶介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)(RAA)的廣州管圓線蟲核酸檢測方法。方法選擇廣州管圓線蟲內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1(ITS1)基因序列作為靶基因序列,設(shè)計、合成并篩選出特異性最強(qiáng)的引物和探針,構(gòu)建用于廣州管圓線蟲核酸檢測的基礎(chǔ)及熒光RAA檢測方法。分別以含檢測靶基因片段序列的不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒以及不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板進(jìn)行焚光RAA擴(kuò)增,評價其檢測敏感性;分別以廣州管圓線蟲、曼氏血吸蟲、似蚓蛔線蟲、華支睪吸蟲、細(xì)粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲及小管福壽螺和藁桿雙臍螺螺體基因組DNA為模板進(jìn)行熒光RAA擴(kuò)增,評價其檢測特異性。結(jié)果成功建立了用于廣州管圓線蟲核酸檢測的熒光RAA法,該方法可在37℃20min內(nèi)對廣州管圓線蟲特異性DNA片段實現(xiàn)實時擴(kuò)增。以含靶基因片段序列的不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒和不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板時,該法最低檢出限分別為10拷貝/μL重組質(zhì)粒和100 pg/μL基因組DNA;以曼氏血吸蟲、似蚓蛔線蟲、華支睪吸蟲、細(xì)粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲及小管福壽螺和藁桿雙臍螺螺體基因組DNA為模板,檢測結(jié)果均為陰性。結(jié)論成功建立了一種可用于廣州管圓線蟲核酸檢...
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光注:樣本1
擴(kuò)增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當(dāng)廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內(nèi)仍可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增(圖4),表明檢測靈敏度可達(dá)100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴(kuò)增結(jié)果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內(nèi)即可出現(xiàn)明顯陽性擴(kuò)增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學(xué)技術(shù)依然是用于中間宿主和轉(zhuǎn)續(xù)宿主體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設(shè)備及環(huán)境條件要求低,但前者檢出率較低,同時取螺肺過程也有一定操作難度;而后者操作過程多、檢測耗時較長,故容易發(fā)生漏
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4內(nèi)即可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當(dāng)廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內(nèi)仍可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增(圖4),表明檢測靈敏度可達(dá)100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴(kuò)增結(jié)果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內(nèi)即可出現(xiàn)明顯陽性擴(kuò)增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學(xué)技術(shù)依然是用于中間宿主和轉(zhuǎn)續(xù)宿主體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設(shè)備及環(huán)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重組酶介導(dǎo)的華支睪吸蟲特異性核酸等溫擴(kuò)增方法的建立及初步評價[J]. 張強(qiáng),丁昕,吳小珉,劉燕紅,劉劍峰,徐祥珍,應(yīng)清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(05)
[2]重組酶介導(dǎo)的隱孢子蟲屬特異性等溫核酸擴(kuò)增方法的建立及評價[J]. 倪碧嫻,吳小珉,劉燕紅,徐祥珍,應(yīng)清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(04)
[3]重組酶介導(dǎo)的核酸等溫擴(kuò)增熒光法快速檢測日本血吸蟲感染性釘螺[J]. 李婷,劉燕紅,趙松,熊春蓉,董萱,張鍵鋒,李偉,應(yīng)清界,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(02)
[4]廣州管圓線蟲感染致病機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 廖瑤,孫希,吳忠道. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(01)
[5]等溫擴(kuò)增技術(shù)在寄生蟲及其他病原體檢測中的應(yīng)用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[6]高分辨率熔解曲線法檢測廣州管圓線蟲幼蟲的初步研究[J]. 柯艷坤,黃裕,葛秀清,彭梅仙,汪清,黃立任,羅國強(qiáng),鐘雷響,闞式紱,張遠(yuǎn)新,翟建新. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2014(06)
[7]大理市1起食用螺肉引起的廣州管圓線蟲病暴發(fā)調(diào)查[J]. 陳鳳,陳紹榮,李科榮,李庭華,方文,羅家軍. 中國血吸蟲病防治雜志. 2011(06)
