基于重組酶介導等溫擴增技術的廣州管圓線蟲核酸檢測方法的建立
發(fā)布時間:2021-07-24 14:57
目的建立一種基于重組酶介導等溫擴增技術(RAA)的廣州管圓線蟲核酸檢測方法。方法選擇廣州管圓線蟲內轉錄間隔區(qū)1(ITS1)基因序列作為靶基因序列,設計、合成并篩選出特異性最強的引物和探針,構建用于廣州管圓線蟲核酸檢測的基礎及熒光RAA檢測方法。分別以含檢測靶基因片段序列的不同拷貝數(shù)重組質粒以及不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板進行焚光RAA擴增,評價其檢測敏感性;分別以廣州管圓線蟲、曼氏血吸蟲、似蚓蛔線蟲、華支睪吸蟲、細粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲及小管福壽螺和藁桿雙臍螺螺體基因組DNA為模板進行熒光RAA擴增,評價其檢測特異性。結果成功建立了用于廣州管圓線蟲核酸檢測的熒光RAA法,該方法可在37℃20min內對廣州管圓線蟲特異性DNA片段實現(xiàn)實時擴增。以含靶基因片段序列的不同拷貝數(shù)重組質粒和不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板時,該法最低檢出限分別為10拷貝/μL重組質粒和100 pg/μL基因組DNA;以曼氏血吸蟲、似蚓蛔線蟲、華支睪吸蟲、細粒棘球絳蟲、十二指腸鉤口線蟲及小管福壽螺和藁桿雙臍螺螺體基因組DNA為模板,檢測結果均為陰性。結論成功建立了一種可用于廣州管圓線蟲核酸檢...
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光注:樣本1
擴增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內仍可出現(xiàn)陽性擴增(圖4),表明檢測靈敏度可達100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴增結果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質粒為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內即可出現(xiàn)明顯陽性擴增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學技術依然是用于中間宿主和轉續(xù)宿主體內廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標準”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設備及環(huán)境條件要求低,但前者檢出率較低,同時取螺肺過程也有一定操作難度;而后者操作過程多、檢測耗時較長,故容易發(fā)生漏
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4內即可出現(xiàn)陽性擴增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內仍可出現(xiàn)陽性擴增(圖4),表明檢測靈敏度可達100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴增結果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質粒為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內即可出現(xiàn)明顯陽性擴增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學技術依然是用于中間宿主和轉續(xù)宿主體內廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標準”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設備及環(huán)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]重組酶介導的華支睪吸蟲特異性核酸等溫擴增方法的建立及初步評價[J]. 張強,丁昕,吳小珉,劉燕紅,劉劍峰,徐祥珍,應清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(05)
[2]重組酶介導的隱孢子蟲屬特異性等溫核酸擴增方法的建立及評價[J]. 倪碧嫻,吳小珉,劉燕紅,徐祥珍,應清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(04)
[3]重組酶介導的核酸等溫擴增熒光法快速檢測日本血吸蟲感染性釘螺[J]. 李婷,劉燕紅,趙松,熊春蓉,董萱,張鍵鋒,李偉,應清界,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(02)
[4]廣州管圓線蟲感染致病機制的研究進展[J]. 廖瑤,孫希,吳忠道. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(01)
[5]等溫擴增技術在寄生蟲及其他病原體檢測中的應用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[6]高分辨率熔解曲線法檢測廣州管圓線蟲幼蟲的初步研究[J]. 柯艷坤,黃裕,葛秀清,彭梅仙,汪清,黃立任,羅國強,鐘雷響,闞式紱,張遠新,翟建新. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2014(06)
[7]大理市1起食用螺肉引起的廣州管圓線蟲病暴發(fā)調查[J]. 陳鳳,陳紹榮,李科榮,李庭華,方文,羅家軍. 中國血吸蟲病防治雜志. 2011(06)
[8]用多重PCR技術檢測小管福壽螺體內廣州管圓線蟲幼蟲[J]. 危芙蓉,劉和香,呂山,胡玲,張儀. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2010(05)
[9]PCR檢測螺類感染廣州管圓線蟲方法的建立與應用[J]. 魏紀玲,周衛(wèi)川,邵碧英,佘書生,王壽昆,陳文炳,陳壽鈴. 中國人獸共患病學報. 2008(12)
