目的對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲肌動(dòng)蛋白（Echinococcus granulosus actin EgACT）的結(jié)構(gòu)和抗原表位進(jìn)行分析,為篩選疫苗候選抗原提供依據(jù)。方法采用生物信息學(xué)技術(shù)分析EgACT的理化性質(zhì)和親/疏水性、柔性區(qū)域、抗原指數(shù)、表面可及性、可能的信號(hào)肽序列、跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域、二級(jí)結(jié)構(gòu)及優(yōu)勢(shì)抗原表位。結(jié)果細(xì)粒棘球絳蟲肌動(dòng)蛋白由376個(gè)氨基酸組成,相對(duì)分子質(zhì)量為41.95 k Da,等電點(diǎn)理論值為5.38,不穩(wěn)定系數(shù)為39.28（穩(wěn)定蛋白）;親水區(qū)域明顯;柔性區(qū)域呈散在分布,較明顯的分布區(qū)域位于12-30、37-42、57-63、79-85、107-118、195-208、232-240、282-293、312-319、360-368氨基酸區(qū)段;表面可及性得分較高的區(qū)域主要位于58-63、78-86、109-119、231-244、286-294、312-318、359-365氨基酸區(qū)段;抗原性指數(shù)得分較高區(qū)域與柔性區(qū)域的分布一致;無(wú)信號(hào)肽序列;無(wú)跨膜區(qū);二級(jí)結(jié)構(gòu)中的β轉(zhuǎn)角占6.65%、α螺旋占37.5%、延伸鏈占21.28%、無(wú)規(guī)則卷曲占34.57%,優(yōu)勢(shì)B細(xì)胞表位位于14-29、52... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)高原醫(yī)學(xué)與生物學(xué)雜志. 2020,41(02)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

Eg ACT二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果圖

Swiss model網(wǎng)站構(gòu)建的Eg ACT三級(jí)結(jié)構(gòu)圖

如圖3所示，綜合Expasy和DNAstar Protean軟件分析結(jié)果，該蛋白可明顯看到分布較多的親水性區(qū)域，位于21-30、50-67、70-92、95-106、109-121、191-216、222-246、283-295、311-321、331-340、355-346氨基酸區(qū)段，這些區(qū)域暴露于蛋白表面，易于形成抗原表位。如圖4所示，柔性區(qū)域呈散在分布，較明顯的分布區(qū)域位于12-30、37-42、57-63、79-85、107-118、195-208、232-240、282-293、312-319、360-368氨基酸區(qū)段。表面可及性得分較高的區(qū)域主要位于58-63、78-86、109-119、231-244、286-294、312-318、359-365氨基酸區(qū)段�？乖灾笖�(shù)得分較高區(qū)域與柔性區(qū)域的分布一致。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]棘球蚴(包蟲)病疫苗研究進(jìn)展[J]. 朱國(guó)強(qiáng),閆鴻斌,李立,賈萬(wàn)忠.  中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(01)



本文編號(hào)：3254050