目的柯薩奇病毒A16型（Coxsachievirus A16,CA16）是手足口病主要致病病原體之一,其致病機(jī)制尚未明確。本研究利用遺傳多樣性小鼠（Genetic Diversity Mice）篩選CA16致病相關(guān)基因,深入研究該病毒的致病機(jī)制。方法選取23個(gè)遺傳多樣性小鼠品系為實(shí)驗(yàn)組,近交系C57BL/6小鼠為陰性對(duì)照組,均經(jīng)腹腔感染107Copies CA16病毒,取材血液和后肢骨骼肌樣本,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR測定樣本的病毒載量,之后利用The Gene Mine系統(tǒng)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫分析感染數(shù)據(jù),篩選獲得CA16致病相關(guān)基因。結(jié)果依據(jù)感染小鼠血液和肌肉中病毒拷貝數(shù)均高于104Copies/（μL/mg）的篩選標(biāo)準(zhǔn),得到7個(gè)對(duì)CA16易感的遺傳多樣性小鼠品系,且這些小鼠的骨骼肌組織表現(xiàn)出顯著的病理損傷;同時(shí)基于The Gene Mine專業(yè)數(shù)據(jù)庫的相應(yīng)數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)小鼠3號(hào)及4號(hào)染色體與CA16致病最為相關(guān),并最終篩選到16個(gè)可能與CA16致病相關(guān)的基因。結(jié)論遺傳多樣性小鼠資源為CA16致病相關(guān)基因研究提供新思路。 

【文章來源】：中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2020,28(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

不同品系遺傳多樣性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒載量

圖1 不同品系遺傳多樣性小鼠感染CA16血液及骨骼肌病毒載量與此同時(shí)，The Gene Mine數(shù)據(jù)庫給出了16個(gè)與CA16病毒感染相關(guān)基因(表2)。經(jīng)過生物學(xué)功能分類，發(fā)現(xiàn):轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因5個(gè)，分別為Slc22a15、Casq2、Dennd2c、Syt6和Atp1a1，其功能主要與鈉鉀鈣離子轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān);細(xì)胞生長相關(guān)基因4個(gè)，分別為Sycp1、Bcas2、Ngf和Mab21l3;免疫相關(guān)基因2個(gè)，為白細(xì)胞分化抗原Cd2和黏附因子Igsf3，二者均為重要的免疫細(xì)胞表面功能分子，在機(jī)體對(duì)外界病毒感染進(jìn)行免疫應(yīng)答反應(yīng)過程中發(fā)揮重要作用;轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)基因2個(gè)，為Csde1、Nr1h5;代謝相關(guān)基因2個(gè)，為Dpyd、Ampd1;癌癥相關(guān)基因tusc1。

綜上所述，利用The Gene Mine數(shù)據(jù)庫進(jìn)行數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)CA16致病相關(guān)主效應(yīng)基因集中于小鼠3號(hào)及4號(hào)染色體，并從中篩選出16個(gè)候選基因，為后續(xù)CA16致病機(jī)制研究提供基礎(chǔ)。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3288368