[10]三種方法檢測福壽螺肺囊內廣州管圓線蟲效果的比較研究[J]. 劉和香,張儀,呂山,朱丹,王顯紅,胡鈴,周曉農. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2007(01)
本文編號:3300875
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光注:樣本1
擴增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內仍可出現(xiàn)陽性擴增(圖4),表明檢測靈敏度可達100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴增結果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質粒為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內即可出現(xiàn)明顯陽性擴增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學技術依然是用于中間宿主和轉續(xù)宿主體內廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標準”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設備及環(huán)境條件要求低,但前者檢出率較低,同時取螺肺過程也有一定操作難度;而后者操作過程多、檢測耗時較長,故容易發(fā)生漏
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4內即可出現(xiàn)陽性擴增。3.2以不同濃度廣州管圓線蟲基因組DNA為模板隨著基因組DNA濃度的降低,熒光RAA信號起峰時間逐漸延長;當廣州管圓線蟲基因組DNA濃度稀釋至100pg/μL時,10min內仍可出現(xiàn)陽性擴增(圖4),表明檢測靈敏度可達100pg/μL。注:樣本1、2均為廣州管圓線蟲基因組DNANote:Samples1and2arebothA.cantonensisgenomicDNA圖2以廣州管圓線蟲基因組DNA為模板的熒光RAA擴增結果FigFig.2FluorescentRAAamplificationusingAA.cantonensisgenomicDNAastemplates圖3以不同拷貝數(shù)重組質粒為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.3FluorescentRAAassayusingdifferentcopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測結果FigFig.4FluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofgenomicDNAastemplates4熒光RAA法檢測特異性廣州管圓線蟲III期幼蟲基因組DNA在5min內即可出現(xiàn)明顯陽性擴增,而曼氏血吸蟲成蟲、似蚓蛔線蟲蟲卵、華支睪吸蟲成蟲、細粒棘球絳蟲幼蟲、十二指腸鉤口線蟲鉤蚴以及藁桿雙臍螺、小管福壽螺螺體組織基因組DNA均無熒光值出現(xiàn)(圖5),表明熒光RAA法檢測廣州管圓線蟲具有良好特異性。圖5熒光RAA法檢測特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論病原學技術依然是用于中間宿主和轉續(xù)宿主體內廣州管圓線蟲幼蟲檢測的“金標準”,常用方法包括螺肺檢法、人工消化法、勻漿法等[9]。螺肺檢法和人工消化法對現(xiàn)場檢測設備及環(huán)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]重組酶介導的華支睪吸蟲特異性核酸等溫擴增方法的建立及初步評價[J]. 張強,丁昕,吳小珉,劉燕紅,劉劍峰,徐祥珍,應清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(05)
[2]重組酶介導的隱孢子蟲屬特異性等溫核酸擴增方法的建立及評價[J]. 倪碧嫻,吳小珉,劉燕紅,徐祥珍,應清界,曹俊,戴洋. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(04)
[3]重組酶介導的核酸等溫擴增熒光法快速檢測日本血吸蟲感染性釘螺[J]. 李婷,劉燕紅,趙松,熊春蓉,董萱,張鍵鋒,李偉,應清界,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(02)
[4]廣州管圓線蟲感染致病機制的研究進展[J]. 廖瑤,孫希,吳忠道. 中國血吸蟲病防治雜志. 2019(01)
[5]等溫擴增技術在寄生蟲及其他病原體檢測中的應用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[6]高分辨率熔解曲線法檢測廣州管圓線蟲幼蟲的初步研究[J]. 柯艷坤,黃裕,葛秀清,彭梅仙,汪清,黃立任,羅國強,鐘雷響,闞式紱,張遠新,翟建新. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2014(06)
[7]大理市1起食用螺肉引起的廣州管圓線蟲病暴發(fā)調查[J]. 陳鳳,陳紹榮,李科榮,李庭華,方文,羅家軍. 中國血吸蟲病防治雜志. 2011(06)
[8]用多重PCR技術檢測小管福壽螺體內廣州管圓線蟲幼蟲[J]. 危芙蓉,劉和香,呂山,胡玲,張儀. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2010(05)
[9]PCR檢測螺類感染廣州管圓線蟲方法的建立與應用[J]. 魏紀玲,周衛(wèi)川,邵碧英,佘書生,王壽昆,陳文炳,陳壽鈴. 中國人獸共患病學報. 2008(12)
[10]三種方法檢測福壽螺肺囊內廣州管圓線蟲效果的比較研究[J]. 劉和香,張儀,呂山,朱丹,王顯紅,胡鈴,周曉農. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2007(01)
本文編號:3300875
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