[8]用多重PCR技術(shù)檢測小管福壽螺體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲[J]. 危芙蓉,劉和香,呂山,胡玲,張儀. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2010(05)
[9]PCR檢測螺類感染廣州管圓線蟲方法的建立與應(yīng)用[J]. 魏紀(jì)玲,周衛(wèi)川,邵碧英,佘書生,王壽昆,陳文炳,陳壽鈴. 中國人獸共患病學(xué)報. 2008(12)
[10]三種方法檢測福壽螺肺囊內(nèi)廣州管圓線蟲效果的比較研究[J]. 劉和香,張儀,呂山,朱丹,王顯紅,胡鈴,周曉農(nóng). 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2007(01)
本文編號:3300875
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光注:樣本1
擴(kuò)增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當(dāng)廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內(nèi)仍可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增(圖4),表明檢測靈敏度可達(dá)100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴(kuò)增結(jié)果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內(nèi)即可出現(xiàn)明顯陽性擴(kuò)增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學(xué)技術(shù)依然是用于中間宿主和轉(zhuǎn)續(xù)宿主體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設(shè)備及環(huán)境條件要求低,但前者檢出率較低,同時取螺肺過程也有一定操作難度;而后者操作過程多、檢測耗時較長,故容易發(fā)生漏
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4內(nèi)即可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當(dāng)廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內(nèi)仍可出現(xiàn)陽性擴(kuò)增(圖4),表明檢測靈敏度可達(dá)100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴(kuò)增結(jié)果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結(jié)果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內(nèi)即可出現(xiàn)明顯陽性擴(kuò)增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學(xué)技術(shù)依然是用于中間宿主和轉(zhuǎn)續(xù)宿主體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設(shè)備及環(huán)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重組酶介導(dǎo)的華支睪吸蟲特異性核酸等溫擴(kuò)增方法的建立及初步評價[J]. 張強(qiáng),丁昕,吳小珉,劉燕紅,劉劍峰,徐祥珍,應(yīng)清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(05)
[2]重組酶介導(dǎo)的隱孢子蟲屬特異性等溫核酸擴(kuò)增方法的建立及評價[J]. 倪碧嫻,吳小珉,劉燕紅,徐祥珍,應(yīng)清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(04)
[3]重組酶介導(dǎo)的核酸等溫擴(kuò)增熒光法快速檢測日本血吸蟲感染性釘螺[J]. 李婷,劉燕紅,趙松,熊春蓉,董萱,張鍵鋒,李偉,應(yīng)清界,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(02)
[4]廣州管圓線蟲感染致病機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 廖瑤,孫希,吳忠道. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(01)
[5]等溫擴(kuò)增技術(shù)在寄生蟲及其他病原體檢測中的應(yīng)用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[6]高分辨率熔解曲線法檢測廣州管圓線蟲幼蟲的初步研究[J]. 柯艷坤,黃裕,葛秀清,彭梅仙,汪清,黃立任,羅國強(qiáng),鐘雷響,闞式紱,張遠(yuǎn)新,翟建新. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2014(06)
[7]大理市1起食用螺肉引起的廣州管圓線蟲病暴發(fā)調(diào)查[J]. 陳鳳,陳紹榮,李科榮,李庭華,方文,羅家軍. 中國血吸蟲病防治雜志. 2011(06)
[8]用多重PCR技術(shù)檢測小管福壽螺體內(nèi)廣州管圓線蟲幼蟲[J]. 危芙蓉,劉和香,呂山,胡玲,張儀. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2010(05)
[9]PCR檢測螺類感染廣州管圓線蟲方法的建立與應(yīng)用[J]. 魏紀(jì)玲,周衛(wèi)川,邵碧英,佘書生,王壽昆,陳文炳,陳壽鈴. 中國人獸共患病學(xué)報. 2008(12)
[10]三種方法檢測福壽螺肺囊內(nèi)廣州管圓線蟲效果的比較研究[J]. 劉和香,張儀,呂山,朱丹,王顯紅,胡鈴,周曉農(nóng). 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2007(01)
本文編號:3300875
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