牛乳過敏小鼠結(jié)腸組織miRNA表達(dá)分析及靶基因功能預(yù)測
發(fā)布時(shí)間:2021-05-01 05:04
牛乳β-乳球蛋白(β-Lactoglobulin,β-Lg)過敏嚴(yán)重影響嬰幼兒的健康成長發(fā)育,臨床癥狀主要表現(xiàn)為頻繁胃食管反流、嘔吐、慢性腹瀉、拒食等,是亟需解決的重要食品安全問題。目前,β-Lg過敏炎癥的確切發(fā)病機(jī)理尚不明確。新近研究提示MicroRNA(miRNA)作為腸道黏膜免疫的重要調(diào)控因子,在炎性腸病、病原體感染、腸道腫瘤等多種疾病中發(fā)揮關(guān)鍵作用,已成為疾病分子調(diào)控機(jī)制研究的熱點(diǎn)。但是,迄今為止鮮見報(bào)道剖析miRNA失衡及其靶基因表達(dá)在牛乳過敏發(fā)生發(fā)展中作用。故本研究率先利用Illumina/Solexa高通量測序技術(shù)篩選過敏小鼠結(jié)腸組織中miRNA的表達(dá)譜系,對(duì)差異表達(dá)miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測篩選、基因功能注釋和KEGG信號(hào)通路分析。為闡述β-Lg過敏炎癥的發(fā)病機(jī)制提供新的理論依據(jù),為過敏炎癥的預(yù)治提供新的干預(yù)靶點(diǎn)。(1)過敏動(dòng)物模型的建立和驗(yàn)證5-6周齡雌性KM小鼠隨機(jī)分為正常組和過敏組(n=20)。牛乳過敏組小鼠每周1次進(jìn)行腹腔注射0.2 mLβ-Lg(1 mg/mL),共3周。第4周對(duì)小鼠進(jìn)行β-Lg過敏原口服激發(fā)后頸椎脫臼處死。模型構(gòu)建結(jié)束后,對(duì)小鼠的過敏體征評(píng)分、...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 立題背景
1.2 牛乳過敏及其引發(fā)的相關(guān)炎癥反應(yīng)
1.2.1 牛乳過敏的概述
1.2.2 牛乳過敏引發(fā)的相關(guān)炎癥反應(yīng)
1.3 miRNA的研究概況
1.3.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)與命名
1.3.2 miRNA的生物合成及功能
1.3.3 miRNA的基本特征及分布
1.3.4 miRNA的鑒定及檢測方法
1.3.5 miRNA靶基因的預(yù)測與鑒定
1.4 miRNA在腸道及相關(guān)炎癥疾病中的研究
1.4.1 miRNA在腸道中的功能研究
1.4.2 miRNA在相關(guān)炎癥疾病中的研究
1.5 本研究的目的意義
1.6 擬采用的技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試劑和來源
2.2 儀器與設(shè)備
2.3 主要數(shù)據(jù)庫及生物軟件
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 構(gòu)建β-乳球蛋白過敏動(dòng)物模型
2.4.2 β-乳球蛋白致敏模型驗(yàn)證評(píng)估
2.4.3 β-乳球蛋白過敏相關(guān)抗體及炎癥因子水平變化檢測
2.4.4 miRNA高通量測序
2.4.5 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測及功能注釋
2.4.6 差異表達(dá)miRNA及靶基因qRT-PCR驗(yàn)證
2.4.7 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 β-乳球蛋白致敏動(dòng)物模型構(gòu)建評(píng)估
3.1.1 β-Lg過敏對(duì)小鼠體征指標(biāo)的影響
3.1.2 β-Lg過敏對(duì)相關(guān)炎癥抗體及細(xì)胞因子的影響
3.2 Small RNA測序分析
3.2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量及長度分布
3.2.2 已知和新miRNA分析鑒定
3.2.3 miRNA的特征分析
3.3 β-乳球蛋白過敏炎癥中miRNA差異表達(dá)分析
3.3.1 miRNA差異表達(dá)分析
3.3.2 差異表達(dá)miRNA的聚類分析
3.3.3 差異表達(dá)miRNA的qRT-PCR驗(yàn)證
3.4 差異miRNA靶基因預(yù)測及富集分析
3.4.1 差異miRNA靶基因預(yù)測
3.4.2 靶基因的GO富集性分析
3.4.3 靶基因的KEGG通路富集分析
3.4.4 差異miRNA靶基因的qRT-PCR驗(yàn)證
