探究DYRK1A和CBP/p300復(fù)合物在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控過(guò)程中的作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2021-03-24 02:07
DYRK1A,全稱(chēng)為雙特異性酪氨酸激酶(Dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinase 1A),是一種劑量依賴(lài)性的絲氨酸/蘇氨酸激酶。它在細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)中均有分布,這提示它既可以在細(xì)胞質(zhì)又可以在細(xì)胞核中發(fā)揮功能。本課題利用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,鑒定出兩種組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferases)CBP和p300可以和DYRK1A相互作用。由于目前DYRK1A調(diào)控基因表達(dá)分子機(jī)制并不明確,于是本課題主要研究了DYRK1A在細(xì)胞核中的功能。通過(guò)DYRK1A的基因組定位分析技術(shù)(ChIP-sequencing),發(fā)現(xiàn)大多數(shù)DYRK1A的peaks和CBP/p300的peaks共定位于增強(qiáng)子區(qū)域或者轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近。過(guò)表達(dá)DYRK1A會(huì)導(dǎo)致CBP和p300的超磷酸化(hyperphosphorylation),而通過(guò)shRNA敲減DYRK1A會(huì)導(dǎo)致下游靶基因的表達(dá)下調(diào)。此外,將DYRK1A敲減之后,會(huì)使這些基因上H3K27ac的水平明顯降低,這說(shuō)明DYRK1A可以調(diào)控這些基因的增強(qiáng)子區(qū)域的CBP/...
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:91 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
表觀遺傳學(xué)通路
Figure 2 The chromatin code.圖 2 染色質(zhì)代碼。圖片來(lái)源:(Keating and El-Osta 2015)染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體。核小體是由約 147bp 的 DNA 環(huán)繞在組蛋白八聚體上
Figure 4 The schematic diagram of DYRK1A structure.圖 4 DYRK1A 結(jié)構(gòu)示意圖。圖片參考(Alvarez, Estivill et al. 2003)修改而成。YRK1A 蛋白全長(zhǎng) 763 個(gè)氨基酸,其中氨基酸 105-139 為其主要的核定位信號(hào)-479 是其激酶活性區(qū)域。酶活性區(qū)域之后是一個(gè) PEST 區(qū)域和一個(gè) S/T 重復(fù)序NLS)序列,一個(gè)酶活性區(qū)域,一個(gè) PEST 區(qū)域和一個(gè)絲氨酸/蘇氨其中 159-479 氨基酸為 DYRK1A 的激酶活性區(qū)域(圖 4)(Alvarez,2003)。在 DYRK1A 的酶活性區(qū)域,第 188 位的賴(lài)氨酸被認(rèn)為是 AT,將該位點(diǎn)的賴(lài)氨酸突變?yōu)榫彼岷,DYRK1A 的激酶活性會(huì)rup, Becker et al. 1996, Himpel, Panzer et al. 2001)。而 GFP-DYRK1A分析則顯示,DYRK1A 的核定位由其核定位信號(hào)(NLS,氨基酸 105但其特異性的亞核定位則依賴(lài)于另外的N-末端元件(氨基酸1-104)(
本文編號(hào):3096849
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【部分圖文】:
表觀遺傳學(xué)通路
Figure 2 The chromatin code.圖 2 染色質(zhì)代碼。圖片來(lái)源:(Keating and El-Osta 2015)染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體。核小體是由約 147bp 的 DNA 環(huán)繞在組蛋白八聚體上
Figure 4 The schematic diagram of DYRK1A structure.圖 4 DYRK1A 結(jié)構(gòu)示意圖。圖片參考(Alvarez, Estivill et al. 2003)修改而成。YRK1A 蛋白全長(zhǎng) 763 個(gè)氨基酸,其中氨基酸 105-139 為其主要的核定位信號(hào)-479 是其激酶活性區(qū)域。酶活性區(qū)域之后是一個(gè) PEST 區(qū)域和一個(gè) S/T 重復(fù)序NLS)序列,一個(gè)酶活性區(qū)域,一個(gè) PEST 區(qū)域和一個(gè)絲氨酸/蘇氨其中 159-479 氨基酸為 DYRK1A 的激酶活性區(qū)域(圖 4)(Alvarez,2003)。在 DYRK1A 的酶活性區(qū)域,第 188 位的賴(lài)氨酸被認(rèn)為是 AT,將該位點(diǎn)的賴(lài)氨酸突變?yōu)榫彼岷,DYRK1A 的激酶活性會(huì)rup, Becker et al. 1996, Himpel, Panzer et al. 2001)。而 GFP-DYRK1A分析則顯示,DYRK1A 的核定位由其核定位信號(hào)(NLS,氨基酸 105但其特異性的亞核定位則依賴(lài)于另外的N-末端元件(氨基酸1-104)(
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