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疫苗候選抗原Pvs48/45在中緬邊境的遺傳多樣性特點

發(fā)布時間:2021-01-03 04:09
  目的了解間日瘧原蟲傳播阻斷疫苗候選抗原Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)的基因多態(tài)性和自然選擇特點。方法提取39例來自中緬邊境主要流行區(qū)(Laiza)的間日瘧原蟲基因組DNA,采用巢式PCR(nest-PCR)擴增Pvs48/45基因開放閱讀區(qū)(Open reading frame, ORF);通過MEGA 4.0、DnaSP v5.10和NETWORK 4.6對Pvs48/45基因多態(tài)性和自然選擇特點進行分析。結(jié)果研究發(fā)現(xiàn)了6個突變位點,均為非同義突變(E35K,H211N,K250N,D335Y,A376T,K418R),導致了5種單倍型;Pvs48/45基因的核苷酸多態(tài)性水平極低(π=0.00064),CRDⅢ區(qū)最高(π=0.00163);多種中性檢驗均表明Pvs48/45基因處于平衡選擇;種群進化分析和單倍型網(wǎng)絡圖顯示Pvs48/45具有較強的地理分化,且H2型為中緬邊境地區(qū)頻率最高的單倍型。結(jié)論 Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)遺傳多樣性很低,且在進化過程中經(jīng)歷平衡選擇,提示其可作為傳播阻斷疫苗候選靶點;Pvs48/45在全球具有較強的地理分化,應根據(jù)地區(qū)遺傳特點開發(fā)更加有效的傳播... 

【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2020年01期 北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 研究地點和樣本采集
    1.2 Pvs48/45基因組DNA提取,擴增和測序
    1.3 Pvs48/45基因序列組裝和多態(tài)性分析
    1.4 中性檢驗
    1.5 種群分化
    1.6 全球單倍型網(wǎng)絡分析
2 結(jié) 果
    2.1 Pvs48/45基因的遺傳多樣性
    2.2 Pvs48/45基因的中性檢驗
    2.3 種群分化
    2.4 單倍型網(wǎng)絡分析
3 討 論
4 展 望



本文編號:2954285

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