4 討論
4.1 β-乳球蛋白過敏差異miRNA篩選及分析
4.1.1 β-Lg過敏小鼠miRNA表達(dá)譜分析
4.1.2 β-Lg過敏小鼠差異表達(dá)miRNA篩選
4.2 β-Lg過敏差異miRNA驗(yàn)證及在相關(guān)疾病中的研究
4.2.1 β-Lg過敏差異表達(dá)miRNA驗(yàn)證
4.2.2 β-Lg過敏差異表達(dá)miRNA在相關(guān)疾病中的研究
4.3 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測及生物信息分析
4.3.1 差異miRNA靶基因預(yù)測及驗(yàn)證
4.3.2 差異miRNA靶基因的功能預(yù)測分析
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高通量測序技術(shù)分析急性髓系白血病血漿外泌體微RNA表達(dá)譜差異[J]. 田淼,譚三勤,劉靜茹,王曉華,肖紅,葛敏. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]miRNA-10a表達(dá)與炎癥性腸病患者炎性反應(yīng)的關(guān)系及診斷意義研究[J]. 王麗強(qiáng),林思彤,邵琦,玄延花. 中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2015(01)
[3]MAPK信號(hào)通路在骨關(guān)節(jié)炎發(fā)病機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 高世超,殷海波,劉宏瀟,眭蘊(yùn)慧. 中國骨傷. 2014(05)
[4]microRNA在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中的作用及其機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 馬倩,李向培. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2014(05)
[5]Th17、Treg細(xì)胞與銀屑病的關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 曠翠娥,陳小紅. 皮膚性病診療學(xué)雜志. 2012(05)
[6]PI3K信號(hào)通路及其抑制劑抗惡性腫瘤的研究進(jìn)展[J]. 陳正軍,黃翔. 實(shí)用醫(yī)院臨床雜志. 2011(03)
碩士論文
[1]牛乳β-乳球蛋白過敏中Th17/Treg細(xì)胞失衡的作用研究[D]. 鄭全玲.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]黑腹果蠅基因間與基因內(nèi)microRNA的表達(dá)及進(jìn)化保守性分析[D]. 李亞芳.南京師范大學(xué) 2014
[3]銀屑病皮損與正常皮膚組織miRNA表達(dá)差異分析[D]. 張靜.天津醫(yī)科大學(xué) 2011
本文編號(hào):3170167
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 立題背景
1.2 牛乳過敏及其引發(fā)的相關(guān)炎癥反應(yīng)
1.2.1 牛乳過敏的概述
1.2.2 牛乳過敏引發(fā)的相關(guān)炎癥反應(yīng)
1.3 miRNA的研究概況
1.3.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)與命名
1.3.2 miRNA的生物合成及功能
1.3.3 miRNA的基本特征及分布
1.3.4 miRNA的鑒定及檢測方法
1.3.5 miRNA靶基因的預(yù)測與鑒定
1.4 miRNA在腸道及相關(guān)炎癥疾病中的研究
1.4.1 miRNA在腸道中的功能研究
1.4.2 miRNA在相關(guān)炎癥疾病中的研究
1.5 本研究的目的意義
1.6 擬采用的技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試劑和來源
2.2 儀器與設(shè)備
2.3 主要數(shù)據(jù)庫及生物軟件
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 構(gòu)建β-乳球蛋白過敏動(dòng)物模型
2.4.2 β-乳球蛋白致敏模型驗(yàn)證評(píng)估
2.4.3 β-乳球蛋白過敏相關(guān)抗體及炎癥因子水平變化檢測
2.4.4 miRNA高通量測序
