目的以自發(fā)突變導(dǎo)致的先天性晚發(fā)白內(nèi)障小鼠為模型,進(jìn)行遺傳方式鑒定和白內(nèi)障相關(guān)基因定位分析。方法首先通過顯微鏡觀察組織切片鑒定白內(nèi)障病理狀態(tài),其次通過構(gòu)建家系確定先天性晚發(fā)白內(nèi)障在FVB小鼠中的遺傳方式,其次利用多重PCR靶向測序進(jìn)行100只F2代小鼠的全基因組SNP掃描定位,最后利用全外顯子測序篩選出候選突變基因。結(jié)果組織切片表明自發(fā)突變引起為典型白內(nèi)障性狀,全基因組掃描定位顯示11號染色體上的rs4228772 SNP位點(diǎn)與白內(nèi)障表型連鎖程度最高;全外顯子測序結(jié)果進(jìn)一步表明11號染色體上有三個(gè)基因產(chǎn)生了自發(fā)突變,分別是Sfi1,Obscn和Ptrh2。結(jié)論本研究使用全基因組SNP掃描連鎖分析與外顯子測序相結(jié)合的策略,可在已知參考基因組的物種中快速定位基因突變,結(jié)果確定了11號染色體上的三個(gè)突變基因?yàn)橄忍煨酝戆l(fā)型白內(nèi)障的候選基因,并以顯性方式遺傳。該策略亦可應(yīng)用于其它遺傳背景清晰的模式哺乳動(dòng)物的基因功能研究。 

【文章來源】：中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2020年01期 北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

各染色體上SNP位點(diǎn)FVB純合子所占比例

候選SNP及Indel染色體分布圖

圖3中展示了這些變異位點(diǎn)在染色體上的分布，并結(jié)合2.2中全基因組SNP掃描的結(jié)果，標(biāo)記了11號染色體上的3個(gè)候選突變基因(Sfi1,Obscn,Ptrh2)。根據(jù)基因注釋結(jié)果，Ptrh2基因在86689778位置上發(fā)生C→T的無義突變(stop-gain)，使得基因在該位置提前產(chǎn)生終止密碼子;Sfi1基因在3134337位置上發(fā)生G→A的錯(cuò)義突變(missense);Obscn基因在59054628位置上發(fā)生C→CA的移碼突變(frameshift insertion)。圖2 各染色體上SNP位點(diǎn)FVB純合子所占比例


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