結(jié)核分枝桿菌PE/PPE家族蛋白的性質(zhì)及其在與宿主細(xì)胞相互作用中的功能
發(fā)布時間:2021-02-17 08:24
結(jié)核分枝桿菌感染導(dǎo)致的結(jié)核病仍然威脅著全球人類健康。由于多藥物耐受和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌的出現(xiàn),尤其是HIV共感染,結(jié)核病的形勢極其嚴(yán)峻。結(jié)核分枝桿菌能夠通過多種機(jī)制逃逸宿主免疫系統(tǒng)是其作為成功病原菌的原因之一。從結(jié)核分枝桿菌基因組解密揭示了重要的信息,包括重要的PE/PPE蛋白家族。結(jié)核分枝桿菌PE/PPE家族蛋白是由PE和PPE亞家族構(gòu)成,占結(jié)核分枝桿菌編碼能力的10%。PE亞家族是根據(jù)其N末端保守的P(Pro)-E(Glu)而命名,含有100個成員,具有由110個保守的氨基酸殘基編碼的N末端結(jié)構(gòu)域,而其C末端序列長度大小不一,并富含GC核苷酸的重復(fù)序列PGRS。PE亞家族含有37個pe編碼基因和61個pepgrs基因。PPE亞家族是根據(jù)其N末端Pro(P)-Pro(P)-Glu(E)序列命名,包含69個成員,根據(jù)其C末端結(jié)構(gòu)域特征主要分為三類PPESVP,PPEPPW和PPEMPTR亞家族。這些蛋白特有的序列可能暗示了它們在結(jié)核分枝桿菌感染中具有特殊的生理功能。PE/PPE家族蛋白幾乎只存在于...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1 結(jié)核病
2 堪稱“分子魔杖”的結(jié)核分枝桿菌PE/PPE家族蛋白
3 PE/PPE蛋白的分類
4 PE/PPE蛋白結(jié)構(gòu)特征
5 PE/PPE家族蛋白的亞細(xì)胞定位
6 PE/PPE蛋白的分泌
7 PE/PPE蛋白的表達(dá)
7.1 PE/PPE在胞外多種壓力條件下的差異表達(dá)
7.2 胞內(nèi)感染條件下差異表達(dá)
8 PE/PPE蛋白的調(diào)控
8.1 Sigma因子
8.2 擬核相關(guān)的全局性轉(zhuǎn)錄因子
8.3 雙組份調(diào)控系統(tǒng)
8.4 其他轉(zhuǎn)錄因子
9 PE/PPE蛋白的功能
9.1 參與分枝桿菌能量代謝
9.2 PE/PPE蛋白促進(jìn)分枝桿菌體外生長
9.3 PE/PPE蛋白促進(jìn)分枝桿菌在宿主體內(nèi)存活
9.4 PE/PPE誘導(dǎo)宿主細(xì)胞死亡
9.5 PE/PPE蛋白具有纖維蛋白結(jié)合功能
9.6 PE/PPE蛋白干擾巨噬細(xì)胞功能
9.7 PE/PPE蛋白影響抗原遞呈
9.8 C末端結(jié)構(gòu)域是抗原變異的來源
9.9 其他功能
10 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主免疫反應(yīng)
10.1 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主天然免疫反應(yīng)
10.2 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主體液反應(yīng)
11 PE/PPE蛋白作為疫苗靶標(biāo)和分子診斷標(biāo)記
11.1 PE/PPE蛋白作為診斷標(biāo)記
11.2 PE/PPE蛋白作為疫苗靶標(biāo)
參考文獻(xiàn)
第2章 緒論
1 選題依據(jù)、研究目的與意義
2 科學(xué)問題
3 研究內(nèi)容與技術(shù)路線
4 本文創(chuàng)新點
5 本文不足之處
第3章 結(jié)核分枝桿菌PE亞家族蛋白PE11(Rv1169c)的功能研究
1 引言
2 實驗材料
2.1 實驗質(zhì)粒、菌株與細(xì)胞系
2.2 主要試劑
2.3 主要培養(yǎng)基
2.4 主要溶液
2.5 主要儀器
3 實驗方法
3.1 構(gòu)建表達(dá)Rv1169c基因的重組恥垢分枝桿菌
3.2 分析Rv1169c在恥垢分枝桿菌中的表達(dá)
3.3 重組恥垢分枝桿菌的亞細(xì)胞定位分析
3.4 重組恥垢分枝桿菌脂肪酸測定
3.5 體外分析重組恥垢分枝桿菌在不同壓力條件下的生存能力
3.6 重組恥垢分枝桿菌對抗結(jié)核藥物敏感性分析
3.7 重組恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)存活分析
3.8 重組恥垢分枝桿菌對巨噬細(xì)胞活力的影響
3.9 利用熒光定量RT-PCR和ELISA對細(xì)胞因子表達(dá)的分析
4 實驗結(jié)果與分析
