發(fā)布時間：2021-07-17 14:40

　　目的柯薩奇病毒A16型（Coxsachievirus A16,CA16）是手足口病主要致病病原體之一,其致病機制尚未明確。本研究利用遺傳多樣性小鼠（Genetic Diversity Mice）篩選CA16致病相關基因,深入研究該病毒的致病機制。方法選取23個遺傳多樣性小鼠品系為實驗組,近交系C57BL/6小鼠為陰性對照組,均經腹腔感染107Copies CA16病毒,取材血液和后肢骨骼肌樣本,利用實時熒光定量PCR測定樣本的病毒載量,之后利用The Gene Mine系統(tǒng)遺傳學數(shù)據(jù)庫分析感染數(shù)據(jù),篩選獲得CA16致病相關基因。結果依據(jù)感染小鼠血液和肌肉中病毒拷貝數(shù)均高于104Copies/（μL/mg）的篩選標準,得到7個對CA16易感的遺傳多樣性小鼠品系,且這些小鼠的骨骼肌組織表現(xiàn)出顯著的病理損傷;同時基于The Gene Mine專業(yè)數(shù)據(jù)庫的相應數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)小鼠3號及4號染色體與CA16致病最為相關,并最終篩選到16個可能與CA16致病相關的基因。結論遺傳多樣性小鼠資源為CA16致病相關基因研究提供新思路。 

【文章來源】：中國實驗動物學報. 2020,28(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

不同品系遺傳多樣性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒載量

圖1 不同品系遺傳多樣性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒載量與此同時，The Gene Mine數(shù)據(jù)庫給出了16個與CA16病毒感染相關基因(表2)。經過生物學功能分類，發(fā)現(xiàn):轉運相關基因5個，分別為Slc22a15、Casq2、Dennd2c、Syt6和Atp1a1，其功能主要與鈉鉀鈣離子轉運相關;細胞生長相關基因4個，分別為Sycp1、Bcas2、Ngf和Mab21l3;免疫相關基因2個，為白細胞分化抗原Cd2和黏附因子Igsf3，二者均為重要的免疫細胞表面功能分子，在機體對外界病毒感染進行免疫應答反應過程中發(fā)揮重要作用;轉錄調控相關基因2個，為Csde1、Nr1h5;代謝相關基因2個，為Dpyd、Ampd1;癌癥相關基因tusc1。

綜上所述，利用The Gene Mine數(shù)據(jù)庫進行數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)CA16致病相關主效應基因集中于小鼠3號及4號染色體，并從中篩選出16個候選基因，為后續(xù)CA16致病機制研究提供基礎。3 討論

【參考文獻】：
期刊論文
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