2.4.5 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測及功能注釋
2.4.6 差異表達(dá)miRNA及靶基因qRT-PCR驗(yàn)證
2.4.7 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 β-乳球蛋白致敏動(dòng)物模型構(gòu)建評(píng)估
3.1.1 β-Lg過敏對(duì)小鼠體征指標(biāo)的影響
3.1.2 β-Lg過敏對(duì)相關(guān)炎癥抗體及細(xì)胞因子的影響
3.2 Small RNA測序分析
3.2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量及長度分布
3.2.2 已知和新miRNA分析鑒定
3.2.3 miRNA的特征分析
3.3 β-乳球蛋白過敏炎癥中miRNA差異表達(dá)分析
3.3.1 miRNA差異表達(dá)分析
3.3.2 差異表達(dá)miRNA的聚類分析
3.3.3 差異表達(dá)miRNA的qRT-PCR驗(yàn)證
3.4 差異miRNA靶基因預(yù)測及富集分析
3.4.1 差異miRNA靶基因預(yù)測
3.4.2 靶基因的GO富集性分析
3.4.3 靶基因的KEGG通路富集分析
3.4.4 差異miRNA靶基因的qRT-PCR驗(yàn)證
4 討論
4.1 β-乳球蛋白過敏差異miRNA篩選及分析
4.1.1 β-Lg過敏小鼠miRNA表達(dá)譜分析
4.1.2 β-Lg過敏小鼠差異表達(dá)miRNA篩選
4.2 β-Lg過敏差異miRNA驗(yàn)證及在相關(guān)疾病中的研究
4.2.1 β-Lg過敏差異表達(dá)miRNA驗(yàn)證
4.2.2 β-Lg過敏差異表達(dá)miRNA在相關(guān)疾病中的研究
4.3 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測及生物信息分析
4.3.1 差異miRNA靶基因預(yù)測及驗(yàn)證
4.3.2 差異miRNA靶基因的功能預(yù)測分析
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高通量測序技術(shù)分析急性髓系白血病血漿外泌體微RNA表達(dá)譜差異[J]. 田淼,譚三勤,劉靜茹,王曉華,肖紅,葛敏. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]miRNA-10a表達(dá)與炎癥性腸病患者炎性反應(yīng)的關(guān)系及診斷意義研究[J]. 王麗強(qiáng),林思彤,邵琦,玄延花. 中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2015(01)
[3]MAPK信號(hào)通路在骨關(guān)節(jié)炎發(fā)病機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 高世超,殷海波,劉宏瀟,眭蘊(yùn)慧. 中國骨傷. 2014(05)
[4]microRNA在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中的作用及其機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 馬倩,李向培. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2014(05)
[5]Th17、Treg細(xì)胞與銀屑病的關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 曠翠娥,陳小紅. 皮膚性病診療學(xué)雜志. 2012(05)
[6]PI3K信號(hào)通路及其抑制劑抗惡性腫瘤的研究進(jìn)展[J]. 陳正軍,黃翔. 實(shí)用醫(yī)院臨床雜志. 2011(03)
碩士論文
[1]牛乳β-乳球蛋白過敏中Th17/Treg細(xì)胞失衡的作用研究[D]. 鄭全玲.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]黑腹果蠅基因間與基因內(nèi)microRNA的表達(dá)及進(jìn)化保守性分析[D]. 李亞芳.南京師范大學(xué) 2014
[3]銀屑病皮損與正常皮膚組織miRNA表達(dá)差異分析[D]. 張靜.天津醫(yī)科大學(xué) 2011
本文編號(hào):3170167
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