貴陽市耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥突變特征及散在分布重復(fù)單位基因分型
發(fā)布時(shí)間:2021-01-19 13:44
目的:了解貴陽地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌rpo B基因、kat G基因、inh A啟動(dòng)子和oxy R-aphc間隔區(qū)基因突變特征,為耐藥基因芯片法檢測的完善和推廣應(yīng)用提供實(shí)驗(yàn)依據(jù);應(yīng)用分枝桿菌散在重復(fù)單位分型法(Mycobacterial interspersed repetitive units,MIRU)對(duì)86株結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行分子分型,了解本地結(jié)核分枝桿菌耐多藥分子分型特征;比較MIRU12個(gè)位點(diǎn)對(duì)本地菌株進(jìn)行分子分型的分辨率。方法:1、采用羅氏培養(yǎng)法從患者痰標(biāo)本中分離培養(yǎng)結(jié)核分枝桿菌,以間接比例法檢測結(jié)核分枝桿菌臨床菌株對(duì)異煙肼、利福平的敏感性;2、提取結(jié)核分枝桿菌DNA,對(duì)31株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株(耐多藥17株,敏感株14株)的rpo B基因、kat G基因、inh A啟動(dòng)子和oxy R-aphc間隔區(qū)進(jìn)行DNA片段的PCR擴(kuò)增,并進(jìn)行測序分析;3、在Gen Bank中下載H37Rv的rpo B基因、kat G基因、inh A啟動(dòng)子和oxy R-aphc間隔區(qū)序列與氨基酸序列,采用CLC Free Workbench 4.5進(jìn)行比對(duì)分析,了解本地區(qū)耐藥相關(guān)rpo B基因、ka...
【文章來源】:貴州醫(yī)科大學(xué)貴州省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MIRU40位點(diǎn)電泳圖譜示例
圖 2-6 62 號(hào)樣本 MIRU26 位點(diǎn)序列重復(fù)次數(shù)Fig2-6. The repeat number of 62 sequence alignment in MIRU26
貴陽醫(yī)學(xué)院 2015 屆科學(xué)學(xué)位碩士研究生學(xué)位論文圖 2-6 62 號(hào)樣本 MIRU26 位點(diǎn)序列重復(fù)次數(shù)Fig2-6. The repeat number of 62 sequence alignment in MIRU26
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]衢州市耐多藥肺結(jié)核耐藥譜與治療效果[J]. 郝曉剛,方春福,連虹,張德和,余旭良. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(10)
[2]福建省長樂市80株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列基因分型研究[J]. 連健. 疾病監(jiān)測. 2014(10)
[3]四川地區(qū)北京型結(jié)核分枝桿菌的MIRU-VNTR基因分型[J]. 馮欽,景譽(yù)慶,黃正輝,段菁岳,鄭超,孫宏虎,鐘晶,孫群. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(04)
[4]VNTR位點(diǎn)對(duì)結(jié)核分枝桿菌基因分型的研究[J]. 張思潮,董正全,楊中榮. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(03)
[5]江西部分地區(qū)303株結(jié)核分枝桿菌基因分型研究[J]. 趙竟男,余琴,曾艷文,付軍,趙秀芹,萬康林. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2014(03)
[6]基因芯片和比例法藥物敏感性試驗(yàn)檢測結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平和異煙肼耐藥性的比較研究[J]. 歐維正,駱科文,王燕,秦萬,蒙俊,張廷梅. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2013(05)
[7]耐多藥結(jié)核病危險(xiǎn)因素logistic回歸分析[J]. 張玉,侯雙翼,楊成鳳,周純輝,皮琦,童葉青,王小靖,葉建君. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì). 2013(02)
[8]結(jié)核病傳播的預(yù)防[J]. 李建國. 中國藥物與臨床. 2013(04)
[9]吉林省110株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株MLVA基因分型[J]. 李卓林,王璐璐,劉日輝,陳燕芬,陳澤良,于雅琴. 吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2013(02)
[10]2433株結(jié)核分枝桿菌的耐藥性分析[J]. 陳靜,陳錚宏,張廷梅,蒙俊,王念. 貴州醫(yī)藥. 2013(03)
本文編號(hào):2987101
【文章來源】:貴州醫(yī)科大學(xué)貴州省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MIRU40位點(diǎn)電泳圖譜示例
圖 2-6 62 號(hào)樣本 MIRU26 位點(diǎn)序列重復(fù)次數(shù)Fig2-6. The repeat number of 62 sequence alignment in MIRU26
貴陽醫(yī)學(xué)院 2015 屆科學(xué)學(xué)位碩士研究生學(xué)位論文圖 2-6 62 號(hào)樣本 MIRU26 位點(diǎn)序列重復(fù)次數(shù)Fig2-6. The repeat number of 62 sequence alignment in MIRU26
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]衢州市耐多藥肺結(jié)核耐藥譜與治療效果[J]. 郝曉剛,方春福,連虹,張德和,余旭良. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(10)
[2]福建省長樂市80株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列基因分型研究[J]. 連健. 疾病監(jiān)測. 2014(10)
[3]四川地區(qū)北京型結(jié)核分枝桿菌的MIRU-VNTR基因分型[J]. 馮欽,景譽(yù)慶,黃正輝,段菁岳,鄭超,孫宏虎,鐘晶,孫群. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(04)
[4]VNTR位點(diǎn)對(duì)結(jié)核分枝桿菌基因分型的研究[J]. 張思潮,董正全,楊中榮. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(03)
[5]江西部分地區(qū)303株結(jié)核分枝桿菌基因分型研究[J]. 趙竟男,余琴,曾艷文,付軍,趙秀芹,萬康林. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2014(03)
[6]基因芯片和比例法藥物敏感性試驗(yàn)檢測結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平和異煙肼耐藥性的比較研究[J]. 歐維正,駱科文,王燕,秦萬,蒙俊,張廷梅. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2013(05)
[7]耐多藥結(jié)核病危險(xiǎn)因素logistic回歸分析[J]. 張玉,侯雙翼,楊成鳳,周純輝,皮琦,童葉青,王小靖,葉建君. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì). 2013(02)
[8]結(jié)核病傳播的預(yù)防[J]. 李建國. 中國藥物與臨床. 2013(04)
[9]吉林省110株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株MLVA基因分型[J]. 李卓林,王璐璐,劉日輝,陳燕芬,陳澤良,于雅琴. 吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2013(02)
[10]2433株結(jié)核分枝桿菌的耐藥性分析[J]. 陳靜,陳錚宏,張廷梅,蒙俊,王念. 貴州醫(yī)藥. 2013(03)
本文編號(hào):2987101
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