4.1 Rv1169c成功表達(dá)于恥垢分枝桿菌
4.2 Rv1169c蛋白定位于恥垢分枝桿菌細(xì)胞壁
4.3 Rv1169c改變恥垢分枝桿菌細(xì)胞壁脂肪酸組分
4.4 Rv1169c促使恥垢分枝桿菌對抗生素高度敏感
4.5 Rv1169c減弱重組恥垢分枝桿菌的抗壓能力
4.6 Rv1169c增加恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)存活
4.7 Rv1169c促進(jìn)巨噬細(xì)胞的死亡
4.8 Rv1169c選擇性調(diào)控外周促炎細(xì)胞因子IL-6 分泌
5 結(jié)果與討論
6 實驗小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第4章 結(jié)核分枝桿菌PPE亞家族蛋白Rv1808在宿主信號傳遞中的作用
1 引言
2 實驗材料
2.1 蛋白純化與復(fù)性相關(guān)試劑
2.2 Pull-down實驗相關(guān)
2.3 ELISA相關(guān)試劑
2.4 MTT實驗相關(guān)
3 實驗方法
3.1 rRv1808蛋白的表達(dá)與純化
3.2 重組恥垢分枝桿菌構(gòu)建與鑒定
3.3 重組恥垢分枝桿菌亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的分離與鑒定
3.4 Pull-down實驗分析
3.5 細(xì)胞因子檢測
3.6 細(xì)胞信號通路分析
Rv1808侵染U937巨噬細(xì)胞后的存活率檢測"> 3.7 MsRv1808侵染U937巨噬細(xì)胞后的存活率檢測
3.8 MTT測定巨噬細(xì)胞活力
3.9 LDH測定
4 結(jié)果與分析
4.1 rRv1808蛋白的表達(dá)與純化
4.2 rRv1808表達(dá)于分枝桿菌細(xì)胞壁
4.3 rRv1808與TLR2相互作用
4.4 rRv1808蛋白促進(jìn)細(xì)胞因子分泌
4.5 rRv1808特異性促進(jìn)細(xì)胞因子分泌
4.6 rRv1808通過MAPKs和NF-κB信號通路促進(jìn)TNF-α,IL-6 和IL-10的分泌
4.7 Rv1808促進(jìn)恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)生存
4.8 MTT證明rRv1808蛋白影響巨噬細(xì)胞生存能力
4.9 LDH證明rRv1808不影響細(xì)胞裂解
5 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
在學(xué)期間發(fā)表的論文
在學(xué)期間參加的課題
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]結(jié)核分枝桿菌Rv1168c蛋白的基因表達(dá)、純化及結(jié)構(gòu)分析[J]. 余曉麗,孫戰(zhàn)強(qiáng),周晨俊,溫子祿,陳軍,孫慶文,王洪海,張舒林. 微生物學(xué)報. 2010(07)
本文編號:3037718
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1 結(jié)核病
2 堪稱“分子魔杖”的結(jié)核分枝桿菌PE/PPE家族蛋白
3 PE/PPE蛋白的分類
4 PE/PPE蛋白結(jié)構(gòu)特征
5 PE/PPE家族蛋白的亞細(xì)胞定位
6 PE/PPE蛋白的分泌
7 PE/PPE蛋白的表達(dá)
7.1 PE/PPE在胞外多種壓力條件下的差異表達(dá)
7.2 胞內(nèi)感染條件下差異表達(dá)
8 PE/PPE蛋白的調(diào)控
8.1 Sigma因子
8.2 擬核相關(guān)的全局性轉(zhuǎn)錄因子
8.3 雙組份調(diào)控系統(tǒng)
8.4 其他轉(zhuǎn)錄因子
9 PE/PPE蛋白的功能
9.1 參與分枝桿菌能量代謝
9.2 PE/PPE蛋白促進(jìn)分枝桿菌體外生長
9.3 PE/PPE蛋白促進(jìn)分枝桿菌在宿主體內(nèi)存活
9.4 PE/PPE誘導(dǎo)宿主細(xì)胞死亡
9.5 PE/PPE蛋白具有纖維蛋白結(jié)合功能
9.6 PE/PPE蛋白干擾巨噬細(xì)胞功能
9.7 PE/PPE蛋白影響抗原遞呈
9.8 C末端結(jié)構(gòu)域是抗原變異的來源
9.9 其他功能
10 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主免疫反應(yīng)
10.1 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主天然免疫反應(yīng)
