目的了解西藏阿里地區(qū)細(xì)粒棘球蚴人體分離株的優(yōu)勢基因型及遺傳變異情況,為細(xì)粒棘球絳蟲的溯源及阿里地區(qū)棘球蚴病預(yù)防控制策略的制定提供支持。方法收集阿里地區(qū)某醫(yī)院2017年棘球蚴病患者病灶切除樣品,提取DNA,PCR擴增線粒體NADH脫氫酶1（nad1）基因,擴增產(chǎn)物測序后用BLAST、ClustalX 1.83和MEGA 7.0軟件進(jìn)行同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析。下載全國細(xì)粒棘球蚴人體分離株的nad1基因,利用DnaSP6分析單倍型;利用NetWork軟件制作中國細(xì)粒棘球絳蟲nad1基因的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果共收集80例細(xì)粒棘球蚴病患者病灶切除樣品,其中38份樣品PCR擴增出約550 bp的特異性條帶。測序分析結(jié)果顯示,4份樣品為細(xì)粒棘球絳蟲G6基因型,與蒙古人來源的序列（MH300971.1）一致性為99.8%;其余34份樣品均為細(xì)粒棘球絳蟲G1基因型,與標(biāo)準(zhǔn)序列（AF297617.1）相比,其535位的C堿基突變?yōu)镚堿基,與阿爾及利亞人來源序列（MG672293.1）的一致性為100%。MEGA 7.0軟件分析38份樣品的序列,結(jié)果顯示,T、C、A和G堿基占比依次為44.3%～46.5%、7.... 

【文章來源】：中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2020,38(01)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

阿里地區(qū)細(xì)粒棘球蚴人體分離株nad1基因擴增結(jié)果

圖2 基于線粒體nad1基因序列以鄰接法構(gòu)建的阿里地區(qū)細(xì)粒棘球蚴人體分離株系統(tǒng)進(jìn)化樹基于nad1序列以鄰接法構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)與Yang等[30]報道的相似，G6、G7、G8與G10基因型聚集在細(xì)粒棘球絳蟲加拿大株，G1、G3基因型聚集在細(xì)粒棘球絳蟲狹義株。在我國終末宿主（犬和狼)體內(nèi)，已發(fā)現(xiàn)細(xì)粒棘球絳蟲G1、G3和G6基因型；在中間宿主山羊和綿羊體內(nèi)發(fā)現(xiàn)細(xì)粒棘球絳蟲G1、G6和G8基因型；在牛和駱駝體內(nèi)發(fā)現(xiàn)細(xì)粒棘球蚴G1、G3和G6基因型；人體感染的細(xì)粒棘球絳蟲主要是G1、G3、G6、G7和G10基因型[28,31-32]。阿里地區(qū)動物資源豐富，除了牧民養(yǎng)殖的牛、羊、犬外，還有野牛、野驢和黃羊等偶蹄類動物，為細(xì)粒棘球絳蟲多種基因型等的存在創(chuàng)造了條件。但本研究只發(fā)現(xiàn)了細(xì)粒棘球絳蟲的G1和G6基因型，除了與不同的基因型感染宿主的能力有關(guān)，可能也與該研究的樣本量較少有關(guān)。單倍型多樣性和核苷酸多樣性常用來衡量種群間和種群內(nèi)的多樣性，本研究基于全國細(xì)粒棘球蚴人體分離株共44條nad1序列的分析，發(fā)現(xiàn)了9個單倍型，單倍型多樣性為0.47，核酸多樣性為0.19，大于0.01，說明全國范圍細(xì)粒棘球蚴的遺傳變異較大。單倍型網(wǎng)絡(luò)圖顯示H4為我國nad1基因主要的單倍型，在西藏、內(nèi)蒙古和黑龍江等�。ㄗ灾螀^(qū)）均有分布。說明該單倍型分布廣泛，在基因多態(tài)性相關(guān)的研究中要予以重視。

本研究對阿里地區(qū)棘球蚴人體分離株樣品采用PCR方法擴增nad1基因，并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析。有38份患者樣品擴增出約550 bp的特異性條帶，其中4份為細(xì)粒棘球絳蟲G6基因型，其余34份均為細(xì)粒棘球絳蟲G1基因型。這些基因型在國內(nèi)均有報道[28]。阿里地區(qū)生產(chǎn)類型主要是牧業(yè)和半農(nóng)半牧業(yè)，細(xì)粒棘球絳蟲G1基因型是阿里地區(qū)主要的基因型，其適宜中間宿主羊是該地區(qū)的主要經(jīng)濟來源。有文獻(xiàn)報道nad1變異率較高，本研究34份G1基因型的nad1序列與標(biāo)準(zhǔn)序列（AF297617.1）對比，僅在535位有一個堿基突變，與張學(xué)勇等[29]報道的不相符，可能與不是全長測序有關(guān)。38份細(xì)粒棘球蚴分離株的DNA序列里堿基A+T總量約為70%，堿基分布存在偏性，與延寧等[18]報道相似。圖3 基于線粒體nad1基因序列構(gòu)建的中國細(xì)粒棘球蚴單倍型網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國棘球蚴病防控進(jìn)展及其存在的問題[J]. 汪天平,操治國.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(03)
[2]青海天峻地區(qū)人和羊源細(xì)粒棘球蚴流行株基因分型及基因多態(tài)性研究[J]. 張學(xué)勇,簡瑩娜,李秀萍,韓秀敏,才旦卓瑪,李福壽,馬利青.  中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[3]2012-2016年中國棘球蚴病抽樣調(diào)查分析[J]. 伍衛(wèi)平,王虎,王謙,周曉農(nóng),王立英,鄭燦軍,曹建平,肖寧,王瑩,朱曜宇,牛彥麟,薛垂召,曾祥嫚,房琦,韓帥,余晴,楊詩杰,付青,白雪飛,田添,李軍建,張夢媛,吳文婷,張山山,侯巖巖,馮宇,馬宵,李斌,李凡卡,郭衛(wèi)東,楊亞明,吳向林,金小林,張紅衛(wèi),于石成.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(01)
[4]阿里地區(qū)棘球蚴病流行現(xiàn)狀[J]. 肖丹,伍衛(wèi)平,雪蓮,貢桑曲珍,次仁拉姆,邊巴卓瑪,王棟民.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(01)
[5]西藏自治區(qū)家畜棘球蚴感染情況調(diào)查[J]. 索郎旺杰,伍衛(wèi)平,旦珍旺久,龍章佑,旦增曲珍,羅釗輝,貢桑曲珍.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(01)
[6]西藏自治區(qū)犬棘球絳蟲感染現(xiàn)狀調(diào)查與分析[J]. 康珠益西,鄭燦軍,何瑞峰,貢桑曲珍,白瑪央金,索郎旺杰,次仁拉姆,李斌.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(01)
[7]西藏自治區(qū)4種生產(chǎn)類型地區(qū)人群棘球蚴病流行情況[J]. 白瑪央金,韓帥,何瑞峰,貢桑曲珍,索郎旺杰.  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(01)
[8]棘球蚴病流行因素分析[J]. 何葉,尹家祥.  中國熱帶醫(yī)學(xué). 2017(04)

碩士論文
[1]青海省兩型棘球?qū)俳{蟲分子種系發(fā)生的研究[D]. 朱文君.青海大學(xué) 2018



本文編號：3006617