目的預(yù)測和分析肺炎鏈球菌stkp基因序列及其編碼蛋白的理化性質(zhì)。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫獲取stkP基因信息;應(yīng)用EXPASYP、TMHMM、Net Phos、Signal、Conserved Domains在線軟件預(yù)測stkP基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、跨膜區(qū)、信號肽、磷酸化位點和結(jié)構(gòu)域;利用PBIL-GERLAND在線軟件分析蛋白二級結(jié)構(gòu);采用Swiss-Model同源建模方法建立蛋白三級結(jié)構(gòu)模型;應(yīng)用String軟件預(yù)測可與StkP蛋白發(fā)生相互作用的蛋白質(zhì)。結(jié)果 StkP蛋白質(zhì)是由659個氨基酸組成的無信號肽、有跨膜結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定親水蛋白質(zhì),等電點為8.45;可能存在絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸等磷酸化位點;結(jié)構(gòu)域由胞外區(qū)、跨膜區(qū)和胞內(nèi)區(qū)構(gòu)成,其中胞外區(qū)包含4個PASTA （penicillin-binding protein and Ser/Thr kinase-associated）domains;二級結(jié)構(gòu)包括24個α螺旋和13個β折疊片層;StkP主要定位于細(xì)胞核,自身蛋白質(zhì)主要參與β-內(nèi)酰胺類抗生素相互作用。結(jié)論 StkP蛋白為親水蛋白,可為蛋白的克隆表達(dá)、其抗原性研究和表位疫苗的研發(fā)... 

【文章來源】：中國病原生物學(xué)雜志. 2020,15(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1 基因及蛋白序列
    2 方法
        2.1 StkP蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及親（疏）水性分析
        2.2 StkP蛋白的跨膜區(qū)、信號肽分析
        2.3 StkP蛋白的磷酸化位點分析
        2.4 StkP蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.5 StkP蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測及建模
        2.6 StkP蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析
        2.7 StkP相互作用蛋白預(yù)測分析
結(jié)果
    1 StkP蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及親（疏）水性
    2 StkP蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)域及信號肽
    3 StkP蛋白質(zhì)的磷酸化位點
    4 StkP蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)
    5 StkP蛋白三級結(jié)構(gòu)
    6 StkP蛋白的結(jié)構(gòu)域
    7 StkP蛋白相互作用蛋白預(yù)測
討論



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