胱硫醚-γ-裂合酶（Cystathionine-γ-lyase,CSE）是一種參與半胱氨酸合成并催化H₂S生成的關(guān)鍵性限速酶,具有信號傳導(dǎo)和細胞保護作用。分析人CSE蛋白的結(jié)構(gòu)及其功能對了解其調(diào)控機制具有重要意義。利用生物信息數(shù)據(jù)庫和分析軟件,對人CSE蛋白進行分子結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析。結(jié)果顯示:人CSE蛋白位于人類1號染色體,含有373個氨基酸是穩(wěn)定的親水性蛋白,不具有跨膜結(jié)構(gòu),無信號肽屬于非分泌性蛋白,蛋白二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,含有保守結(jié)構(gòu)域、蛋白定位于細胞質(zhì)的可能性大、具有大量的絲氨酸（Ser）磷酸化位點和較少的酪氨酸（Tyr）磷酸化位點、與TST、TXNRD1等蛋白有結(jié)合能力。對CSE蛋白的分子結(jié)構(gòu)與功能分析為深入研究CSE蛋白的作用機制提供了研究基礎(chǔ)。 

【文章來源】：生物信息學(xué). 2020,18(03)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

人CSE蛋白磷酸化位點預(yù)測

利用SWISS-MODEL預(yù)測人CSE蛋白的三級結(jié)構(gòu),GMQE為0.97,QMEAN為-0.54,序列與BLAST數(shù)據(jù)庫中5tsu.1模板序列相似性高達99.19%,表明該模型結(jié)構(gòu)合理,該蛋白質(zhì)存在較多扭曲,結(jié)構(gòu)較豐富,這對其生物學(xué)功能具有重要作用(見圖8)。2.10 人CSE蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

使用STRING預(yù)測人CSE蛋白互作網(wǎng)絡(luò),設(shè)置為高置信度0.7,限制數(shù)量10個。結(jié)果發(fā)現(xiàn)人CSE蛋白與DLD、TST、CBSL、TXNRD1等蛋白質(zhì)具有相互作用(見圖9)。對以上互作蛋白的基因進行GO分析和KEGG通路分析,GO分析結(jié)果表明互作基因主要參與輔因子結(jié)合、維生素結(jié)合和催化活化等分子功能(見表3)涉及硫氨基酸代謝過程、硫氨基酸生物合成、α-氨基酸生物合成、細胞氨基酸代謝等生物過程(見表4)。KEGG通路分析結(jié)果顯示,互作基因顯著富集于半胱氨酸與蛋氨酸代謝、甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝、氨基酸生物合成、硒化合物代謝等通路中(見表5)。表3 GO分子功能分類結(jié)果Table 3 GO molecular function results ID 分子功能注釋 基因數(shù)量 / 個 錯誤發(fā)現(xiàn)率 GO:0048037 輔因子結(jié)合 7 1.39×10-7 GO:0050662 輔酶結(jié)合 6 1.41×10-7 GO:0019842 維生素結(jié)合 4 2.06×10-5 GO:0003824 催化活性 11 2.10×10-5

【參考文獻】：
期刊論文
[1]內(nèi)源性硫化氫對硫酸鈹致大鼠肺組織急性損傷影響[J]. 廖永紅,黃煉,王淑娟,胡立丹,張朝暉.  中國職業(yè)醫(yī)學(xué). 2013(05)



本文編號：3095125