目的了解間日瘧原蟲(chóng)傳播阻斷疫苗候選抗原Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)的基因多態(tài)性和自然選擇特點(diǎn)。方法提取39例來(lái)自中緬邊境主要流行區(qū)（Laiza）的間日瘧原蟲(chóng)基因組DNA,采用巢式PCR（nest-PCR）擴(kuò)增Pvs48/45基因開(kāi)放閱讀區(qū)（Open reading frame, ORF）;通過(guò)MEGA 4.0、DnaSP v5.10和NETWORK 4.6對(duì)Pvs48/45基因多態(tài)性和自然選擇特點(diǎn)進(jìn)行分析。結(jié)果研究發(fā)現(xiàn)了6個(gè)突變位點(diǎn),均為非同義突變（E35K,H211N,K250N,D335Y,A376T,K418R）,導(dǎo)致了5種單倍型;Pvs48/45基因的核苷酸多態(tài)性水平極低（π=0.00064）,CRDⅢ區(qū)最高（π=0.00163）;多種中性檢驗(yàn)均表明Pvs48/45基因處于平衡選擇;種群進(jìn)化分析和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖顯示Pvs48/45具有較強(qiáng)的地理分化,且H2型為中緬邊境地區(qū)頻率最高的單倍型。結(jié)論 Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)遺傳多樣性很低,且在進(jìn)化過(guò)程中經(jīng)歷平衡選擇,提示其可作為傳播阻斷疫苗候選靶點(diǎn);Pvs48/45在全球具有較強(qiáng)的地理分化,應(yīng)根據(jù)地區(qū)遺傳特點(diǎn)開(kāi)發(fā)更加有效的傳播... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2020年01期 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 研究地點(diǎn)和樣本采集
    1.2 Pvs48/45基因組DNA提取,擴(kuò)增和測(cè)序
    1.3 Pvs48/45基因序列組裝和多態(tài)性分析
    1.4 中性檢驗(yàn)
    1.5 種群分化
    1.6 全球單倍型網(wǎng)絡(luò)分析
2 結(jié) 果
    2.1 Pvs48/45基因的遺傳多樣性
    2.2 Pvs48/45基因的中性檢驗(yàn)
    2.3 種群分化
    2.4 單倍型網(wǎng)絡(luò)分析
3 討 論
4 展 望



本文編號(hào)：2954285