10.2 PE/PPE蛋白調(diào)控宿主體液反應(yīng)
11 PE/PPE蛋白作為疫苗靶標(biāo)和分子診斷標(biāo)記
11.1 PE/PPE蛋白作為診斷標(biāo)記
11.2 PE/PPE蛋白作為疫苗靶標(biāo)
參考文獻(xiàn)
第2章 緒論
1 選題依據(jù)、研究目的與意義
2 科學(xué)問題
3 研究內(nèi)容與技術(shù)路線
4 本文創(chuàng)新點
5 本文不足之處
第3章 結(jié)核分枝桿菌PE亞家族蛋白PE11(Rv1169c)的功能研究
1 引言
2 實驗材料
2.1 實驗質(zhì)粒、菌株與細(xì)胞系
2.2 主要試劑
2.3 主要培養(yǎng)基
2.4 主要溶液
2.5 主要儀器
3 實驗方法
3.1 構(gòu)建表達(dá)Rv1169c基因的重組恥垢分枝桿菌
3.2 分析Rv1169c在恥垢分枝桿菌中的表達(dá)
3.3 重組恥垢分枝桿菌的亞細(xì)胞定位分析
3.4 重組恥垢分枝桿菌脂肪酸測定
3.5 體外分析重組恥垢分枝桿菌在不同壓力條件下的生存能力
3.6 重組恥垢分枝桿菌對抗結(jié)核藥物敏感性分析
3.7 重組恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)存活分析
3.8 重組恥垢分枝桿菌對巨噬細(xì)胞活力的影響
3.9 利用熒光定量RT-PCR和ELISA對細(xì)胞因子表達(dá)的分析
4 實驗結(jié)果與分析
4.1 Rv1169c成功表達(dá)于恥垢分枝桿菌
4.2 Rv1169c蛋白定位于恥垢分枝桿菌細(xì)胞壁
4.3 Rv1169c改變恥垢分枝桿菌細(xì)胞壁脂肪酸組分
4.4 Rv1169c促使恥垢分枝桿菌對抗生素高度敏感
4.5 Rv1169c減弱重組恥垢分枝桿菌的抗壓能力
4.6 Rv1169c增加恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)存活
4.7 Rv1169c促進(jìn)巨噬細(xì)胞的死亡
4.8 Rv1169c選擇性調(diào)控外周促炎細(xì)胞因子IL-6 分泌
5 結(jié)果與討論
6 實驗小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第4章 結(jié)核分枝桿菌PPE亞家族蛋白Rv1808在宿主信號傳遞中的作用
1 引言
2 實驗材料
2.1 蛋白純化與復(fù)性相關(guān)試劑
2.2 Pull-down實驗相關(guān)
2.3 ELISA相關(guān)試劑
2.4 MTT實驗相關(guān)
3 實驗方法
3.1 rRv1808蛋白的表達(dá)與純化
3.2 重組恥垢分枝桿菌構(gòu)建與鑒定
3.3 重組恥垢分枝桿菌亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的分離與鑒定
3.4 Pull-down實驗分析
3.5 細(xì)胞因子檢測
3.6 細(xì)胞信號通路分析
Rv1808侵染U937巨噬細(xì)胞后的存活率檢測"> 3.7 MsRv1808侵染U937巨噬細(xì)胞后的存活率檢測
3.8 MTT測定巨噬細(xì)胞活力
3.9 LDH測定
4 結(jié)果與分析
4.1 rRv1808蛋白的表達(dá)與純化
4.2 rRv1808表達(dá)于分枝桿菌細(xì)胞壁
4.3 rRv1808與TLR2相互作用
4.4 rRv1808蛋白促進(jìn)細(xì)胞因子分泌
4.5 rRv1808特異性促進(jìn)細(xì)胞因子分泌
4.6 rRv1808通過MAPKs和NF-κB信號通路促進(jìn)TNF-α,IL-6 和IL-10的分泌
4.7 Rv1808促進(jìn)恥垢分枝桿菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)生存
4.8 MTT證明rRv1808蛋白影響巨噬細(xì)胞生存能力
4.9 LDH證明rRv1808不影響細(xì)胞裂解
5 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
在學(xué)期間發(fā)表的論文
在學(xué)期間參加的課題
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]結(jié)核分枝桿菌Rv1168c蛋白的基因表達(dá)、純化及結(jié)構(gòu)分析[J]. 余曉麗,孫戰(zhàn)強(qiáng),周晨俊,溫子祿,陳軍,孫慶文,王洪海,張舒林. 微生物學(xué)報. 2010(07)
本文編號:3037718
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